DNA的酶切連接轉(zhuǎn)化和重組子的篩選與鑒定_第1頁
DNA的酶切連接轉(zhuǎn)化和重組子的篩選與鑒定_第2頁
DNA的酶切連接轉(zhuǎn)化和重組子的篩選與鑒定_第3頁
DNA的酶切連接轉(zhuǎn)化和重組子的篩選與鑒定_第4頁
DNA的酶切連接轉(zhuǎn)化和重組子的篩選與鑒定_第5頁
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文檔簡介

1、第二次分子生物學(xué)實驗報告dnA勺酶切、連接、轉(zhuǎn)化和重組子的篩選與鑒定一 實驗?zāi)康? 學(xué)習(xí)和掌握限制性內(nèi)切酶的分類特性與作用原理,掌握載體和外源目的DNA1切的操作技術(shù)。2、學(xué)習(xí)利用T4 DNA連接酶把酶切后的載體片段和外源目的 DNA片段連接起來,構(gòu)建體外重組 DNA分子的技術(shù),了解 并掌握幾種常用的連接方法。3 掌握利用CaCl2 制備感受態(tài)細胞的方法;學(xué)習(xí)和掌握熱擊法轉(zhuǎn)化 E. coli 的原理與方法。4、學(xué)習(xí)并掌握使用紅白菌落法篩選獲得重組子以及a互補篩選法的原理及方法。5 學(xué)習(xí)和掌握使用試劑盒抽提質(zhì)粒的方法;6 復(fù)習(xí)瓊脂糖凝膠電泳的原理和方法;7、通過對重組子進行重組質(zhì)粒 DNA的抽提

2、與酶切鑒定,進一 步確定重組質(zhì)粒中含有外源目的DNA片段,并驗證重組子是期望的重組子。實驗原理1、限制性內(nèi)切酶限制性核酸內(nèi)切酶是一類能夠識別雙鏈DNA分子中的某種特定核甘酸序列,并由此切割 DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的酶,主要是從原核 生物中分離純化出來的。在限制性核酸內(nèi)切限制酶的作用下,侵入細菌的“外源” DNA分子便會被切割成不同大小的片段,而細 菌自己固有的DNA由于修飾酶(通常是一種甲基化酶)的保護作 用,則可免受限制酶的降解。目前已經(jīng)鑒定出3種不同類型的限制性核酸內(nèi)切酶,即I型 酶、 II 型酶和 III 型酶。I型酶切割位點是隨機的,至少距識別位點 1000bp。田型限 制酶的切割位點距識別序

3、列 3'端為2426bp。II型限制酶的切 割位點一般在識別序列上或與之靠近,而且具有序列特異性,故在基因克隆中有特別廣泛的用途。II型核酸內(nèi)切限制酶具有 3個基本的特性:在 DNA分子雙 鏈的特異性識別序列部位切割 DNA分子,產(chǎn)生鏈的斷裂;2個 單鏈斷裂部位在DNA分子上的分布通常不是彼此直接相對的; 斷裂結(jié)果形成的DNA片段往往具有互補的單鏈延伸末端。限制性核酸內(nèi)切酶對DNA底物的酶切作用是否完全,直接關(guān)系到連接反應(yīng)、重組體分子的篩選和鑒定等實驗結(jié)果。核酸內(nèi)切限制酶活性的充分發(fā)揮受到以下幾個因素的影響:1)DNA羊品的純度,可采取措施有純化 DNA加大酶的用量、延長酶催化反應(yīng)的保

4、溫時間,擴大反應(yīng)體積;2) DNA的甲基化程度,基因工程中必須使用甲基化酶失活突變的菌株;3)酶切消化反應(yīng)的溫度;4) DNA的分子結(jié)構(gòu);5)限制性核酸內(nèi)切酶的緩沖液。限制核酸內(nèi)切酶是分子克隆中最常用的工具酶,在DNA1組技術(shù)中限制性核酸內(nèi)切酶主要用在一下幾方面:構(gòu)建重組質(zhì)粒;構(gòu)建基因文庫;DNA分子的雜交;制備DNA放射性探針;繪制DNA分子的限制酶圖譜DNA序列分析;基因定位及 DNA同源性研究。2、限制性內(nèi)切酶的酶切反應(yīng)體外構(gòu)建重組DNA分子,首先要了解目的基因的酶切圖譜,選用的限制性核酸內(nèi)切酶都不能在目的基因內(nèi)部有專一的識別位點,即當(dāng)用一種或者兩種限制性核酸內(nèi)切酶切割外源供體DNA時,

5、能夠得到完整的目的基因。其次,選擇具有相應(yīng)的單一酶切位點的質(zhì)粒、噬菌體等載體分子作為克隆的載體。常用的酶切方法有雙酶切法和單酶切法兩種。(1)雙酶切法:如果只在要克隆的目的 DNA二端具有不同的限制性核酸內(nèi)切酶的識別位點,而目的基因內(nèi)部沒有相應(yīng)的識別序列,可用這二種限制性核酸內(nèi)切酶酶切,則目的DNAM產(chǎn)生二種不同的黏性末端。選擇同樣具有這二種限制性核酸內(nèi)切酶識別位點的合適載體,酶切后,同樣產(chǎn)生二個不同的黏性末端,當(dāng)構(gòu)建重組分子時,目的 DNA可以一定的方向插入載體中,這樣操作效率高,也利于重組子的篩選。(2)單酶切法:如果目的DNA片段只能用一種限制性核酸內(nèi)切酶切割,酶切后的片段兩端產(chǎn)生相同的

6、粘性末端或者平末端。選擇具有同樣限制性核酸內(nèi)切酶識別位點的合適載體,在構(gòu)建重組分子時,除了形成正常的重組子之外,還可能會出現(xiàn)目的DNA片段以相反方向插入載體分子中,或者目的DNA串聯(lián)后再插入載體分子中,甚至出現(xiàn)載體分子自連,重新環(huán)化的現(xiàn)象,因此重組效率較低。如果沒有很好的方法區(qū)分轉(zhuǎn)化子中的重組子,篩選重組子會比用雙酶切法構(gòu)建重組 DNA分子的工作量大很多。單酶切法和雙酶切法各有優(yōu)缺點,在實際操作時要根據(jù)具體情況來定。3、DNAiI接酶DNA連接酶能催化雙鏈DNA片段緊靠在一起的3羥基末端 與 5' 磷酸基團末端之間形成磷酸二酯鍵,使兩末端連接。目前用于連接DNA片段的DNA連接酶有E.

7、 coli DNA 連接酶和T4 DNA連接酶。E. coli DNA 連接酶只能催化雙鏈 DNA片段互補 黏性末端之間的連接,不能催化雙鏈DNA片段平末端之間的連接。T4DNA連接酶既可用于雙鏈 DNA片段互補黏性末端之間的 連接,也能催化雙鏈 DNA片段平末端之間的連接,但平末端之 間連接的效率比較低。DNA連接酶同限制性核酸內(nèi)切酶一樣,都是在體外構(gòu)建重組 DNA分子所必不可少的基本工具酶。限制性核酸內(nèi)切酶可以將 DNA分子切割成不同大小的片段,然而要將不同來源的DNA片段組成新的雜交DNA分子,還必須將它們彼此連接起來。目前 有3種體外連接DNA片段的方法:用DNA連接酶連接具有互 補黏

8、性末端的DNA片段;用T4 DNA連接酶直接將平末端的 DNA片段連接起來,或是用末端脫氧核甘酸轉(zhuǎn)移酶給具平末端的 DNA片poly(dA)-poly(dT) 尾之后,再用 DNA連接酶連接起來; 先在DNA片段末端加上化學(xué)合成的銜接物或接頭,使之形成 黏性末端,再用DNA連接酶連接起來。這3種方法雖然互有差 異,但共同的一點都是利用 DNA連接酶所具有的連接和封閉單 鏈DNA的功能。4、載體與外源DNA勺連接反應(yīng)外源DNA片段與載體分子的連接,即DNA分子體外重組,主 要依賴于DNA連接酶來完成。DNA連接酶催化兩雙鏈DNA片段 相鄰的5 - 磷酸和3 - 羥基間形成磷酸二酯鍵。在分子克隆中

9、最有用的DNA連接酶是來自T4噬菌體的DNA連接酶:T4 DNA連 接酶,該酶需要ATP作為輔助因子。目的DNA片段與載體DNA片 段之間的連接方式主要有以下幾種:( 1)互補粘性末端片段之間的連接當(dāng)載體和外源DNA用同一種限制性內(nèi)切酶切割時,產(chǎn)生相同的粘性末端,連接后仍保留原限制性內(nèi)切酶的識別序列;如果用兩種能夠產(chǎn)生相同的粘性末端的限制酶(同尾酶)切割時,雖然可以有效地進行連接,但是獲得的重組DNA分子消失了原來用于切割的那兩種限制性核酸內(nèi)切酶的識別序列,這樣不利于從重組子上完整地將插入片段重新切割下來。定向克?。焊鶕?jù)核酸內(nèi)切限制酶的性質(zhì),用兩種不同的限制酶同時消化一種特定的DNA分子,將會

10、產(chǎn)生出具有兩種不同粘性末端的DNA片段。十分明顯,如果載體分子和待克隆的 DNA分子都是用同一對核酸內(nèi)切酶切割,然后混合起來,那么載體分子和外源DNA片段將按一種取向退火形成重組 DNA分子?;パa粘性末端連接方案中還有一個問題:片段的多拷貝插入。當(dāng)需要表達蛋白質(zhì)產(chǎn)物時,多拷貝的插入,在沒有拼連剪切信號的情況下,將會導(dǎo)致表達困難或紊亂。所以需要用內(nèi)切酶圖譜對單拷貝插入片段進行鑒定和篩選。適當(dāng)?shù)牟迦肫闻c載體分子比率能減少多拷貝插入片段的形成,一般比例為2:1 (插入片段摩爾數(shù) : 載體摩爾數(shù))。( 2) 平末端及非互補黏性末端片段之間的連接載體分子和外源DNA插入片段并不一定總能產(chǎn)生出互補的粘性

11、末端。實際上有許多情況都是例外的,因為有些限制酶切割DNA分子之后所形成的都是平末端的片段; 有的實驗要用兩種不 同的限制酶分別切割載體分子和外源 DNA形成的也多半是非互 補的粘性末端或平末端;再如用機械切割法制備的 DNA片段, PCR擴增的和化學(xué)合成的 DNA片段或由RNA為模板反轉(zhuǎn)錄合成 的cDNA片段,也不會具有互補的粘性末端。既然在一定反應(yīng)條件下,用T4 DNA 連接酶可以將平末端的DNA片段有效地連接起來,那么對于上面提到的非互補粘性末端 的兩種DNA片段之間,經(jīng)過專門作用于單鏈 DNA的S1核酸酶 處理變成平末端或用大腸桿菌 DNA聚合酶I的Klenow片段填 補后變成平末端,

12、一樣也可以使用 T4 DNA連接酶進行有效地連 接。不過,平末端 DNA片段間的連接作用不僅在效率上明顯地低于粘性末端間的連接作用,而且重組之后一般不能從原位刪除下來。影響DNAS接的因素有溫度、時間、酶量、緩沖體系、DNA末端的性質(zhì)及濃度、DNAJ斷的大小等。溫度,理論上最佳溫度是37,此時酶的活性最高,但37時粘性末端分子形成的氫鍵配對極不穩(wěn)定,因此我們選擇在1216進行連接。時間,在最適溫度下,一般粘性末端連接30min 即可取得較好的效果,連接60min 則更完全些,為了實驗方便有時也在4下連接過夜。而對于平末端建議在4下連接,并且時間適當(dāng)延長。更為普遍的條件是:16 連接過夜酶單位(

13、Takara)在20ml的連接反應(yīng)體系中,6mg的 入 DNAHind田的分解產(chǎn)物在16c下fanying30 分鐘時,有90% 上的DNA>t段進行連接的酶量為1U。酶量,連接實驗中 DNA勺 濃度比酶量定義狀態(tài)下低很多倍,所以酶是過量的。Takara 的T4-DNA連接酶濃度是 350U/ml。緩沖體系(buffer ), Tris-HCl 提供連接所需的合適的ph值,DTT提供還原力,ATP促進連接反應(yīng)的有效進行。DNA<度,連接反應(yīng)中 DNA勺濃度一般為0.11pmol/ml。具 中載體濃度過高會增加載體間分子的環(huán)化,而過低則獲得重組分子的效率低,甚至導(dǎo)致載體分子的自身環(huán)化

14、, 外源DNAW依據(jù)連接類型的不同加入載體濃度的110 倍。5、感受態(tài)細胞的制備與質(zhì)粒轉(zhuǎn)化體外連接的DNA重組分子導(dǎo)入合適的受體細胞才能大量地進行復(fù)制、增殖和表達,將外源重組體分子導(dǎo)入受體細胞的途徑,包括轉(zhuǎn)化(或轉(zhuǎn)染)、轉(zhuǎn)導(dǎo)、顯微注射和電穿孔等多種不同的方式。重組質(zhì)粒DNA分子通過與膜蛋白結(jié)合進入受體細胞,并在受體細胞內(nèi)穩(wěn)定維持和表達的過程稱之為轉(zhuǎn)化( transformation ) 。 細菌轉(zhuǎn)化的本質(zhì)是受體菌直接吸收來自供體菌的游離DNA片段,即轉(zhuǎn)化因子,并在細胞中通過遺傳交換將之組合到自身的基因組中,從而獲得供體菌的相應(yīng)遺傳性狀的過程。大腸桿菌是一種革蘭氏陰性菌,自然條件下很難進行轉(zhuǎn)化,

15、其主要原因是轉(zhuǎn)化因子的吸收較為困難,尤其是那些與其親緣關(guān)系較遠的DNA分子更是如此。通常的做法是采用人工的方法制備感受態(tài)細胞,然后進行轉(zhuǎn)化處理,其中代表方法之一是CaCl2誘導(dǎo)的大腸桿菌轉(zhuǎn)化法。感受態(tài)是指宿主細胞最容易接受外源DNAt段并實現(xiàn)轉(zhuǎn)化的一種生理狀態(tài),由受體菌的遺傳性狀決定,同時也受菌齡和環(huán)境因子的影響。感受態(tài)的細胞一般出現(xiàn)在對數(shù)生長期。重組DNA轉(zhuǎn)化細菌的技術(shù)操作關(guān)鍵就是通過化學(xué)方法,人工 誘導(dǎo)細菌細胞進入一個敏感的感受態(tài),以便外源DNA進入細菌內(nèi)。 CaCl2 誘導(dǎo)的大腸桿菌轉(zhuǎn)化的原理是將處于對數(shù)生長期的細 菌置于0,CaCl2 低滲溶液中,細菌細胞膨脹成球形,同時鈣離子使細胞膜

16、磷脂層形成液晶結(jié)構(gòu),使得位于外膜與內(nèi)膜間隙中的部分核酸酶離開所在區(qū)域,這就構(gòu)成了大腸桿菌人工誘導(dǎo)的感受態(tài)。此時加入DNA鈣離子又與DNA結(jié)合形成抗脫氧核糖核酸 酶(Dnase)的羥基-磷酸鈣復(fù)合物,并粘附在細菌細胞膜的外表 面上。經(jīng)短暫的42熱脈沖處理后,細菌細胞膜的液晶結(jié)構(gòu)發(fā)生劇烈擾動,隨之出現(xiàn)許多間隙,致使通透性增加,DNA分子便趁機進入細胞內(nèi)。影響感受態(tài)細胞制備及轉(zhuǎn)化的因素有細胞的狀態(tài)、DNA勺質(zhì)量和濃度、試劑的純度等。( 1)細胞的生長狀態(tài)和密度:從甘油管中新鮮活化而不是多次轉(zhuǎn)接的菌;培養(yǎng)至指數(shù)前期到指數(shù)期;應(yīng)為限制- 修飾系統(tǒng)缺陷菌株;感受細胞和所轉(zhuǎn)化的載體性質(zhì)應(yīng)匹配。(2)質(zhì)粒DN

17、A勺質(zhì)量和濃度:超螺旋構(gòu)想的質(zhì)粒 DNA較其 線性構(gòu)想的轉(zhuǎn)化率高10100倍;加入DNA勺體積不應(yīng)超過感受 態(tài)細胞的5% 1ng的cccDNA即可使50皿 的感受態(tài)細胞達到飽 和;對于同一類型的載體而言,分子量越大轉(zhuǎn)化率越低。( 3)其他藥品、試劑質(zhì)量:氯化鈣應(yīng)用高純度藥品、超純水 配制,過濾除菌、分裝保存;所有試劑、容器、耗材等均需無菌 處理;感受態(tài)細胞制備過程均需無菌、冰浴操作。5、 a互補利用B-半乳糖甘酶篩選系統(tǒng),跟據(jù)菌落顏色篩選含有重組質(zhì) 粒的轉(zhuǎn)化子。載體上插入了 B-半乳糖音酶的調(diào)控序列和 B-半乳 糖甘酶N端146個氨基酸的編碼序列,而其對應(yīng)的宿主菌染色體 上整合有B-半乳糖音酶

18、C端序列的遺傳信息。當(dāng)質(zhì)粒載體導(dǎo)入 相應(yīng)宿主菌后,通過a互補作用,形成完整的B-半乳糖甘酶。 在加有氨芾青霉素的麥康凱培養(yǎng)基平板上,不含質(zhì)粒PUC19的E. coli DH5 民無法生長;含有質(zhì)粒 pUC19的E. coli DH5 民利 用B -半乳糖甘酶分解培養(yǎng)基中的乳糖產(chǎn)生有機酸,pH降低,培養(yǎng)基中的指示劑變紅,菌落變?yōu)榧t色;含有重組質(zhì)粒的E. coliDH5a具有氨芾青霉素抗性可以生長,但質(zhì)粒pUC19中有外源基因插入到多克隆位點,使 B-半乳糖甘酶N端的基因不能表達, 無法實現(xiàn)a互補作用,所以其菌落為白色。利用這種篩選方法 可方便地將含目的基因的重組子篩選出來。6、 重組質(zhì)粒的鑒定重

19、組質(zhì)粒是外源基因通過單酶切(或雙酶切)與用相同的(或二種)限制性核酸內(nèi)切酶切割的質(zhì)粒載體理解后獲得的,因此在連接處仍保留原限制性核酸內(nèi)切酶的識別序列,用該酶 (或二種酶)再次切割重組質(zhì)粒,能把插入片段切離載體,根據(jù)瓊脂糖凝膠電泳檢測可見有載體片段和插入的外源DN明段,并可知插入片段的大小。7、麥康凱培養(yǎng)基蛋白胨、胨提供碳氮源、維生素和生長因子;牛膽鹽和結(jié)晶紫可抑制革蘭氏陽性菌的生長;氯化鈉維持均衡的滲透壓;瓊脂是培養(yǎng)基的凝固劑;乳糖為可發(fā)酵的糖類;中性紅是pH 指示劑,細菌發(fā)酵乳糖產(chǎn)酸時菌落呈粉紅色并在菌落周圍出現(xiàn)膽鹽沉淀 的渾濁圈。三、主要儀器和實驗試劑1、儀器與材料LB培養(yǎng)基,NaOH&#

20、167;液,氨芾青霉素母液(20mg/mD ,無水 乙醇,超純水,限制性核酸內(nèi)切酶 Hindm及其相應(yīng)的Buffer , T4-DNA連接酶及其 Buffer ,麥康凱培養(yǎng)基,100mmol/L CaCl2 溶液,Omeg頡粒抽提試劑盒,瓊脂糖,TAE電泳緩沖液(50X), 上樣緩沖液(10X),澳化乙錠(EB)。2、實驗試劑恒溫振蕩培養(yǎng)箱,高速冷凍離心機,漩渦振蕩器,恒溫水浴 鍋,Eppendorf管,微量移液器,培養(yǎng)皿,三角瓶,酒精燈,量 筒,牛皮紙,接種環(huán),涂布器,電子天平,微波爐,電泳儀,制 膠槽,電泳槽,凝膠成像檢測儀,瓊脂糖凝膠梳子,手套。3、實驗材料E.coli DH5 民(pU

21、C19 ; pUC19質(zhì)粒;入 DNA四、實驗步驟1、酶切在無菌Ep管中按ddH2。buffe、DNA限制性內(nèi)切酶的順序 依次加入酶切反應(yīng)的各種成分(各組分的量見Figure 1 ),混勻,4000rpm離心1min,將液體集中于管底。37J 12小時,在-20 C冰箱保存。酶切產(chǎn)物電泳檢測酶切效率,各小組向EP觀眾加8 6上周得到的酶切反應(yīng)液,弁加 2 l Loading buffer 。體系組成自己提取的n商品入田商品序號pUC19DNApUC191ddH2O (ul )13.070.064.0210*Buffer(ul)2.010.08.03DNA(ul )4.015.04.04Hind

22、 in(5M/ul)1.05.04.0總計(ul)20.0100.080.0Figure 1 pUC19 質(zhì)粒及入DNA酶切反應(yīng)體系2、連接(1)在無菌Ep管中依次加入連接反應(yīng)的各種成分 (見Figure2),混勻;(2) 4000tpm離線1min,集液于管底;(3)在16 c的恒溫水浴鍋中反應(yīng)過夜。組ddH2 10*Liga pUC19DNA/Hi 入T4-DNA連 合Bufferdm (30U/ul)含 3.21.02.03.00.810.量0(ulFigure 2 連接反應(yīng)體系3、感受態(tài)細胞的制備(1)倒LB平板,劃線活化 E. coli DH5a。(2)從LB平板上挑取E. coli

23、 DH5 a單菌落至5mL LB液體培 養(yǎng)基里,37 c振蕩培養(yǎng)過夜。(3)以1%勺接種量將過夜培養(yǎng)的 E. coli DH5民接種于20mL 新鮮LB液體培養(yǎng)基,220rpm培養(yǎng)2-2.5h 。(4)將菌液之于冰浴中。(5)分別取1.5mL菌液于2個無菌的1.5mL Ep管中,4000rpm 離心5min,棄上清液,收集菌體。(6)每支離心管中加入用冰預(yù)冷的 800 H l 0.1mol/LCaCl 2,輕 輕懸浮細胞,冰上放置 10min, 4000rpm離心5min。(7)棄上清液,加入100 LCaCl2溶液,輕輕懸浮細胞,冰 上放置20min,即為感受態(tài)細胞,分裝至 50H l/管。

24、4、轉(zhuǎn)化步 1234567驟感受 DNA 冰浴熱擊冰復(fù)蘇培養(yǎng)基涂平板態(tài)細100連接 10mi 90s 5m LB:含amp麥康凱培II - 50昭八、m- 505.0in 0.9ml/養(yǎng)基,50 1*2、管,0.5-1hpUC19 10mi 90s 5m LB:1.0 nin 0.9ml/管,0.5-1h10mi 90s 5m LB:in 0.9ml/管,0.5-1h100 1*2、1501*2、200U1*1*2含amp麥康凱培養(yǎng)基,50 1*1含amp麥康凱培養(yǎng)基,50 1*1 ;麥康凱培養(yǎng)基,50 1*1昭八、Figure 3 重組質(zhì)粒及轉(zhuǎn)化對照表平板至置于操作臺上10分鐘后,導(dǎo)致于37

25、c溫箱中培養(yǎng)1620h。5、轉(zhuǎn)化子和重組質(zhì)粒的篩選(1)轉(zhuǎn)化后的細胞在含有氨芾青霉素的LB培養(yǎng)基上為白色菌落,選取六個白色菌落在另一 LB培養(yǎng)基上劃線,過夜培養(yǎng)。(2)六個菌落中選取三個轉(zhuǎn)接到3mL含氨芾青霉素的LB培養(yǎng)基中,37振蕩培養(yǎng)過夜。6、重組質(zhì)粒的驗證( 1)取菌液3.0mL 用試劑盒提取質(zhì)粒。A.將帶有重組質(zhì)粒的菌體接種 5ml于含amp白LB培養(yǎng)基上, 37搖床過夜;B.取15ml菌液,室溫下10000rpm離心1min收集菌體;C.棄培養(yǎng)基,加入 250mi l solutionI/RNaseA混合液,渦旋震蕩使細胞完全懸浮;D.往混合液中加入250“solution n,輕輕

26、顛倒混勻,裂解時間不要超過5min;E.加入350 “solution m,溫和顛倒數(shù)次至形成白色絮狀沉淀;F.室溫,10000rpm 離心 10min;G. 轉(zhuǎn)移上清液到套有2ml 收集管的HiBind DNA 結(jié)合柱中,室溫下,10000rpm離心1min,倒去濾液;H.柱子重新裝回收集管,加 500皿HBBuffer ,按上述條件 離心,棄去濾液;( 1) 新裝回收集管,力口 700 WDNA Wash Buffer ,按上 述條件離心,棄去濾液;J.柱子重新裝回收集管,10000rpm離心空柱2min;K.把柱子裝在干凈的 Ep管上,加入50"Elution Buffer到柱

27、子基質(zhì)中,10000rpm 離心 1min 洗脫出DNA。( 2) 對有外源基因插入的質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶切割,進行進一步鑒定。( 3) 37保溫0.5 1h。(4)利用空載體pUC19片段和目的基因片段為對照,對沒切后的重組質(zhì)粒的片段進行瓊脂糖凝膠電泳,從酶切后片段的數(shù)目及大小上進行確認。處理:2 11 l ddH2O , 2 l 質(zhì)粒,1 l loading buffer ,輕 彈 / 用槍吹吸混勻,快速離心集液于管底。五、結(jié)果分析1、酶切結(jié)果電泳檢驗泳道1234561樣品kH II1DNAVH LTesi Jpuciv(HA)pus見商品IU1WH1 UI19 LEI祥量(nJ)5JOO

28、ng5。JOQ ng5.010.0IDJI作用M對照T對照對照T(l)TFigure 4酶切檢驗上樣順序在電泳圖中,我們第9小組的酶切產(chǎn)物在第14泳道,主要的 亮帶有兩條。先從位置上看,較近的一條和第5泳道的pUC19商 品)/ Hindm對齊,說明是這條帶是切開的質(zhì)粒,是線性 DNA 較遠的一條帶和第4泳道的亮帶對齊,說明這條帶是未被切開的 質(zhì)粒,是環(huán)狀DNA環(huán)狀DNA電泳速率比線性 DN秋,這也驗證 了 “近處條帶是酶切成功的質(zhì)粒,遠處條帶是未切開的質(zhì)?!钡?說法。再從亮度上看,酶切開的質(zhì)粒的條帶亮度遠遠亮于未酶切 開的質(zhì)粒,相比其他組,我們組酶切效果是比較好;但相比商品 化質(zhì)粒的酶切效,

29、我們小組的效果不是很好。在第6條帶以后的條帶的遠處都有寬而暗的模糊條帶,而在 商品化pUC19的泳道里,沒有,這應(yīng)該是未分離干凈的RNA點樣槽處亮帶可能是附著蛋白質(zhì)的 DN*段、染色體片段等。123 A 56/ S 3 1U 11 1? 13 14 15 16 W l»Figure 5質(zhì)粒酶切電泳結(jié)果(我們小組的是第14泳道的,第4泳道是未酶切的pUC19第5泳道是酶切的商品化質(zhì)粒, 第1、3泳道為酶切的入DNA)2、轉(zhuǎn)化結(jié)果觀察與分析實驗設(shè)組培養(yǎng)基涂布平板培養(yǎng)結(jié)果I -試驗組含amp的麥康凱培 養(yǎng)基50 *2平均每個平板17個菌落,其中2個白斑100*2平均每個平板40個菌落,其中

30、3個白斑150*2平均每個平板65個菌落,其中5個白斑200 *2平均每個平板100個菌落n -轉(zhuǎn)化對照含amp的麥康凱培 養(yǎng)基50廠1多于100個菌落,均為紅斑m-細胞對照含amp的麥康凱培 養(yǎng)基50廠1沒后菌落不含amp的麥康凱培養(yǎng)基50廠1菌落數(shù)跡逃大于100個,培養(yǎng)基笠為橘黃色Figure 6 轉(zhuǎn)化實驗結(jié)果及分析氨芾青霉素(amp用于篩選轉(zhuǎn)化進質(zhì)粒 pUC19的大腸桿菌。 細胞對照組中的大腸桿菌沒有轉(zhuǎn)入 pUC19而氨芾青霉素抗性存 在于pUC19上,所以細胞對口組無法在含 amp的培養(yǎng)基上生長, 但能在不含amp的培養(yǎng)基上生長。在麥康凱培養(yǎng)基上,菌落有紅斑和白斑兩種,紅斑是轉(zhuǎn)入空 載體的,白斑是轉(zhuǎn)入重組質(zhì)粒的,這是由于a互補原理。pUC19載體上插入了 B-半乳糖音酶的調(diào)控序列和

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