DB22-T2052-2014-飼料中沙門氏菌測(cè)定實(shí)時(shí)熒光PCR方法-吉林省

ICS07.100.30B20DB22備案號(hào)：吉林省地方標(biāo)準(zhǔn)DB22/T2052—2014飼料中沙門氏菌測(cè)定實(shí)時(shí)熒光PCR方法DeterminationofsalmonellainfeedstuffsReal-timePCRmethod吉林省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布DB22/T2052—2014前言本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2001給出的規(guī)則起草。本標(biāo)準(zhǔn)由吉林省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局提出并歸口。本標(biāo)準(zhǔn)主要起草單位：吉林省產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)院、國(guó)家農(nóng)業(yè)深加工產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)中心、中華人民共和國(guó)吉林出入境檢驗(yàn)檢疫局。本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人：史艷宇、劉金華、王偉、劉曉暉、趙立群、侯宇、柴竹林、張濤。IDB22/T2052—2014飼料中沙門氏菌測(cè)定實(shí)時(shí)熒光PCR方法1范圍本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了飼料中沙門氏菌的實(shí)時(shí)熒光PCR檢驗(yàn)方法。本標(biāo)準(zhǔn)適用于飼料中沙門氏菌的快速篩選檢測(cè)。2規(guī)范性引用文件下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，僅所注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改單）適用于本文件。GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法GB/T13091飼料中沙門氏菌的檢驗(yàn)方法GB/T27403實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)3術(shù)語(yǔ)和定義下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。實(shí)時(shí)熒光PCRreal-timefluorescentPCR實(shí)時(shí)熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。Ct值cyclethresholdvalue對(duì)樣品的增菌培養(yǎng)物進(jìn)行DNA提取，通過(guò)實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增，觀察實(shí)時(shí)熒光PCR的增幅曲線，從而對(duì)飼料中的沙門氏菌進(jìn)行快速檢測(cè)。除特別說(shuō)明以外，所有試劑均為分析純，水為按照GB/T6682規(guī)定的一級(jí)水。所有試劑均用無(wú)DNA酶污染的容器分裝。a)上游引物：5’-GTGAAATAATCGCCACGTCGGGCAA-3’b)下游引物：5’-TCATCGCACCGTCAAAGGAACC-3’1DB22/T2052—2014c)探針：5’-FAM-TTATTGGCGATAGCCTGGCGGTGGGTTTTGTTG–TAMRA-3’5.2TaqDNA聚合酶。5.3dNTP：dATP（deoxyadenosinetriphosphate，脫氧腺苷三磷酸）、dGTP（deoxycytidinetriphosphate，脫氧鳥(niǎo)苷三磷酸）、dCTP（deoxycytidinetriphosphate，脫氧胞苷三磷酸）、dTTP（deoxythymidinetriphosphate，脫氧胸苷三磷酸）。5.4細(xì)菌基因組DNA提取純化試劑盒。5.510×PCR緩沖液：含200mmol/LTris-HCl（pH8.4），200mmol/L氯化鉀（KCl），15mmol/L氯化鎂（MgCl2）。5.6緩沖蛋白胨水（BPW）：按GB/T13091中附錄規(guī)定。5.7沙門氏菌質(zhì)控菌株：來(lái)源于正規(guī)菌種保藏機(jī)構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn)菌株。如CGMCC1.1859、CGMCC1.1194等。6設(shè)備和材料6.1實(shí)時(shí)熒光PCR儀。6.2生物安全柜：AII型。6.3恒溫培養(yǎng)箱。6.4離心機(jī)：轉(zhuǎn)速≥12000r/min。6.5核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計(jì)。6.6高壓滅菌器。6.8天平：感量0.1g。7檢測(cè)步驟取BPW增菌液1mL于1.5mL無(wú)菌離心管中，12000r/min離心5min，盡量吸棄上清液，使用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒并按其說(shuō)明提取制備模板DNA。提取的DNA溶液可于-20℃保存。DNA提取和純化過(guò)程應(yīng)用無(wú)菌水作為核酸提取空白對(duì)照。取10μLDNA溶液加蒸餾水稀釋至1mL，使用核酸蛋白儀或紫外分光光度計(jì)分別檢測(cè)260nm和280nm處的吸光值。DNA的濃度按照式（1）計(jì)算，當(dāng)A260/A280比值在1.5~2.1之間時(shí)，適宜于PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增前將所有樣品DNA調(diào)至10ng/μL~50ng/μL。2DB22/T2052—2014c=A′N′501000.............................................................................................(1)式中：c——DNA濃度，單位為納克每微升（ng/μL）；A——260nm處的吸光值；N——核酸稀釋倍數(shù)。7.4實(shí)時(shí)熒光PCR檢驗(yàn)7.4.1實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)體系10×PCR緩沖液2.5μL、引物對(duì)（10μmol/L）各1μL、探針（10μmol/L）1μL、dNTP（10mmol/L）1μL、TaqDNA聚合酶（5U/μL）0.5μL、模板DNA2μL、用滅菌去離子水補(bǔ)足體積至25μL。7.4.2實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)條件94℃預(yù)變性2min，94℃變性20s，64℃退火延伸1min，同時(shí)收集FAM熒光，共進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。反應(yīng)產(chǎn)物可在4℃保存。不同儀器、不同TaqDNA聚合酶可根據(jù)要求將反應(yīng)條件做適當(dāng)調(diào)整。檢驗(yàn)過(guò)程中分別設(shè)空白對(duì)照、陰性對(duì)照、陽(yáng)性對(duì)照?？瞻讓?duì)照設(shè)為以無(wú)菌水代替DNA模板；陰性對(duì)照采用非沙門氏菌的DNA作為實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)的模板；陽(yáng)性對(duì)照采用沙門氏菌DNA作為實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)的模板?！瞻讓?duì)照：無(wú)擴(kuò)增曲線，Ct值≥40.0；——陰性對(duì)照：無(wú)擴(kuò)增曲線，Ct值≥40.0；——陽(yáng)性對(duì)照：出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線，Ct值應(yīng)≤35.0；否則，視為無(wú)效。——Ct值≤35.0，可判定該樣品實(shí)時(shí)熒光PCR結(jié)果為陽(yáng)性，按GB/T13091進(jìn)行確證?！?5.0＜Ct值＜40.0，此時(shí)應(yīng)適當(dāng)增加DNA模板量重做實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)。重做結(jié)果Ct值≥40.0者為陰性，否則實(shí)時(shí)熒光PCR結(jié)果為陽(yáng)性，按GB/T13091進(jìn)行確證。3DB22/T2052—2014為了保護(hù)實(shí)驗(yàn)室人員的安全，應(yīng)由具備資格的工作人員檢測(cè)沙門氏菌，所有培養(yǎng)物和廢棄物應(yīng)小心處置，并按GB/T27403中的有關(guān)