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文檔簡(jiǎn)介

1、Shanghai Jiao Tong University交流的主要內(nèi)容交流的主要內(nèi)容全球轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物種植情況國(guó)際、國(guó)內(nèi)轉(zhuǎn)基因生物安全管理轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)技術(shù)核酸DNA提取SGS GMO檢測(cè)報(bào)告解讀Shanghai Jiao Tong University全球轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物種植情況全球轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物種植情況Shanghai Jiao Tong University1996-20111996-2011年全球轉(zhuǎn)基因作物增長(zhǎng)趨勢(shì)年全球轉(zhuǎn)基因作物增長(zhǎng)趨勢(shì)1.48億公頃,占全球農(nóng)作物種植面積的10%Shanghai Jiao Tong University主要轉(zhuǎn)基因作物種植情況主要轉(zhuǎn)基因作物種植情況大豆大豆玉

2、米玉米棉花棉花油菜油菜Shanghai Jiao Tong University主要轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物種植比例主要轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物種植比例常規(guī)作物常規(guī)作物轉(zhuǎn)基因作物轉(zhuǎn)基因作物Shanghai Jiao Tong University轉(zhuǎn)基因農(nóng)作的主要性狀轉(zhuǎn)基因農(nóng)作的主要性狀Shanghai Jiao Tong University轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物種植分布轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物種植分布2010年全球轉(zhuǎn)基因植物面積達(dá)到1.48億公頃,涉及24種作物184個(gè)品系,種植國(guó)家有29個(gè),發(fā)達(dá)國(guó)家占10個(gè)。共有59個(gè)國(guó)家批準(zhǔn)轉(zhuǎn)基因作物的種植和進(jìn)口,包括美國(guó)、日本、加拿大、墨西哥、澳大利亞、南非、歐盟、中國(guó)等。玉米最多有60個(gè)品系批準(zhǔn)

3、應(yīng)用,其次是棉花(35)、油菜(15)、大豆(14)。Shanghai Jiao Tong University國(guó)際、國(guó)內(nèi)轉(zhuǎn)基因國(guó)際、國(guó)內(nèi)轉(zhuǎn)基因生物生物安全管理安全管理Shanghai Jiao Tong University國(guó)際組織對(duì)轉(zhuǎn)基因生物安全管理國(guó)際組織對(duì)轉(zhuǎn)基因生物安全管理國(guó)際食品法典委員會(huì)(CAC) 聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)和世界衛(wèi)生組織(WHO)于1963年聯(lián)合創(chuàng)立的,其職責(zé)在于保護(hù)消費(fèi)者健康,保證開(kāi)展公正的食品貿(mào)易和協(xié)調(diào)所有食品標(biāo)準(zhǔn)的制定工作。最早提出應(yīng)用風(fēng)險(xiǎn)分析原則進(jìn)行食品安全管理。165個(gè)成員國(guó)。 1999年食品法典委員會(huì)建立了政府間特設(shè)生物技術(shù)食品工作組,在轉(zhuǎn)基因領(lǐng)域制定風(fēng)

4、險(xiǎn)分析原則和指南在轉(zhuǎn)基因領(lǐng)域制定風(fēng)險(xiǎn)分析原則和指南 2000年發(fā)布了關(guān)于轉(zhuǎn)基因植物性食物的健康安全性問(wèn)題的文件,運(yùn)用“實(shí)質(zhì)等同性實(shí)質(zhì)等同性”概念建立有效的安全性評(píng)估框架。Shanghai Jiao Tong University 并于2003年7月1日,在羅馬召開(kāi)的聯(lián)合國(guó)食品標(biāo)準(zhǔn)署會(huì)議上,國(guó)際食品法典委員會(huì)通過(guò)了三項(xiàng)有關(guān)生物技術(shù)食品的原則和準(zhǔn)則,即 “現(xiàn)代生物技術(shù)食品風(fēng)險(xiǎn)分析原則”(CAC/GL44-2003) “重組DNA植物食品安全評(píng)估準(zhǔn)則”(CAC/GL45-2003) “重組DNA微生物食品安全評(píng)估準(zhǔn)則”(CAC/GL46-2003) 食品法典委員會(huì)設(shè)立了食品標(biāo)簽法規(guī)委員會(huì)(The C

5、odex Committee on Food Labelling ,CCFL) 2006年CCFL第34屆會(huì)議上通過(guò)建議一個(gè)實(shí)體工作組(physical Working Group)討論轉(zhuǎn)基因食品標(biāo)識(shí)的主要問(wèn)題國(guó)際食品法典委員會(huì)(CAC)Shanghai Jiao Tong University經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD) 經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織,簡(jiǎn)稱(chēng)經(jīng)合組織(OECD),是由34個(gè)市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)國(guó)家組成的政府間國(guó)際經(jīng)濟(jì)組織,旨在共同應(yīng)對(duì)全球化帶來(lái)的經(jīng)濟(jì)、社會(huì)和政府治理等方面的挑戰(zhàn),并把握全球化帶來(lái)的機(jī)遇。 1986年,藍(lán)皮書(shū)重組DNA安全性考慮 轉(zhuǎn)基因生物總體指南1992年,生物技術(shù)安全性考慮199

6、2 明確生物安全的概念和原則 1992年,生物技術(shù)作物田間試驗(yàn)安全考慮 確定分階段原則和個(gè)案原則1993年,現(xiàn)代生物技術(shù)加工食品風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估概念和原理實(shí)質(zhì)等同原則 ,現(xiàn)在有67個(gè)國(guó)家把這一原則作為轉(zhuǎn)基因食品安全評(píng)估的基本原則。1995年以來(lái),風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估信息共享,已出版65個(gè)生物安全共識(shí)文件 Shanghai Jiao Tong University國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織(International Organization for Standardization, ISO)是一個(gè)全球性的非政府組織,1946年成立于瑞士日內(nèi)瓦,負(fù)責(zé)制定在世界范圍內(nèi)通用的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn), ISO現(xiàn)有117個(gè)成員,包括117個(gè)國(guó)家和地

7、區(qū)。ISO轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)委員會(huì)(ISO TC34/SC16),主管轉(zhuǎn)基因食品國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的制修訂工作。技術(shù)委員會(huì)負(fù)責(zé)起草國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),通過(guò)一致的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)消除現(xiàn)存的貿(mào)易壁壘,推進(jìn)國(guó)際商品和服務(wù)的交流。目前為止,ISO制訂6個(gè)轉(zhuǎn)基因生物產(chǎn)品檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。Shanghai Jiao Tong University轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品成分檢測(cè)ISO標(biāo)準(zhǔn)一般性原則和要求蛋白檢測(cè)采樣核酸檢測(cè)核酸提取定性PCR檢測(cè)定量PCR檢測(cè)核酸檢測(cè)方法增補(bǔ)原則ISO 24276:2006,General requirements and definitions ISO 21571:2005Nucleic acid extraction

8、 ISO 21570:2005 Quantitative nucleic acid based methods ISO 21572:2004Protein based method ISO/TS 21098:2005 Information to be supplied and procedure for the addition of methods toISO 21569,ISO 21570 orISO 21571 prEN ISO 21568:2005Sampling21569:2005Qualitative nucleic acid based methods Shanghai Jia

9、o Tong University發(fā)達(dá)國(guó)家轉(zhuǎn)基因生物安全管理規(guī)定各國(guó)均以風(fēng)險(xiǎn)分析為基礎(chǔ),理念、內(nèi)容、方法無(wú)明顯差異,不各國(guó)均以風(fēng)險(xiǎn)分析為基礎(chǔ),理念、內(nèi)容、方法無(wú)明顯差異,不同的戰(zhàn)略選擇和政策導(dǎo)向形成不同的管理模式同的戰(zhàn)略選擇和政策導(dǎo)向形成不同的管理模式 美國(guó)模式美國(guó)模式,以產(chǎn)品為基礎(chǔ),風(fēng)險(xiǎn)分析中應(yīng)用,以產(chǎn)品為基礎(chǔ),風(fēng)險(xiǎn)分析中應(yīng)用“可靠科學(xué)原可靠科學(xué)原則則” 只要在科學(xué)上無(wú)法證明它有危險(xiǎn)性,就不應(yīng)該限制只要在科學(xué)上無(wú)法證明它有危險(xiǎn)性,就不應(yīng)該限制 歐盟模式歐盟模式,以過(guò)程為基礎(chǔ),風(fēng)險(xiǎn)分析中應(yīng)用預(yù)防原則,以過(guò)程為基礎(chǔ),風(fēng)險(xiǎn)分析中應(yīng)用預(yù)防原則 只要不能否定其危險(xiǎn)性,就應(yīng)該限制只要不能否定其危險(xiǎn)性,就

10、應(yīng)該限制 日本模式日本模式,以過(guò)程為基礎(chǔ),風(fēng)險(xiǎn)分析中應(yīng)用,以過(guò)程為基礎(chǔ),風(fēng)險(xiǎn)分析中應(yīng)用“可靠科學(xué)可靠科學(xué)”美、歐、日等,重視轉(zhuǎn)基因生物的安全管理,通過(guò)立法美、歐、日等,重視轉(zhuǎn)基因生物的安全管理,通過(guò)立法和技術(shù)指南規(guī)范研發(fā)和應(yīng)用行為和技術(shù)指南規(guī)范研發(fā)和應(yīng)用行為Shanghai Jiao Tong University歐盟轉(zhuǎn)基因生物安全管理歐盟轉(zhuǎn)基因生物安全管理法律體系分為指令Directive和法規(guī)Regulation兩個(gè)層次,頒布的法令在各國(guó)采納后對(duì)采納的國(guó)家有效,頒布的法規(guī)則直接有效。按照預(yù)防原則對(duì)轉(zhuǎn)基因生物進(jìn)行單獨(dú)立法管理按照預(yù)防原則對(duì)轉(zhuǎn)基因生物進(jìn)行單獨(dú)立法管理歐洲食品安全局負(fù)責(zé)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià),

11、歐洲食品安全局負(fù)責(zé)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià),負(fù)責(zé)GMOs的審批和市場(chǎng)投放,實(shí)施從農(nóng)田到餐桌的實(shí)施從農(nóng)田到餐桌的的各環(huán)節(jié)進(jìn)行監(jiān)監(jiān)控,控,保證轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的可追溯性Shanghai Jiao Tong Universityl指令指令2001/18/EC轉(zhuǎn)基因生物有意環(huán)境釋放轉(zhuǎn)基因生物有意環(huán)境釋放規(guī)范任何可能導(dǎo)致轉(zhuǎn)基因生物與環(huán)境接觸行為規(guī)范任何可能導(dǎo)致轉(zhuǎn)基因生物與環(huán)境接觸行為l法規(guī)法規(guī)1829/2003/EC轉(zhuǎn)基因食品和飼料管理?xiàng)l例轉(zhuǎn)基因食品和飼料管理?xiàng)l例轉(zhuǎn)基因食品審批和執(zhí)行制度轉(zhuǎn)基因食品審批和執(zhí)行制度l法規(guī)法規(guī)1830/2003/EC轉(zhuǎn)基因生物追溯性及標(biāo)識(shí)辦法轉(zhuǎn)基因生物追溯性及標(biāo)識(shí)辦法以及含轉(zhuǎn)基因生物成分的食品及飼

12、料產(chǎn)品的追溯性以及含轉(zhuǎn)基因生物成分的食品及飼料產(chǎn)品的追溯性管理?xiàng)l例管理?xiàng)l例轉(zhuǎn)基因食品追蹤和標(biāo)識(shí)制度轉(zhuǎn)基因食品追蹤和標(biāo)識(shí)制度歐盟法規(guī)歐盟法規(guī)Shanghai Jiao Tong University美國(guó)轉(zhuǎn)基因生物安全管理美國(guó)轉(zhuǎn)基因生物安全管理1976年,國(guó)家衛(wèi)生研究院(NIH)重組DNA分子研究指南全球首個(gè)轉(zhuǎn)基因技術(shù)安全管理法規(guī) 全球首個(gè)轉(zhuǎn)基因技術(shù)安全管理法規(guī),對(duì)重組DNA研究項(xiàng)目的進(jìn)行審查、評(píng)價(jià)和監(jiān)控1986年頒布了生物技術(shù)法規(guī)協(xié)調(diào)框架 將基因工程工作納入現(xiàn)有法規(guī)進(jìn)行管理,由農(nóng)業(yè)部、環(huán)保署和食品藥品管理局在現(xiàn)有的法規(guī)框架下協(xié)調(diào)管理轉(zhuǎn)基因生物。Shanghai Jiao Tong Univers

13、ity農(nóng)業(yè)部(USDA),管理目的是確保轉(zhuǎn)基因生物(GMOs)的安全種植。有兩個(gè)機(jī)構(gòu)涉及該項(xiàng)工作,即:動(dòng)植物檢疫局(APHIS)和食品安全及檢查局(FSIS)。環(huán)保署(EPA),負(fù)責(zé)管理轉(zhuǎn)基因生物的環(huán)境釋放。依照聯(lián)邦殺蟲(chóng)劑、殺菌劑、殺鼠劑法、聯(lián)邦食品、藥物和化妝品法對(duì)殺蟲(chóng)劑(包括植物殺蟲(chóng)劑,即轉(zhuǎn)抗蟲(chóng)、抗病基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì))進(jìn)行管理。具體負(fù)責(zé)殺蟲(chóng)劑對(duì)農(nóng)業(yè)的影響和確定或免除殺蟲(chóng)劑在食品中最高殘留量的管理。食品與藥物管理局(FDA),依照聯(lián)邦食品、藥物和化妝品法,負(fù)責(zé)食品和食品添加劑的安全管理,確保所轉(zhuǎn)基因生產(chǎn)的蛋白質(zhì)對(duì)人類(lèi)健康的安全。-負(fù)責(zé)食品標(biāo)識(shí)管理負(fù)責(zé)食品標(biāo)識(shí)管理。美國(guó)管理部門(mén)美國(guó)管理部門(mén)Sh

14、anghai Jiao Tong University日本轉(zhuǎn)基因生物管理、法規(guī)日本轉(zhuǎn)基因生物管理、法規(guī)日本在1979年制定了重組DNA實(shí)驗(yàn)管理?xiàng)l例,開(kāi)始生物技術(shù)的安全管理。所涉及的部門(mén)主要是科學(xué)技術(shù)廳、通產(chǎn)省、農(nóng)林水產(chǎn)省和厚生勞動(dòng)省??茖W(xué)技術(shù)廳:依照重組DNA實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)則,規(guī)范實(shí)驗(yàn)室和封閉溫室的研究,負(fù)責(zé)審批試驗(yàn)階段的重組DNA研究。厚生勞動(dòng)省(MHLW):依照重組DNA準(zhǔn)則,負(fù)責(zé)對(duì)重組DNA技術(shù)生產(chǎn)藥品和食品的管理-食用安全。通產(chǎn)省(MITI)。:依照遺傳工程體工業(yè)化準(zhǔn)則,對(duì)將重組DNA技術(shù)的成果應(yīng)用于工業(yè)化活動(dòng)進(jìn)行管理-飼料安全。農(nóng)林水產(chǎn)省(MAFF):依照農(nóng)、林、漁及食品工業(yè)應(yīng)用重組DNA準(zhǔn)

15、則負(fù)責(zé)管理GMO在農(nóng)業(yè)、林業(yè)、漁業(yè)和食品工業(yè)中應(yīng)用-環(huán)境、飼料安全。MAFF和MHLW分別頒布了食品標(biāo)識(shí)體系,規(guī)范轉(zhuǎn)基因食品標(biāo)識(shí)標(biāo)準(zhǔn)。Shanghai Jiao Tong University中國(guó)法律法規(guī)和制度要求中國(guó)法律法規(guī)和制度要求特點(diǎn):特點(diǎn):與國(guó)際組織及多數(shù)國(guó)家的理念、與國(guó)際組織及多數(shù)國(guó)家的理念、要求、做法一致要求、做法一致中國(guó)生物安全網(wǎng), Shanghai Jiao Tong University 2001年,國(guó)務(wù)院年,國(guó)務(wù)院農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全管理?xiàng)l例農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全管理?xiàng)l例 2002年,農(nóng)業(yè)部年,農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全評(píng)價(jià)辦法農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全評(píng)價(jià)辦法 2002年,農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物

16、進(jìn)口管理辦法年,農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物進(jìn)口管理辦法 2002年,年, 農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物標(biāo)識(shí)管理辦法農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物標(biāo)識(shí)管理辦法 2006年,農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物加工審批辦法年,農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物加工審批辦法 2004年,年, 質(zhì)檢總局質(zhì)檢總局進(jìn)出境轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢驗(yàn)檢疫管理辦法進(jìn)出境轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢驗(yàn)檢疫管理辦法 一個(gè)條例,5個(gè)辦法規(guī)范了農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全評(píng)價(jià)、進(jìn)口安全管理、標(biāo)識(shí)管理、加工審批、產(chǎn)品進(jìn)出境檢驗(yàn)檢疫工作,形成了一整套適合我國(guó)國(guó)情并與國(guó)際接軌的法律法規(guī)、技術(shù)規(guī)程和管理體系。我國(guó)的法律法規(guī)制度我國(guó)的法律法規(guī)制度Shanghai Jiao Tong UniversityShanghai Jiao Tong Univ

17、ersity 國(guó)務(wù)院部際聯(lián)席會(huì)議,國(guó)務(wù)院部際聯(lián)席會(huì)議,由農(nóng)業(yè)、科技、環(huán)由農(nóng)業(yè)、科技、環(huán)境保護(hù)、衛(wèi)生、外經(jīng)貿(mào)、檢驗(yàn)檢疫等有關(guān)境保護(hù)、衛(wèi)生、外經(jīng)貿(mào)、檢驗(yàn)檢疫等有關(guān)部門(mén)負(fù)責(zé)人組成。部門(mén)負(fù)責(zé)人組成。 農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全領(lǐng)導(dǎo)小組農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全領(lǐng)導(dǎo)小組 農(nóng)業(yè)部科技教育司(農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生農(nóng)業(yè)部科技教育司(農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室)物安全領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室) 國(guó)家農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全委員會(huì)及其秘書(shū)國(guó)家農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全委員會(huì)及其秘書(shū)處處管理機(jī)構(gòu)管理機(jī)構(gòu)Shanghai Jiao Tong University農(nóng)業(yè)部科技發(fā)展中心農(nóng)業(yè)部科技發(fā)展中心(農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全監(jiān)管中心、農(nóng)

18、(農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全監(jiān)管中心、農(nóng)業(yè)部植物新品種測(cè)試中心),承辦國(guó)家生物安全專(zhuān)家委員會(huì)秘書(shū)業(yè)部植物新品種測(cè)試中心),承辦國(guó)家生物安全專(zhuān)家委員會(huì)秘書(shū)處的日常聯(lián)絡(luò)工作,是全國(guó)轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)秘書(shū)處掛靠處的日常聯(lián)絡(luò)工作,是全國(guó)轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)秘書(shū)處掛靠單位單位 ,全國(guó)轉(zhuǎn)基因檢測(cè)體系和機(jī)構(gòu)能力建設(shè)、檢測(cè)監(jiān)測(cè),全國(guó)轉(zhuǎn)基因檢測(cè)體系和機(jī)構(gòu)能力建設(shè)、檢測(cè)監(jiān)測(cè)-農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因生物安全監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心轉(zhuǎn)基因生物安全監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心等。等。基因安全管理處基因安全管理處,負(fù)責(zé)生物安全評(píng)價(jià),負(fù)責(zé)生物安全評(píng)價(jià)等具體技術(shù)工作,承辦兩個(gè)秘書(shū)處及等具體技術(shù)工作,承辦兩個(gè)秘書(shū)處及生物安全網(wǎng)的具體事務(wù)。生物安全

19、網(wǎng)的具體事務(wù)。農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全檢定處農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全檢定處,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn),負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)基因檢測(cè)體系及機(jī)構(gòu)能力建設(shè)、檢測(cè)基因檢測(cè)體系及機(jī)構(gòu)能力建設(shè)、檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)、全國(guó)性監(jiān)測(cè)的具體技術(shù)工作。標(biāo)準(zhǔn)、全國(guó)性監(jiān)測(cè)的具體技術(shù)工作。技術(shù)支撐機(jī)構(gòu)技術(shù)支撐機(jī)構(gòu)Shanghai Jiao Tong University技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)Shanghai Jiao Tong University轉(zhuǎn)基因轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品產(chǎn)品檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)技術(shù)Shanghai Jiao Tong University全球主要國(guó)家轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品標(biāo)識(shí)管理情況全球主要國(guó)家轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品標(biāo)識(shí)管理情況國(guó)家國(guó)家/地區(qū)地區(qū)標(biāo)識(shí)類(lèi)別標(biāo)識(shí)類(lèi)別標(biāo)識(shí)閾值標(biāo)識(shí)閾值國(guó)家國(guó)家/地區(qū)地區(qū) 標(biāo)識(shí)類(lèi)

20、別標(biāo)識(shí)類(lèi)別標(biāo)識(shí)閾值標(biāo)識(shí)閾值中國(guó)強(qiáng)制0%印度尼西亞強(qiáng)制性5%歐盟強(qiáng)制性0.9%臺(tái)灣強(qiáng)制性5%俄羅斯強(qiáng)制性0.9%泰國(guó)強(qiáng)制性5新西蘭強(qiáng)制性1%菲律賓自愿性5%巴西強(qiáng)制性1%泰國(guó)強(qiáng)制性5沙特強(qiáng)制性1%加拿大自愿性5韓國(guó)強(qiáng)制性3%中國(guó)香港自愿性5%日本強(qiáng)制性5%南非自愿無(wú)具體說(shuō)明以色列強(qiáng)制性1%阿根廷自愿性無(wú)具體說(shuō)明智利強(qiáng)制性2%美國(guó)自愿性無(wú)具體說(shuō)明Shanghai Jiao Tong University如何進(jìn)行轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測(cè)?如何進(jìn)行轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測(cè)? 染色體水平 轉(zhuǎn)錄組水平 蛋白組水平 代謝組水平GMNon-GM?Shanghai Jiao Tong University轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)一般流程

21、轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)一般流程Shanghai Jiao Tong University提取核酸或蛋白質(zhì)核酸檢測(cè)蛋白質(zhì)檢測(cè)或定性定性PCR定量定量PCR芯片檢測(cè)芯片檢測(cè)核酸測(cè)序核酸測(cè)序側(cè)向流動(dòng)側(cè)向流動(dòng)試紙條試紙條酶聯(lián)免疫酶聯(lián)免疫吸附吸附轉(zhuǎn)基因生物檢測(cè)Shanghai Jiao Tong University基于蛋白的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)方法基于蛋白的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)方法1.酶聯(lián)免疫吸附法(酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA) ELISA可用于測(cè)定抗原,也可用于測(cè)定抗體。在這種測(cè)定方法中有三個(gè)必要的試劑:(1)固相的抗原或抗體,即免疫吸附劑(immunosorbent);(2)酶標(biāo)記的抗原或抗體,稱(chēng)為結(jié)合物(conjugate

22、);(3)酶反應(yīng)的底物。最常見(jiàn)的檢測(cè)方法是夾心法 Shanghai Jiao Tong University將樣品提取液加入包被有目標(biāo)蛋白抗體的微孔將樣品提取液加入包被有目標(biāo)蛋白抗體的微孔板中,轉(zhuǎn)基因植物表達(dá)的外源蛋白的抗體與被板中,轉(zhuǎn)基因植物表達(dá)的外源蛋白的抗體與被檢測(cè)樣品中的外源蛋白結(jié)合。檢測(cè)樣品中的外源蛋白結(jié)合。加入用酶(辣根過(guò)氧化物酶)標(biāo)記的目加入用酶(辣根過(guò)氧化物酶)標(biāo)記的目標(biāo)蛋白抗體,抗原抗體產(chǎn)生特異性結(jié)合。標(biāo)蛋白抗體,抗原抗體產(chǎn)生特異性結(jié)合。洗滌以后,加入底物顯色。辣根過(guò)氧化洗滌以后,加入底物顯色。辣根過(guò)氧化物酶催化底物成有色產(chǎn)物,根據(jù)顏色反物酶催化底物成有色產(chǎn)物,根據(jù)顏色反應(yīng)的

23、程度進(jìn)行該抗原的定性或定量分析。應(yīng)的程度進(jìn)行該抗原的定性或定量分析。ELISA檢測(cè)基本原理標(biāo)記有蛋白抗體的酶標(biāo)板標(biāo)記有蛋白抗體的酶標(biāo)板Shanghai Jiao Tong University根據(jù)轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)繪制的標(biāo)準(zhǔn)曲線根據(jù)外源蛋白標(biāo)準(zhǔn)繪制的標(biāo)準(zhǔn)曲線Shanghai Jiao Tong University根據(jù)抗原抗體特異性結(jié)合的原理工作。2 2、側(cè)向流動(dòng)型免疫試紙條方法、側(cè)向流動(dòng)型免疫試紙條方法Shanghai Jiao Tong University快速檢測(cè)試紙條法應(yīng)用了雙抗體夾心法,首先將CP4 EPSPS蛋白特異的抗體,偶連于顯色試劑,并參入試紙條。當(dāng)試紙條被插入含有CP4 EPS

24、PS蛋白的植物組織的小量萃取物時(shí),偶連抗體與蛋白之間就發(fā)生了結(jié)合,與偶連于顯色試劑上的某些但不是全部抗體形成夾心物。膜片含有兩個(gè)捕獲區(qū),一個(gè)捕獲區(qū)可捕獲結(jié)合的CP4 EPSPS蛋白,另一個(gè)捕獲區(qū)可捕獲顯色試劑。當(dāng)夾心物和未反應(yīng)的顯色試劑被膜片上的特定區(qū)捕獲時(shí),這些捕獲區(qū)就顯現(xiàn)出紅色。若膜片上僅存在一條紅色對(duì)照線,便說(shuō)明受檢樣品為陰性樣品,若存在兩條線,便說(shuō)明受檢樣品為陽(yáng)性樣品。Shanghai Jiao Tong University蛋白檢測(cè)試劑盒蛋白檢測(cè)試劑盒Shanghai Jiao Tong University蛋白檢測(cè)特點(diǎn)蛋白檢測(cè)特點(diǎn)ELISA具備了酶反應(yīng)的高靈敏度和抗原抗體反應(yīng)的特異

25、性,具有簡(jiǎn)便、快速、費(fèi)用低等特點(diǎn),但易出現(xiàn)本底過(guò)高的問(wèn)題,且只能檢測(cè)目的蛋白抗原性沒(méi)有明顯變化的粗加工產(chǎn)品。側(cè)向流動(dòng)免疫測(cè)定試紙條是一種很快速簡(jiǎn)便的定性檢測(cè)方法,將試紙條放在待測(cè)樣品抽提物中,510分鐘就可得出結(jié)果,不需要特殊儀器和熟練技能。但一種試紙條只能檢測(cè)一種蛋白質(zhì),且只能檢測(cè)有無(wú)存在外源蛋白而不能區(qū)分具體的轉(zhuǎn)基因品種。Shanghai Jiao Tong University基于核酸的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)方法基于核酸的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)方法35S promoterNOS terminatorCaMVAgrobacterium tumefaciens檢測(cè)主要依據(jù)是目的DNA鏈與特定的生物大分子結(jié)合或者與特

26、異序列的雜交目的DNA主要由具有特定功能的基因及其相應(yīng)的調(diào)控元件組成。 Shanghai Jiao Tong University核酸檢測(cè)方法策略核酸檢測(cè)方法策略啟動(dòng)子基因內(nèi)含子終止子篩選檢測(cè)基因特異性檢測(cè)構(gòu)建特異性檢測(cè)轉(zhuǎn)化體特異性檢測(cè)低植物基因組高Arne HA et al., Euro Food Res Tech, 2007植物基因組Shanghai Jiao Tong UniversityTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATTGAACGTAGTAGCAT

27、AGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTADNA模板+ 引物 +三磷酸脫氧核苷酸+Taq DNA聚合酶+PCR反應(yīng)緩沖液(鹽離子)定性定性PCR檢測(cè)方法原理

28、檢測(cè)方法原理Shanghai Jiao Tong UniversityNovember 8th 200442TGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAG

29、CTAAACTAGCTAACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAStep 1 : 變性94C Shanghai Jiao Tong UniversityTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACA

30、TCGATTTGATCGATACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAStep 2 : 退火T 依賴(lài)于引物 CGTAGTAGCACGTAGTAGCAGCTGCTACGTAGGCTGCTACGTAGShanghai Jiao Tong UniversityTGAACGTAGTAGCATAGCAATG

31、TACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGT

32、AGTACTGTAGCTAAACTAGCTAStep 3 : 延伸72CCGTAGTAGCACGTAGTAGCAGCTGCTACGTAGGCTGCTACGTAGTaq PolymeraseTaq PolymeraseTAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCTAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTA

33、ACTGTCACTAGAShanghai Jiao Tong UniversityTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAA

34、CTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTADNA量加倍TGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATTGAACGTAGTAGCATAGCAATGTACATCATCAGATAGACGATTGACAGTGATCTCGACGATGCATCATGACATCGATTTGATCGATACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATC

35、TGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAACTTGCATCATCGTATCGTTACATGTAGTAGTCTATCTGCTAACTGTCACTAGAGCTGCTACGTAGTACTGTAGCTAAACTAGCTAShanghai Jiao Tong University46Shanghai Jiao Tong University定性定性PCR產(chǎn)物電泳檢測(cè)產(chǎn)物電泳檢測(cè)DNA分子量大小對(duì)照檢測(cè)產(chǎn)物Shanghai Jiao Tong University定性定性PCRPCR檢測(cè)關(guān)鍵因子檢測(cè)關(guān)鍵因子引物設(shè)計(jì)PCR引物時(shí)使用輔助軟件既可節(jié)省時(shí)

36、間,也能避免犯錯(cuò)誤。如Oligo 、Primer Express、Primer Primier 5.0、Vector NTI suite 9 和 Primer Select (DNASTAR INC) 等專(zhuān)業(yè)的引物設(shè)計(jì)軟件。引物的堿基組成、長(zhǎng)度及靶序列的特異性是決定PCR成敗的關(guān)鍵。引物是指DNA聚合酶啟動(dòng)DNA合成時(shí)必需的一段寡核苷酸,是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵因素,PCR反應(yīng)產(chǎn)物的特異性是由一對(duì)上下游引物所決定的。Shanghai Jiao Tong University dNTPs是PCR反應(yīng)過(guò)程中DNA合成的原材料。一般反應(yīng)中每種dNTP的終濃度為20200 mol/L。三磷酸脫氧核苷酸

37、(dNTPs) dNTP濃度過(guò)高,堿基的錯(cuò)誤摻入率增加,低濃度的dNTP可提高特異擴(kuò)增的精確性。 反應(yīng)體系中4種dNTPs的濃度應(yīng)該相等,以減少合成中由于某種dNTP的不足出現(xiàn)的錯(cuò)誤摻入。當(dāng)dNTP終濃度大于50 mmol/L時(shí)可抑制Taq DNA聚合酶的活性。Shanghai Jiao Tong University Taq DNA聚合酶最早是從一種嗜熱水生菌Thermus aquaticus YT-1菌株中分離純化獲得的,后來(lái)在嗜熱脂肪芽孢桿菌及其它幾種耐熱菌中也分離提純到此類(lèi)DNA聚合酶。Taq DNA聚合酶 酶量過(guò)多會(huì)使非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物增加,過(guò)少則使產(chǎn)量降低。 Shanghai Jia

38、o Tong University反應(yīng)緩沖液 反應(yīng)緩沖液一般含有1050 mmol/L TrisCl,50 mmol/L KCl和適當(dāng)濃度Mg2+ (一般為1.5 mmol/L MgCl2)。 Mg2+濃度既影響酶的活性和真實(shí)性,又影響引物退火和解鏈溫度,影響產(chǎn)物的特異性以及引物二聚體形成等,因此,合適的Mg2+濃度是PCR的關(guān)鍵。 必要時(shí)在反應(yīng)緩沖液中還可加入5 mmol/L的二硫蘇糖醇(DDT)或100 g/ml的牛血清蛋白(BSA),以穩(wěn)定Taq酶的活性。 50 mmol/L的KCl有利于引物退火,高于75 mmol/L時(shí)PCR反應(yīng)明顯受到抑制。Shanghai Jiao Tong Un

39、iversity轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品定性轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品定性PCRPCR檢測(cè)方法關(guān)鍵檢測(cè)方法關(guān)鍵方法特異性9種轉(zhuǎn)基因玉米檢測(cè)方法的特異性示意圖(A):GA21玉米;(B):NK603玉米;(C):BT176玉米;(D):CBH351玉米;(E):MON863玉米;(F):TC1507玉米;(G):T25玉米;(H):BT11玉米;(I):MON810玉米;(J):玉米內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)基因zSSIIb基因。泳道114分別是:空白對(duì)照、GA21玉米、NK603玉米、BT176玉米、CBH351玉米、MON863玉米、TC1507玉米、T25玉米、BT11玉米、MON810玉米、非轉(zhuǎn)基因玉米、轉(zhuǎn)基因大豆GTS 40-3-2、

40、轉(zhuǎn)基因油菜RT73和轉(zhuǎn)基因MON531棉花;泳道M為DL2000 DNA分子量Marker.Shanghai Jiao Tong University方法檢測(cè)極限(LOD)相對(duì)LOD值,指的是能夠檢測(cè)到的最低轉(zhuǎn)基因植物產(chǎn)品的含量,一般是以“xx%”表示的;以一系列不同轉(zhuǎn)基因含量的標(biāo)準(zhǔn)DNA樣品為PCR擴(kuò)增模板,經(jīng)過(guò)至少三次重復(fù)后,確定可以獲得PCR擴(kuò)增到的DNA樣品的最低轉(zhuǎn)基因含量為相對(duì)LOD值。 絕對(duì)LOD值,指的是能夠檢測(cè)的最低轉(zhuǎn)基因植物DNA的質(zhì)量,一般是以“xx pg”或“xx拷貝”表示的。以純的基因組DNA為標(biāo)準(zhǔn)樣品,以不同濃度梯度DNA樣品為PCR模板擴(kuò)增,經(jīng)過(guò)至少三次重復(fù)后,確定

41、可以獲得PCR擴(kuò)增到的DNA樣品的最低DNA質(zhì)量為絕對(duì)LOD值。Shanghai Jiao Tong University已有轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品定性已有轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品定性PCRPCR檢測(cè)方法檢測(cè)方法 基因特異性:epsps、cry1Ab、Pat、bar、Gox、cry9C、NptII等 篩選特異性:CaMV35s啟動(dòng)子、NOS啟動(dòng)子和終止子、FMV35s等 構(gòu)建特異性:主要的轉(zhuǎn)基因大豆、玉米、油菜、棉花等品系 轉(zhuǎn)化體特異性:主要的轉(zhuǎn)基因大豆、玉米、油菜、棉花等品系上述方法LOD都達(dá)到0.1,且很多已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化成為ISO和我國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)!Shanghai Jiao Tong University熒光定量 PCR

42、(real-time PCR) 通過(guò)熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性的探針,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,實(shí)時(shí)在線監(jiān)控反應(yīng)過(guò)程,結(jié)合相應(yīng)的軟件可以對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析,計(jì)算待測(cè)樣品的初始模板量。定量定量PCRPCR檢測(cè)方法檢測(cè)方法熒光定量 PCR儀 熒光定量PCR儀是一種帶有激發(fā)光源和熒光信號(hào)檢測(cè)系統(tǒng)的PCR儀,通常配有電腦系統(tǒng)及相應(yīng)的分析軟件。Shanghai Jiao Tong University 閉管反應(yīng) (low contamination risk) 無(wú)需PCR后操作 (no gels, films etc)自動(dòng)化高通量 單一反應(yīng)管檢測(cè)可以同時(shí)分析多個(gè)反應(yīng)管定量定量PCRPCR檢測(cè)方法特點(diǎn)檢測(cè)方法

43、特點(diǎn) 蓋子蓋子 PCR 管管 加熱板加熱板 樣品樣品透鏡透鏡Shanghai Jiao Tong University熒光域值(熒光域值(threshold) 以PCR反應(yīng)的前15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)作為熒光本底信號(hào),一般熒光域值定義為3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10 倍.熒光信號(hào)熒光信號(hào)PCR 循環(huán)循環(huán) (高濃度)高CT(低濃度)real-time PCR amplification plots (7 x 10-fold dilns. + NTC)終點(diǎn)終點(diǎn)(不能定量)(不能定量)閾值閾值低CTCt值值 循環(huán)閾值,C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含義是:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒

44、光信號(hào)到達(dá)設(shè)定的域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù); Ct值取決于閾值; Ct值與模板DNA的起始拷貝成反比,與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系;兩個(gè)重要概念兩個(gè)重要概念Shanghai Jiao Tong University定量PCR檢測(cè)方法Shanghai Jiao Tong UniversityShanghai Jiao Tong University實(shí)時(shí)熒光定量實(shí)時(shí)熒光定量PCRPCR方法方法 u絕對(duì)定量法,絕對(duì)定量法,測(cè)樣品中的轉(zhuǎn)指的是利用定量PCR反應(yīng)及其構(gòu)建的標(biāo)準(zhǔn)曲線,獲得檢基因植物基因組或外源目的基因的質(zhì)量或拷貝數(shù)。轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的定量PCR檢測(cè),主要可以分為兩種方法:一種是絕對(duì)定量法,另

45、一種是相對(duì)定量法。u相對(duì)定量法,相對(duì)定量法,是指利用定量PCR反應(yīng)和構(gòu)建的標(biāo)準(zhǔn)曲線,分析獲得檢測(cè)樣品中轉(zhuǎn)基因植物基因組或外源目的基因在樣品基因組DNA中的百分含量,結(jié)果可以用轉(zhuǎn)基因基因組DNA和樣品基因組DNA的質(zhì)量比或者轉(zhuǎn)基因植物和樣品的質(zhì)量比表示。Shanghai Jiao Tong University108106102104Tu絕對(duì)定量法Shanghai Jiao Tong University外源基因標(biāo)準(zhǔn)曲線內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)基因標(biāo)準(zhǔn)曲線 獲得的是樣品中的植物基因組DNA或外源目的基因的絕對(duì)質(zhì)量或拷貝數(shù)。 u絕對(duì)定量法 基因植物(外源基因)基因組質(zhì)量或拷貝數(shù)100樣品轉(zhuǎn)基因含量(%)植物(內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)

46、基因)基因組質(zhì)量或拷貝數(shù)Shanghai Jiao Tong Universityu相對(duì)定量法Shanghai Jiao Tong University內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)基因外源基因CT(CT =參照基因的CT轉(zhuǎn)基因的CT值) VS 轉(zhuǎn)基因含量之間的標(biāo)準(zhǔn)曲線 Shanghai Jiao Tong UniversityShanghai Jiao Tong University定量定量PCRPCR方法的關(guān)鍵參數(shù)方法的關(guān)鍵參數(shù) 特異性特異性 SpecificitySpecificity 靈敏度靈敏度 SensitivitySensitivity 準(zhǔn)確度準(zhǔn)確度 Accuracy Accuracy 重復(fù)性重復(fù)性 R

47、epeatabilityRepeatability 重演性重演性 ReproducibilityReproducibilityShanghai Jiao Tong University特異性與靈敏度特異性與靈敏度只能在含有靶序列的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品中檢測(cè)出陽(yáng)性信號(hào)只能在含有靶序列的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品中檢測(cè)出陽(yáng)性信號(hào)!需要測(cè)試不同植物品種需要測(cè)試不同植物品種需要測(cè)試不同的轉(zhuǎn)基因植物需要測(cè)試不同的轉(zhuǎn)基因植物足夠低的檢測(cè)靈敏度,滿(mǎn)足轉(zhuǎn)基因標(biāo)識(shí)的要求足夠低的檢測(cè)靈敏度,滿(mǎn)足轉(zhuǎn)基因標(biāo)識(shí)的要求 檢測(cè)極限(LOD)定量極限(LOQ)Shanghai Jiao Tong University 定量定量PCRPCR方法可接受和

48、應(yīng)用基本要求方法可接受和應(yīng)用基本要求ApplicabilityScope of the method, interferences with analytes etc.PracticabilityEquipment, timing, practical difficultiesSpecificityEvent-specificityDynamic RangeInclude the 1/10 and at least 5 times the target concentrationAccuracyWithin 25% of the reference valueR2 Coefficient 0.

49、98PCR efficiency- 3.1 slope 3.6RSDrBelow 25% over the whole dynamic rangeLOQLess than 1/10th of the value of the target concentration with an RSDr 25%LODLess than 1/20th of the target concentrationRobustnessDeviate not more than 30% RSDRBelow 35% at the target concentration; 50% below 0.2%TruenessWi

50、thin 25 of the accepted reference value over the whole rangeShanghai Jiao Tong University熒光染料: SYBR Green I、Eva Green 引物特異性探針: Amplifluor (Intergen) Scorpions探針 通用模板探針(AUDP, UT) LUX(Light Upon Extension)探針序列特異性探針: 熒光能量共振轉(zhuǎn)移探針 (FRET) 雙標(biāo)探針(TaqMan 、 TaqMan MGB 、LNA、Allglo ) 分子信標(biāo)(Molecular Beacons,MB)實(shí)時(shí)熒

51、光定量實(shí)時(shí)熒光定量PCRPCR熒光探針類(lèi)型和基本原理熒光探針類(lèi)型和基本原理Shanghai Jiao Tong University5353SGExcitationSGSGSGSGEmission原理 熒光染料法Shanghai Jiao Tong University5353SGSGSGSGSGExcitationEmissionShanghai Jiao Tong University優(yōu)點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):(1)高度的通用性,幾乎可以用于任何型號(hào)的定量高度的通用性,幾乎可以用于任何型號(hào)的定量PCR儀和任何目標(biāo)儀和任何目標(biāo)DNA序列的擴(kuò)增。序列的擴(kuò)增。(2)無(wú)需另外設(shè)計(jì)熒光探針,無(wú)需特別優(yōu)化條件,簡(jiǎn)便

52、易行,成本較低。)無(wú)需另外設(shè)計(jì)熒光探針,無(wú)需特別優(yōu)化條件,簡(jiǎn)便易行,成本較低。(3)PCR反應(yīng)后可以進(jìn)行融解曲線分析,分析反應(yīng)的特異性和目標(biāo)序列的突變等。反應(yīng)后可以進(jìn)行融解曲線分析,分析反應(yīng)的特異性和目標(biāo)序列的突變等。l 缺點(diǎn):缺點(diǎn):(1)不具備目標(biāo)序列特異性,不能用于Multiplex PCR反應(yīng),容易受污染物, 非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物和引物二聚體的干擾。(2)定量的準(zhǔn)確性不高,重復(fù)性不強(qiáng)。(3)高濃度的染料會(huì)抑制PCR反應(yīng)。Shanghai Jiao Tong UniversityOligo 1: FluoresceinOligo 2: LC Red 640ExcitationEmissionT

53、ransfer熒光共振能量轉(zhuǎn)移探針(FRET Probe)序列特異型探針 Shanghai Jiao Tong University優(yōu)點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):(1) 為雜交型探針,自身不被降解,其熒光信號(hào)是可逆的,為雜交型探針,自身不被降解,其熒光信號(hào)是可逆的,PCR反應(yīng)后可以進(jìn)反應(yīng)后可以進(jìn)行融解曲線分析,突變分析,行融解曲線分析,突變分析,SNP基因分型以及產(chǎn)物鑒別基因分型以及產(chǎn)物鑒別 。(2)包含兩條探針,具備很高的目標(biāo)序列特異性,不受引物二聚體和非特異擴(kuò)增)包含兩條探針,具備很高的目標(biāo)序列特異性,不受引物二聚體和非特異擴(kuò)增的影響。的影響。l缺點(diǎn):缺點(diǎn): 由于需要合成兩條探針,探針的末端要封閉以避免延伸

54、反應(yīng),所以合成的由于需要合成兩條探針,探針的末端要封閉以避免延伸反應(yīng),所以合成的成本會(huì)比較高,也比較麻煩成本會(huì)比較高,也比較麻煩 。Shanghai Jiao Tong UniversityRQ53535353ExcitationRQ QRQRExcitation雙標(biāo)記探針(TaqMan Probe)Shanghai Jiao Tong University優(yōu)點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):(1)具備目標(biāo)序列特異性,良好的穩(wěn)定性和靈敏度。)具備目標(biāo)序列特異性,良好的穩(wěn)定性和靈敏度。(2)有多種不同波長(zhǎng)的熒光基團(tuán)對(duì)可供選擇,可以實(shí)現(xiàn)在同一管內(nèi)檢測(cè))有多種不同波長(zhǎng)的熒光基團(tuán)對(duì)可供選擇,可以實(shí)現(xiàn)在同一管內(nèi)檢測(cè)Multip

55、lex PCR ,降低成本也提高效率和準(zhǔn)確性。降低成本也提高效率和準(zhǔn)確性。(3)探針自身對(duì))探針自身對(duì)PCR反應(yīng)的影響較小,定量的準(zhǔn)確性高。反應(yīng)的影響較小,定量的準(zhǔn)確性高。 TaqMan 是應(yīng)用最廣泛,最成熟的熒光定量技術(shù),廣泛的應(yīng)用于人類(lèi)傳染病診斷、動(dòng)物疾病檢測(cè)以及轉(zhuǎn)基因作物定量檢測(cè)等 。l 缺點(diǎn):缺點(diǎn):(1)探針設(shè)計(jì)有一定難度,需要驗(yàn)證效果,探針的合成和雙熒光標(biāo)記成本高 。 (2) 探針較長(zhǎng)使得兩端基團(tuán)距離較遠(yuǎn),導(dǎo)致熒光淬滅不徹底,而且淬滅基團(tuán)也 會(huì) 產(chǎn)生不同波長(zhǎng)的熒光,本底信號(hào)偏高,信噪比不高。(3)其為水解型探針,反應(yīng)中探針會(huì)水解,熒光信號(hào)不可逆,不能用于融解曲線分析。Shanghai

56、 Jiao Tong UniversityTaqMan MGB 針對(duì)Taqman探針熒光淬滅不徹底的問(wèn)題,2000年美國(guó)ABI公司推出了一種新TaqMan探針 ,即TaqMan MGB,其工作原理與TaqMan 探針相同。Shanghai Jiao Tong UniversityTaqMan MGB優(yōu)點(diǎn)優(yōu)點(diǎn)(1)3端采用了非熒光性的淬滅基因。(2)MGB探針的3端還連接了一個(gè)二氫環(huán)化吲哚卟啉-三肽( dehydrocyclopyrroindole tripetide, DPI3), 可以大大穩(wěn)定探針與模板的雜交, 升高探針Tm 值,提高探針的特異性。(3)探針可以設(shè)計(jì)得更短,熒光報(bào)告基團(tuán)和淬滅

57、基團(tuán)的距離更近, 淬滅效果更好,熒光背景更低,使得信噪比更高。 (4)MGB探針對(duì)于等位基因的區(qū)分比較理想,可以檢測(cè)單堿基突變?,F(xiàn)在它也是轉(zhuǎn)基因作物定量檢測(cè)中的一種常用的定量技術(shù)。Shanghai Jiao Tong UniversityRQExcitationRQQRExcitationEmission分子信標(biāo)(Molecular Beacon Probe)序列特異型探針 Shanghai Jiao Tong Universityl缺點(diǎn)缺點(diǎn): :(1)雜交時(shí)探針不能完全與模板結(jié)合,因此穩(wěn)定性較差。 (2)探針合成時(shí)標(biāo)記較復(fù)雜。分子信標(biāo)是轉(zhuǎn)基因定量檢測(cè)的常用的技術(shù),它還可以用于突變檢測(cè),SNP

58、檢測(cè),在其基礎(chǔ)上發(fā)展的技術(shù)有Amplifluor、Sunrise、Amplisensor、Scorpion 等。Shanghai Jiao Tong University目前常用的序列特異性探針比較目前常用的序列特異性探針比較Shanghai Jiao Tong University完成驗(yàn)證方法44個(gè),正在進(jìn)行中31個(gè)!Shanghai Jiao Tong University535353533RQ5RQRQ35QRRREmissionExcitationQR2.3.1 Amplifluor引物特異性探針Shanghai Jiao Tong University優(yōu)點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):1 它是引物特異性探

59、針,不需要引物以外的探針,節(jié)約成本,反應(yīng)體系優(yōu)化更加方便。2 它是積累性熒光,信號(hào)不可逆,可用于融解曲線分析。3 其探針序列是通用的,可用于檢測(cè)任何目標(biāo)序列,更節(jié)約成本。l缺點(diǎn):(1)對(duì)引物的擴(kuò)增效率影響比較大,影響定量的準(zhǔn)確性。(2)其穩(wěn)定性不太好,其莖環(huán)結(jié)構(gòu)對(duì)其標(biāo)記染料的淬滅能力有限,容易出現(xiàn)淬滅不徹底,導(dǎo)致本底信號(hào)強(qiáng)。該技術(shù)是在分子信標(biāo)的基礎(chǔ)上發(fā)展而來(lái)的技術(shù),具了分析信標(biāo)的一般特點(diǎn)。Shanghai Jiao Tong University通過(guò)優(yōu)化各個(gè)引物對(duì)之間的濃度比,達(dá)到同時(shí)特異性擴(kuò)增的目的。同時(shí)擴(kuò)增8種轉(zhuǎn)基因玉米的多重PCRHari k. et al,2008轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)新技術(shù)和

60、趨勢(shì)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)新技術(shù)和趨勢(shì)復(fù)合PCR檢測(cè)技術(shù)Shanghai Jiao Tong University檢測(cè)LOD可以達(dá)到0.25%,這種方法快速,靈敏,高特異性,價(jià)格低廉,方便操作,可用于日常轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測(cè)。Hari k. et al,2008Shanghai Jiao Tong University什么是基因芯片技術(shù)?什么是基因芯片技術(shù)? 簡(jiǎn)單的概括就是將大量探針?lè)肿庸潭ㄓ谥С治锷?,根?jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原理簡(jiǎn)單的概括就是將大量探針?lè)肿庸潭ㄓ谥С治锷?,根?jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原理,與標(biāo)記的樣品分子進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)的強(qiáng)度及分布進(jìn)而獲取,與標(biāo)記的樣品分子進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)的強(qiáng)度及分布進(jìn)

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