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文檔簡介

1、MEGA軟件系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法1)序列文本構(gòu)樹之前先將每個樣品的序列都分別保存為txt文本文件中，序列只包含序列字母（ATCG或氨基酸簡寫字母）。文件名名稱可以已經(jīng)您的想法隨意編輯。2)序列導(dǎo)入MEGA 5首先打開MEGA 5軟件，界面如下：然后，導(dǎo)入需要構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹的序列：1 / 15點(diǎn)擊OK如果是DNA序列，點(diǎn)擊DNA，如果是蛋白序列，點(diǎn)擊Protein。出現(xiàn)新的對話框，創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)文件如果是DNA序列，點(diǎn)擊DNA，如果是蛋白序列，點(diǎn)擊Protein。導(dǎo)入成功3)序列比對分析點(diǎn)擊W，開始比對。比對完成后刪除序列兩端不能完全對其的堿基。系統(tǒng)分析然后，關(guān)閉該窗口，在彈出的對話框中選擇保存文件

2、，文件名隨便去，比如保存為1。4)系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建以NJ為例Bootstrap選擇1000，點(diǎn)Computer，開始計(jì)算計(jì)算完畢后，生成系統(tǒng)發(fā)育樹。以下“系統(tǒng)發(fā)育樹樹的修飾”方法沿用斑竹brightfuture01的方法5)樹的修飾建好樹之后，往往需要對樹做一些美化。這個工作完全可以在word中完成，達(dá)到發(fā)表文章的要求。點(diǎn)擊image，copy to clipboard。新建一個word文檔，選擇粘貼。見下圖：在圖上點(diǎn)擊右鍵-編輯圖片，就可以對文字的字體大小，傾斜等做出修飾。見下圖：這個時候可以通過Adobe professional 對其進(jìn)行圖像導(dǎo)出：先將此word文檔打印成PDF，見下圖：將打印出來的PDF保存在桌面上，打開，如下圖：此時，點(diǎn)擊 工具，高級編輯工具，裁剪工具，如下圖所示：選擇需要的區(qū)域以刪除周圍的空白區(qū)，雙擊發(fā)育樹，會出現(xiàn)下圖：點(diǎn)擊確定，出現(xiàn)下圖 (把空邊切掉了)：點(diǎn)擊文件，另存為，在保存類型一欄中選擇 TIFF格式，點(diǎn)擊確定后會生成

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