PubMed使用詳解ppt課件

1、ppt課件.1PubMed數(shù)據(jù)庫2021-12-282 NCBI(美國生物技術(shù)信息中心）網(wǎng)址網(wǎng)址: :NCBINCBI是美國國立衛(wèi)生研究院是美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)(NIH)下屬的一個機構(gòu)。下屬的一個機構(gòu)。NCBINCBI創(chuàng)建了生物醫(yī)學領(lǐng)域中最著名的信息檢索系創(chuàng)建了生物醫(yī)學領(lǐng)域中最著名的信息檢索系統(tǒng)。統(tǒng)。2021-12-283NCBI生物醫(yī)學檢索系統(tǒng)(Entrez)PubmedPubmed：生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫；生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫；NucleotideNucleotide：核苷酸序列數(shù)據(jù)庫

2、；核苷酸序列數(shù)據(jù)庫；ProteinProtein：蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫；蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫；GenomeGenome：完整的基因組匯編；完整的基因組匯編；StructureStructure：大分子三維結(jié)構(gòu)；大分子三維結(jié)構(gòu)；PMCPMC：數(shù)字化生物醫(yī)學期刊存儲與檢索系統(tǒng)數(shù)字化生物醫(yī)學期刊存儲與檢索系統(tǒng)TaxonomyTaxonomy：分類學數(shù)據(jù)庫；分類學數(shù)據(jù)庫；OMNIOMNI；孟德爾人類遺傳學數(shù)據(jù)庫；孟德爾人類遺傳學數(shù)據(jù)庫；BooksBooks：生物醫(yī)學網(wǎng)絡(luò)版圖書。生物醫(yī)學網(wǎng)絡(luò)版圖書。2021-12-284NCBI生物醫(yī)學檢索系統(tǒng)(Entrez)2021-12-285 NCBI網(wǎng)站 (http:/

3、)2021-12-286PubMed主頁2021-12-2871. Pubmed簡介NCBINCBI于于9797年年5 5月推出，月推出，InternetInternet用戶免費檢索。用戶免費檢索。檢索全世界生物醫(yī)學檢索全世界生物醫(yī)學期刊論文期刊論文的重要工具；的重要工具；學科覆蓋范圍：學科覆蓋范圍： 臨床醫(yī)學、基礎(chǔ)醫(yī)學、護理學、牙科學、獸醫(yī)臨床醫(yī)學、基礎(chǔ)醫(yī)學、護理學、牙科學、獸醫(yī)學、藥理學、環(huán)境和公共衛(wèi)生學、藥理學、環(huán)境和公共衛(wèi)生。收錄文獻的時間范圍：收錄文獻的時間范圍： 1948-1948- Update everyday (Tuesday - Sa

4、turday) Update everyday (Tuesday - Saturday)2021-12-2881. Pubmed簡介摘要型摘要型(Abstract)(Abstract)的數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)庫, , 提供提供文獻的線索；文獻的線索；部分文獻（約部分文獻（約5%5%）提供免費全文）提供免費全文( (鏈接網(wǎng)上免費資鏈接網(wǎng)上免費資源或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)源或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)庫中的全文。庫中的全文。 2021-12-2891. Pubmed簡介來源期刊來源期刊 50005000多種多種 English English 約約4800 4800 （約占（

5、約占85%)85%) Chinese Chinese French French Japanese Japanese Italy Italy Germany Germany期刊論文發(fā)表期刊論文發(fā)表時所用的語言時所用的語言2021-12-2810PubMed中的非英文文獻中的非英文文獻2021-12-2811PubMed主頁基本檢索 主題詞檢索2021-12-28123、PubMed檢索基本檢索 簡單檢索 高級檢索主題詞檢索智能檢索2021-12-28133.1 PubMed基本檢索簡單檢索檢索詞的輸入形式：（1）單詞、短語、縮寫 如，interleukin；stomach cancer；AID

6、S（2）著者姓名：如，Smith W （3）期刊相關(guān)信息：刊名全稱、縮寫、ISSN 如，Cancer Research、JAMA12-28143.1 PubMed基本檢索檢索規(guī)則邏輯運算 and(空格)、or、not詞語檢索 “single cell”；“l(fā)iver cancer”截詞檢索 bacter*， disease? bacter disease bacteria diseases bacterium作者檢索 smith ja; jones k julia s wong; wong julia s(2002年始） 2021-12-2815例: 肝癌的化學療

7、法2021-12-2816例: 肝癌的化學療法2021-12-28173.1 PubMed基本檢索高級檢索2021-12-28183.1 PubMed基本檢索高級檢索字段限定檢索2021-12-2819 PubMed檢索字段 2021-12-28203.1 PubMed基本檢索 Limits功能1)字段限定檢索2)限定文獻類型、語種、出版日期、年齡、性別、研究對象等2021-12-2821Limits功能 （限定檢索）2021-12-2822字段限定2021-12-2823 Limits：限定文獻類型、語種、出版日期、年齡、性別、研究對象等2021-12-28243.1 PubMed基本檢索檢

8、索歷史2021-12-2825查看檢索歷史，進行邏輯運算2021-12-28263.1 PubMed基本檢索實例1 1、哮喘治療、哮喘治療( (限定題目字段限定題目字段) )的英文綜述文獻的英文綜述文獻2 2、近五年來中國研究者發(fā)表的有關(guān)、近五年來中國研究者發(fā)表的有關(guān)AidsAids病研究的文病研究的文獻獻2021-12-28273.2 PubMed主題詞檢索(MeSH）2021-12-2828什么是主題詞(MeSH詞)?主題詞是經(jīng)人工主題詞是經(jīng)人工規(guī)范化處理規(guī)范化處理的最能表達文章主題概的最能表達文章主題概念的語詞。所謂規(guī)范化處理，就是在文獻存儲時，念的語詞。所謂規(guī)范化處理，就是在文獻存儲時

9、，對文獻中的同義詞、近義詞、多義詞等加以嚴格的對文獻中的同義詞、近義詞、多義詞等加以嚴格的控制和規(guī)范，使得同一主題概念的文獻相對集中在控制和規(guī)范，使得同一主題概念的文獻相對集中在一個主題詞下。一個主題詞下。 主題詞主題詞 關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞 NeoplasmsNeoplasms neoplasm neoplasm、tumorstumors、tumortumor、cancercancer AspirinAspirin aspirin aspirin、acetylsalicylic acidacetylsalicylic acid、 micristin micristin、 solprinsolprin

10、2021-12-2829 Medical Subject Headings, MeSH字順表字順表(2(2萬多個醫(yī)學詞匯萬多個醫(yī)學詞匯) ) 如如:aspirin,hepatitis,asthma:aspirin,hepatitis,asthma等等 樹狀結(jié)構(gòu)表樹狀結(jié)構(gòu)表（分類表）分類表） 1616大類大類副主題詞表（副主題詞表（8080多個副主題詞）多個副主題詞）2021-12-2830MeSH字順表2021-12-2831MeSH樹狀結(jié)構(gòu)(Tree Structures)2021-12-2832MeSH副主題詞表(Subheadings)Abnormalities、Administrati

11、on & Dosage、Adverse Effects、Analysis、Anatomy & Histology、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、DiagnosisDiagnosis use、Diet therapy、Drug therapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Psychology、Surgery、Therapeutic Use、Therapy.2021

12、-12-2833MeSH的標引和檢索MeSH應(yīng)用 PubMed（Medline） 中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(CBMdisc) 醫(yī)學搜索引擎標引人員根據(jù)文章的內(nèi)容，給出多個MeSH詞，以確切描述一篇文章內(nèi)容的重點。檢索人員根據(jù)檢索需求，選擇相關(guān)MeSH詞進行檢索。2021-12-2834例:肝癌的手術(shù)治療2021-12-2835例:肝癌的手術(shù)治療2021-12-28362021-12-28372021-12-28382021-12-2839MeSH詞檢索的特點不必考慮自由詞的各種變化形式，提高檢索效不必考慮自由詞的各種變化形式，提高檢索效率。率?？梢院苋菀椎貦z索寬廣的概念，提高查全率；可以很容易地

13、檢索寬廣的概念，提高查全率；MeSHMeSH詞一般都反映了記錄較為重要的內(nèi)容，具詞一般都反映了記錄較為重要的內(nèi)容，具有較高的檢準率；有較高的檢準率；可以選用相關(guān)的副主題詞進行組配，對檢索進可以選用相關(guān)的副主題詞進行組配，對檢索進行限定。行限定。2021-12-2840舉例:消化系統(tǒng)疾病的CT診斷擴展主要主題2021-12-2841 3.3 PubMed的智能檢索2021-12-2842詞語自動匹配，優(yōu)化檢索策略自由詞和MeSH詞聯(lián)合2021-12-2843PubMed智能檢索原理對于輸入檢索框中的非限定檢索詞，系統(tǒng)將依次到MeSH詞轉(zhuǎn)換表、刊名轉(zhuǎn)換表、短語表以及作者索引表中進行詞語匹配查找。檢

14、索詞加入有些限定（如字段限止, 引號等），自動匹配檢索功能關(guān)閉。 例： heart diseaseti“l(fā)iver cancer”2021-12-2844自動匹配檢索功能關(guān)閉2021-12-28454. PubMed檢索結(jié)果處理Display(Display(顯示顯示) )Send to(Send to(輸出輸出) )2021-12-2846Display(檢索結(jié)果顯示)2021-12-2847Send to(檢索結(jié)果輸出)2021-12-2848Clipboard剪貼板可集中存放一次或多次檢索結(jié)果當中的選定記錄，方便用戶集剪貼板可集中存放一次或多次檢索結(jié)果當中的選定記錄，方便用戶集中打印、下

15、載文獻。剪貼板中可存的最多記錄為中打印、下載文獻。剪貼板中可存的最多記錄為500500條，如果八小時內(nèi)條，如果八小時內(nèi)無作何操作，記錄將自動消失。無作何操作，記錄將自動消失。2021-12-28495. PubMed鏈接Related ArticlesFull Text2021-12-2850Related Articles(相關(guān)文獻鏈接)2021-12-2851Full Text(全文鏈接)網(wǎng)上免費資源 或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)庫中的全文 2021-12-28526. My NCBI(個性化功能) 2021-12-28536. My NCBI(個性化功能)2021-12-2

16、8546. My NCBIMy Saved Data2021-12-28556. My NCBI Save Search2021-12-28566. My NCBI Save SearchEmail發(fā)送新文獻跟蹤專題最新文獻2021-12-2857通過My NCBI查看新文獻2021-12-28586. My NCBISearch Filters2021-12-28596. My NCBISearch Filters2021-12-28602021-12-28616. My NCBIPreferences2021-12-28627. 其他輔助工具2021-12-28637.1 Journal

17、Database可以從期刊的名稱可以從期刊的名稱( (全稱或縮寫全稱或縮寫) )、ISSNISSN號、刊名中的任意詞來查找期刊信息。號、刊名中的任意詞來查找期刊信息。2021-12-28642021-12-2865專為臨床醫(yī)生設(shè)計的查找有關(guān)某一疾病的治療、診斷、病因、預(yù)后等與臨床密切相關(guān)問題的文獻。7.2 Clinical Queries檢索系統(tǒng)評價(循證醫(yī)學證據(jù))2021-12-28667.3 Citation Matcher 引文匹配器引文匹配器可通過已知的刊名、日期、卷、引文匹配器可通過已知的刊名、日期、卷、期、論文首頁碼、作者名等任一項信息查找期、論文首頁碼、作者名等任一項信息查找論文

18、的詳細信息。論文的詳細信息。 經(jīng)常用于核對參考文獻經(jīng)常用于核對參考文獻2021-12-2867查找引文信息 1、Gene Therapy, 1999, and the title words, mitochondrial gene therapy. 2、Arthritis Rheum, 1982, page 1271 3、V. Lee, Biochemical Pharmacology, vol. 29, issue 14 4、A powder formulation of measles vaccine for aerosol delivery2021-12-28682021-12-28692021-12-2870Tutorial和Help2021-12-28712021-12