分子生物學(xué)復(fù)習(xí)重點(diǎn)

分子生物學(xué)復(fù)習(xí)重點(diǎn)第一章1、蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)稱為構(gòu)象(conformation)，指的是蛋白質(zhì)分子中所有原子在三維空間中的排布，并不涉及共價(jià)鍵的斷裂和生成所發(fā)生的變化。2、維持和穩(wěn)定蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的因素有共價(jià)鍵(二硫鍵)和次級鍵，次級鍵有4種類型，即離子鍵、氫鍵、疏水性相互作用和范德瓦力。3、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指肽鏈中局部肽段的構(gòu)象，它們是完整肽鏈構(gòu)象(三級結(jié)構(gòu))的結(jié)構(gòu)單元，是蛋白質(zhì)復(fù)雜的立體結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)，因此二級結(jié)構(gòu)也可以稱為構(gòu)象單元。α螺旋、β折疊是常見的二級結(jié)構(gòu)。4、一些肽段有形成α螺旋和β折疊兩種構(gòu)象的可能性(或形成勢)，這類肽段被稱為兩可肽。5、兩個(gè)或幾個(gè)二級結(jié)構(gòu)單元被連接肽段連接起來，進(jìn)一步組合成有特殊幾何排列的局域立體結(jié)構(gòu)，稱為超二級結(jié)構(gòu)（介于二、三級結(jié)構(gòu)間）。超二級結(jié)構(gòu)的基本組織形式有αα，βαβ和ββ等3類6、蛋白質(zhì)家族(family)：一類蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)有30％以上同源性，或一級結(jié)構(gòu)同源性很低，但它們的結(jié)構(gòu)和功能相似，它們也屬于同一家族。例如球蛋白的氨基酸序列相差很大，但屬于同一家族。超家族(superfamily)：有些蛋白質(zhì)家族之間，一級結(jié)構(gòu)序列的同源性較低，但在許多情況下，它們的結(jié)構(gòu)和功能存在一定的相似性。這表明它們可能存在共同的進(jìn)化起源。這些蛋白質(zhì)家族屬于同一超家族。7、結(jié)構(gòu)域是一個(gè)連貫的三維結(jié)構(gòu)，是可互換并且半獨(dú)立的功能單位，在真核細(xì)胞中由一個(gè)外顯子編碼，由至少40個(gè)以上多至200個(gè)殘基構(gòu)成最小、最緊密也最穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)，作為結(jié)構(gòu)和功能單位，會重復(fù)出現(xiàn)在同一蛋白質(zhì)或不同蛋白質(zhì)中。8、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)所提供的信息有哪些？α螺旋、β折疊各自的特點(diǎn)？第二章1、DNA是由脫氧核糖核苷酸組成的長鏈多聚物，是遺傳物質(zhì)。具有下列基本特性：①具有穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)，能進(jìn)行復(fù)制，特定的結(jié)構(gòu)能傳遞給子代；②攜帶生命的遺傳信息，以決定生命的產(chǎn)生、生長和發(fā)育；③能產(chǎn)生遺傳的變異，使進(jìn)化永不枯竭。2、DNA鏈的方向總是理解為從5’—P端到3’—OH端。DNA的一級結(jié)構(gòu)實(shí)際上就是DNA分子內(nèi)堿基的排列順序。3、DNA是雙螺旋結(jié)構(gòu)：主鏈由脫氧核糖和磷酸基團(tuán)以3’，5’—磷酸二酯鍵交互連接構(gòu)成的，在雙螺旋的外側(cè)，堿基在內(nèi)側(cè)，堿基必須配對。一條鏈繞著另一條鏈旋轉(zhuǎn)、盤繞，一條鏈上的嘌呤與另一條鏈上的嘧啶相互配對，嘌呤與嘧啶以氫鍵保持在一起。4、雙螺旋DNA熔解成單鏈的現(xiàn)象稱為DNA變性。已經(jīng)變性的DNA在一定條件下重新恢復(fù)雙鏈的過程稱為復(fù)性。5、染色質(zhì)是以雙鏈DNA為骨架，與組蛋白(histon)、非組蛋白(non-histon)以及少量的各種RNA等共同組成絲狀結(jié)構(gòu)。在染色質(zhì)中，DNA和組蛋白的組成非常穩(wěn)定，非組蛋白和RNA隨細(xì)胞生理狀態(tài)不同而有變化。6、常染色質(zhì)是在細(xì)胞間期核內(nèi)染色體折疊壓縮程度較低，處于伸展?fàn)顟B(tài)，堿性染性著色較淺而均勻的那些染色質(zhì)。主要是單一拷貝和中度重復(fù)序列。異染色質(zhì)是在細(xì)胞間期核內(nèi)染色質(zhì)壓縮程度較高，處于凝集狀態(tài)，堿性染料著色較深的部分。7、核小體是構(gòu)成真核生物染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位，是DNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成的緊密結(jié)構(gòu)形式。8、RNA的種類及其各自的特點(diǎn)？第三章基因和基因組1、基因被定義為轉(zhuǎn)錄功能單位，是編碼一種可擴(kuò)散產(chǎn)物的一段DNA序列，其產(chǎn)物可以是蛋白質(zhì)或RNA。一個(gè)完整的基因應(yīng)該由兩部分組成，即編碼區(qū)和調(diào)控區(qū)。2、基因組是一種生物染色體內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和，包括構(gòu)成基因和基因之間區(qū)域的所有DNA。所謂總和，還應(yīng)該指該物種的不同DNA功能區(qū)域在DNA分子上結(jié)構(gòu)分布和排列的情況?；蚪M以及基因一般以DNA的長度和序列表示。3、病毒基因組的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)：（１）與細(xì)菌相比較，病毒的基因組很小，所含遺傳信息量較小，只能編碼少數(shù)的蛋白質(zhì)。（２）病毒基因組由DNA或RNA組成。核酸的結(jié)構(gòu)可以是單鏈或雙鏈、閉合環(huán)狀或線狀分子。（３）常有基因重疊現(xiàn)象，即同一DNA分子序列可以編碼2種或3種蛋白質(zhì)分子。4、細(xì)菌基因組的一般特點(diǎn)1）基因組通常僅由一條環(huán)狀雙鏈DNA分子組成。但現(xiàn)發(fā)現(xiàn)有越來越多的線形基因組。2）只有一個(gè)復(fù)制起始點(diǎn)。3）有操縱子的結(jié)構(gòu)。數(shù)個(gè)相關(guān)（參與一個(gè)生化過程）的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起，受同一調(diào)控區(qū)調(diào)節(jié)，合成多順反子mRNA。4）編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因是單拷貝的，但rRNA基因往往是多拷貝的。5）非編碼的DNA所占比例少，類似病毒基因組。6）基因組DNA具有多種調(diào)控區(qū)，如復(fù)制起始區(qū)、復(fù)制終止區(qū)、轉(zhuǎn)錄啟動子、轉(zhuǎn)錄終止區(qū)等特殊序列。7）與真核生物類似，具有可移動的DNA序列。5、真核生物基因組特點(diǎn)（1）基因組的分子量大。低等真核生物大約107-108bp,而高等真核生物為5×108-1010bp（2）真核生物細(xì)胞往往有很多染色體，一般呈線狀。每個(gè)染色體DNA有很多復(fù)制起始點(diǎn)。（3）細(xì)胞核DNA與蛋白質(zhì)穩(wěn)定地結(jié)合成染色質(zhì)的復(fù)雜結(jié)構(gòu)。染色質(zhì)內(nèi)除了含有DNA和組蛋白外，還有大量非組蛋白。（4）由于存在核膜，細(xì)胞被分隔成細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)，因此，在基因表達(dá)中，轉(zhuǎn)錄和翻譯在時(shí)間和空間上是分隔的，不偶聯(lián)的。（５）基因組的大量序列是非編碼序列，有大量重復(fù)序列。（6）真核生物的蛋白質(zhì)基因往往是單拷貝存在，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是單順反子mRNA。（7）存在一些可移動的DNA序列。（8）絕大多數(shù)真核生物基因含有內(nèi)含子，因而基因編碼區(qū)是不連續(xù)的。（9）真核生物基因內(nèi)部也可能含有大量的重復(fù)序列。6、基因家族：一組功能類似、結(jié)構(gòu)具有同源性的基因稱為基因家族?；蚣易宓姆诸愑卸喾N方式?；蚣易甯鞒蓡T在結(jié)構(gòu)上非常類似，具有保守性，如rRNA基因家族，但基因之間的間隔區(qū)可以有很大的長度差異和序列差異。重要的基因家族：rRNA基因家族、5SrRNA基因、組蛋白基因家族、珠蛋白基因家族、生長激素基因家族、超基因。7、超基因(supergene)是指一組由多基因和單基因組成的更大的基因家族。在高等真核細(xì)胞中，一個(gè)基因簇內(nèi)含有數(shù)百個(gè)功能相關(guān)的基因，它們可能是由基因擴(kuò)增后結(jié)構(gòu)上輕微變化而產(chǎn)生的，這些基因的結(jié)構(gòu)有程度不等的同源性，功能上仍保持原始基因的基本功能，或者進(jìn)化成具有相關(guān)而不同的新功能，這樣的一簇基因稱為超基因家族。有免疫球蛋白超基因家族、核受體超基因家族、細(xì)胞因子超基因家族等。8、在初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物hnRNA加工產(chǎn)生成熟的mRNA時(shí)，被切除的非編碼序列稱為內(nèi)含子(intron)。在成熟的mRNA或蛋白質(zhì)中存在的序列稱為外顯子(exon)。基因的不連續(xù)性是真核生物基因所特有的，但不是所有真核生物基因都一定具有這種不連續(xù)性。9、內(nèi)含子的功能：(1)含有可閱讀框架(ORF)，內(nèi)含子的ORF可能編碼酶或蛋白質(zhì)，其中包括逆轉(zhuǎn)錄酶、成熟酶。(2)含有各種剪接信號碼，內(nèi)含子編碼的成熟酶直接參與內(nèi)含子本身的剪接功能。(3)對基因表達(dá)有影響，內(nèi)含子對基因表達(dá)在多個(gè)水平上施加影響。內(nèi)含子中的增強(qiáng)子序列增加了基因轉(zhuǎn)錄的起始反應(yīng)。10、人類基因組計(jì)劃(humangenomicproject，HGP)的總體目標(biāo)是要完成人類全部24條染色體3×109bp序列的分析。具體包括：①人類基因組作圖(遺傳學(xué)圖譜、物理圖譜)。②對基因組DNA進(jìn)行切割和克隆。③測定基因組的全部DNA序列。④基因的鑒定。⑤信息系統(tǒng)的建立、信息的儲存和處理以及相應(yīng)軟件的開發(fā)。11、結(jié)構(gòu)基因組學(xué)(structualgenomics)以全基因組測序?yàn)槟繕?biāo)的基因結(jié)構(gòu)研究，闡述基因組中基因的位置和結(jié)構(gòu)，為基因功能的研究奠定基礎(chǔ)。12、功能基因組學(xué)(functionalgenomics)是利用結(jié)構(gòu)基因組學(xué)提供的信息，以大規(guī)模實(shí)驗(yàn)方法及統(tǒng)計(jì)與計(jì)算機(jī)分析，全面系統(tǒng)地分析全部基因的功能。13、蛋白質(zhì)組(proteome)是一個(gè)基因組在特定細(xì)胞內(nèi)所表達(dá)的蛋白質(zhì)。對于一種生物來說，它的基組DNA基本上是恒定的，但蛋白質(zhì)組是動態(tài)的。也就是不同組織的細(xì)胞中蛋白質(zhì)組是不同的，在同一細(xì)胞的不同生長狀態(tài)、病理狀態(tài)下也是不一樣的。蛋白質(zhì)組只指某一特定時(shí)間內(nèi)的蛋白質(zhì)集合體。14、生物信息學(xué)是用數(shù)理和信息科學(xué)的觀點(diǎn)、理論和方法去研究生命現(xiàn)象，組織和分析呈指數(shù)增長的生物學(xué)數(shù)據(jù)的一門學(xué)科。生物信息學(xué)位于生物、計(jì)算機(jī)、數(shù)學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域的交叉點(diǎn)上，其研究目標(biāo)是揭示“基因組信息結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性及遺傳語言的根本規(guī)律”。生物信息學(xué)包含了基因組信息學(xué)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬和藥物設(shè)計(jì)等3個(gè)組成部分。目前的研究包括下面幾個(gè)方面：①相關(guān)信息的收集、儲存、管理與提供。②新基因的發(fā)現(xiàn)和鑒定。③非編碼區(qū)的信息結(jié)構(gòu)分析。④大規(guī)?；蚬δ鼙磉_(dá)譜的分析。⑤蛋白質(zhì)分子空間結(jié)構(gòu)預(yù)測、模擬和分子設(shè)計(jì)。⑥藥物開發(fā)。第四章生物大分子的相互作用1、生物大分子之間特異性地、可逆解離地形成復(fù)合物的能力是生命活動的基礎(chǔ)，這種特異性的、可逆的相互作用被稱為生物分子的識別。2、參與大分子相互作用的非共價(jià)鍵類型(1)疏水性相互作用，(2)范德瓦力，(3)氫鍵，(4)靜電相互作用。3、參與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)域有：BRCT(breastcancersusceptibilitygeneCterminus)結(jié)構(gòu)域、Lim結(jié)構(gòu)域、SH3結(jié)構(gòu)域、SH2結(jié)構(gòu)域、Bromo結(jié)構(gòu)域、POZ結(jié)構(gòu)域、WW結(jié)構(gòu)域、錨蛋白重復(fù)序列(ankyrinrepeat，ANK)的結(jié)構(gòu)域、PH結(jié)構(gòu)域、環(huán)指結(jié)構(gòu)域(ringfingerdomain)。4、蛋白質(zhì)與RNA的識別以“間接讀出”(indirectreadout)機(jī)制為主。所有的RNA結(jié)構(gòu)，包括線狀序列、發(fā)夾、膨泡、內(nèi)環(huán)、假結(jié)、雙螺旋等都可以作為蛋白質(zhì)專一性識別的靶結(jié)構(gòu)。5、各種DNA結(jié)合蛋白，特別是轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactors)都含有與DNA相互作用的區(qū)域，稱為DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA-bindingdomain)，簡稱結(jié)合域。6、對基因進(jìn)行調(diào)節(jié)、控制的蛋白質(zhì)，如各種普遍性(或基礎(chǔ))轉(zhuǎn)錄因子、基因調(diào)控因子，相對于作用于它的靶位點(diǎn)DNA序列而言，廣義地稱為反式作用因子(trans-actingfactors)。7、鋅指結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)是自然界中廣泛分布的一類含鋅蛋白質(zhì)，構(gòu)成了一個(gè)超家族。鋅指結(jié)構(gòu)家族蛋白，以其形狀和結(jié)合鋅的復(fù)雜性，特別是鋅指四面體結(jié)構(gòu)，可以分為C2H2，C4和C6等幾種類型。8、亮氨酸周期重復(fù)不在于形成一個(gè)疏水面，而在于兩個(gè)蛋白質(zhì)的兩個(gè)α螺旋之間，依靠亮氨酸周期性側(cè)鏈交錯(cuò)相插，螺旋靠攏，在疏水作用之下形成一個(gè)穩(wěn)定的非共價(jià)結(jié)合的拉鏈結(jié)構(gòu)，即所謂的亮氨酸拉鏈(leucinezipper)。第五章基因工程原理1、基本概念（1）基因工程：是用酶學(xué)方法，把天然的或人工合成的、同源或異源的DNA片段與具有復(fù)制能力的載體分子（如質(zhì)粒、噬菌體、病毒等）形成重組DNA分子，再導(dǎo)入不具有這種重組分子的宿主細(xì)胞內(nèi)，進(jìn)行持久而穩(wěn)定的復(fù)制、表達(dá)，使宿主細(xì)胞產(chǎn)生外源DNA或其蛋白質(zhì)分子。（2）基因組DNA文庫（P157）：是某一生物體的染色體全部DNA序列被隨機(jī)切割成適當(dāng)大小的片段后，插入到載體內(nèi)構(gòu)成的DNA文庫。（3）cDNA基因文庫（P160）：一群含有重組DNA的細(xì)菌，質(zhì)?；蚴删w的克隆，來自某細(xì)胞類型全部的mRNA。（4）扣除文庫（P163）：將兩重不同組織來源的mRNA進(jìn)行比較，用扣除雜交排除相同部分，即共同表達(dá)的那部分mRNA，選出剩余有差異的、特異表達(dá)的mRNA，構(gòu)建成cDNA文庫，稱為cDNA扣除文庫。（5）分子雜交（P171）：指具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定條件下（適宜的溫度和離子強(qiáng)度）可按堿基配對的原則退火形成雙鏈的過程。（6）PCR技術(shù)原理：PCR技術(shù)是利用兩種寡核苷酸引物，分別與雙鏈DNA片段的兩端互補(bǔ)，形成DNA聚合酶反應(yīng)中的模板和引物的關(guān)系。（7）物理圖譜：DNA片段上限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)的圖譜，表示各種限制性內(nèi)切酶識別位點(diǎn)在DNA序列上的線性排列。（8）Southern雜交：用于檢測DNA片段混合物中存在特定序列的技術(shù)。又稱Southern印跡。檢驗(yàn)的目的DNA通常用一種或一種以上的限制性內(nèi)切酶酶切，得到各種特定長度的片段，在凝膠電泳中依長度分成條帶，DNA片段原位地轉(zhuǎn)移到NC膜或尼龍膜上。然后，膜上的DNA片段與標(biāo)記的探針DNA進(jìn)行雜交，已雜交的DNA片段可通過標(biāo)記的探針進(jìn)行放射性或顯色反應(yīng)定位。（9）Northern雜交（P156）：從真核生物的特定組織或發(fā)育階段的細(xì)胞分離出全部RNA或mRNA，用變性凝膠電泳分離后轉(zhuǎn)移到NC膜上。用變性的探針DNA對NC膜上的RNA進(jìn)行雜交。從顯影或顯色反應(yīng)判斷陽性雜交的存在。（10）亞克?。≒156）：當(dāng)載體中插入的外源DNA片段太大，難以作某些操作或分析時(shí)，需要對該克隆片段作些再切割，將大的DNA片段酶切成較小的片段，然后再與另外的新載體重組，并進(jìn)行轉(zhuǎn)化程序，這個(gè)過程稱為亞克隆。2、思考題（1）、PCR技術(shù)原理的是什么？179答：PCR技術(shù)是利用兩種寡核苷酸引物，分別與雙鏈DNA片段的兩端互補(bǔ)，形成DNA聚合酶反應(yīng)中的模板和引物的關(guān)系，這是PCR技術(shù)的核心。PCR聚合酶反應(yīng)體系的一些重要條件包括：模板、一對寡核苷酸引物、4種底物dNTP和TapDNA聚合酶。反應(yīng)分為3步：雙鏈模板DNA變性、退火和鏈的延伸。基因工程中工具酶的種類？P141答：限制性內(nèi)切酶、DNA連接酶、DNA聚合酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、RNA聚合酶。DNA聚合酶的特點(diǎn)？P142答：①需要提供合成模板；②不能起始新的DNA鏈，必須要有引物提供3'－OH；③合成的方向都是5'→3';④除聚合DNA外還有其它功能;⑤以脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)為前體催化合成DNA。熟悉基因工程的載體的種類和特點(diǎn)？答：①種類：質(zhì)粒載體，λ噬菌體載體，M13噬菌體載體，柯斯質(zhì)粒載體，細(xì)菌人工染色體，酵母人工染色體，動物病毒載體②特點(diǎn)：◆載體DNA是單個(gè)復(fù)制單元，在宿主細(xì)胞內(nèi)應(yīng)具有獨(dú)立復(fù)制能力；◆分子量盡可能的小，便于細(xì)胞中分離純化，離體條件下操作；◆含有多種限制行內(nèi)切酶的單一切點(diǎn)；◆載體內(nèi)有不影響其復(fù)制，生長的非必要區(qū)域；◆具有多種選擇行標(biāo)記?；蚬こ梯d體的基本要求和特點(diǎn)P142①基本要求：◆載體能夠獨(dú)立復(fù)制,具有復(fù)制起點(diǎn)?！魬?yīng)具有靈活的克隆位點(diǎn)和方便的篩選標(biāo)記?！魬?yīng)具有很強(qiáng)的啟動子，能為大腸桿菌RNA聚合酶所識別。◆應(yīng)具有阻遏子，使啟動子受到控制，只有當(dāng)誘導(dǎo)時(shí)才能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄?！魬?yīng)具有很強(qiáng)的終止子，只轉(zhuǎn)錄克隆的基因，所產(chǎn)生的mRNA較為穩(wěn)定。②特點(diǎn)：1.載體DNA是單個(gè)復(fù)制單元，在宿主細(xì)胞內(nèi)應(yīng)具有DNA獨(dú)立復(fù)制能力；2.分子量盡可能的小，以便容易從細(xì)胞中分離純化，便于離體條件下操作；3.含有多種限制性內(nèi)切酶的單一切點(diǎn)。在切點(diǎn)內(nèi)可以與外源DNA進(jìn)行連接、重組；4.載體內(nèi)有不影響其復(fù)制、生長的非必要區(qū)域，在此區(qū)域內(nèi)可以插入、接受外源DNA，外源DNA與載體分子一起復(fù)制、擴(kuò)增；5.具有多種選擇性標(biāo)志，如營養(yǎng)缺陷型、抗藥性、形成噬菌斑的能力、外源性蛋白的產(chǎn)生等，作為區(qū)分重組的轉(zhuǎn)化子與非重組轉(zhuǎn)化子的指標(biāo)。③基因工程的基本步驟P140目的DNA的獲得；2.載體的選擇與構(gòu)建；3.目的DNA與載體的重組；4.重組DNA的轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染等，從而導(dǎo)入宿主細(xì)胞；5.篩選含有重組DNA分子的宿主細(xì)胞，獲得克隆。（6）DNA文庫構(gòu)建的基本步驟？P158λ載體DNA和雙臂的制備提取大分子DNA和制備大片段載體與外源DNA重組重組DNA的離體包裝重組DNA的轉(zhuǎn)化第六章1、名詞解釋DNA半保留復(fù)制：在DNA復(fù)制時(shí)，子代雙鏈DNA中，一條鏈來自親代，而另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?。?fù)制叉：復(fù)制起始點(diǎn)要形成一個(gè)特殊的叉形結(jié)構(gòu)，是復(fù)制有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)組裝成復(fù)合物和新鏈合成的部位。復(fù)制子：從復(fù)制起始點(diǎn)到終止點(diǎn)的區(qū)域?yàn)橐粋€(gè)復(fù)制子。半不連續(xù)復(fù)制：在復(fù)制叉上發(fā)生一條新鏈為連續(xù)合成，另一條新鏈為不連續(xù)合成的復(fù)制機(jī)制，稱為半不連續(xù)復(fù)制。前導(dǎo)鏈：在DNA復(fù)制時(shí)，復(fù)制叉上一條連續(xù)合成的鏈。后滯鏈：在DNA復(fù)制時(shí)，復(fù)制叉上一條不連續(xù)合成的鏈。岡崎片段：DNA復(fù)制時(shí)后滯鏈所合成的短片段。2、思考題1.DNA復(fù)制的特征？P195答：①核酸生物合成的一般規(guī)則；②半保留復(fù)制；③以復(fù)制子為單位進(jìn)行；④復(fù)制的起始點(diǎn)和終止點(diǎn)；⑤具有復(fù)制叉結(jié)構(gòu)和復(fù)制方向；⑥復(fù)制的模型。2.復(fù)制過程的幾個(gè)階段？（P216）答：第一階段，親代DNA分子超螺旋構(gòu)象的松弛及螺旋的解旋，使復(fù)制的模板展現(xiàn)出來；第二階段，是復(fù)制的引發(fā)過程，引物在5→3方向的合成；第三階段，是DNA鏈的延伸過程，在引物RNA合成的基礎(chǔ)上，轉(zhuǎn)換成DNA鏈的5→3方向的合成；第四階段，是終止過程，復(fù)制進(jìn)行到終止位點(diǎn)ter，有蛋白因子Tus參與，復(fù)制即終止。線粒體DNA的復(fù)制模式？答：DNA鏈延伸的幾個(gè)階段？(P223)答：①雙螺旋DNA的不斷解螺旋；②前導(dǎo)鏈DNA的合成；③后滯鏈模板不斷引發(fā)，合成新的RNA產(chǎn)物；④在RNA引物的基礎(chǔ)上由DNA聚合酶合成岡崎片段；⑤除去RNA引物，填補(bǔ)空隙，岡崎片段連接成后滯鏈。5.真核與原核生物的復(fù)制相同點(diǎn)與差異之處？（P230）答：相同之處：都是半保留的和半不連續(xù)的復(fù)制，復(fù)制過程都有引發(fā)、延伸和終止三個(gè)階段，要求有模板以及有相應(yīng)功能的DNA聚合酶和蛋白質(zhì)參與。不同之處：①真核的每條染色體有多個(gè)復(fù)制起始位點(diǎn)，而原核只有一個(gè)起始位點(diǎn)；②真核染色體在全部復(fù)制完成之前，各個(gè)起始點(diǎn)上不能開始新一輪復(fù)制，受到一種復(fù)制的調(diào)控；而原核DNA的起始點(diǎn)可以連續(xù)地開始新的復(fù)制事件，表現(xiàn)為一個(gè)復(fù)制子上有多個(gè)復(fù)制叉存在。6.DNA損傷修復(fù)的種類？（P247）答：直接修復(fù)、切除修復(fù)、重組修復(fù)、SOS修復(fù)。7.原核DNA聚合酶的一般特性？（P211）答：有單鏈DNA為模板，具有3-OH基的引物，合成的方向總是5-3，由模板決定加上去何種脫氧核苷酸，從引物的3-OH端逐個(gè)延長。第七章1、名詞解釋轉(zhuǎn)錄(P251)：以DNA為模板，合成RNA的信息傳遞過程稱為轉(zhuǎn)錄。反義鏈(P252)：在DNA雙鏈中，被RNA聚合酶“閱讀”、含有合成RNA分子信息的這條鏈稱為“模板鏈”或反義鏈。上游順式作用元件：指同一DNA分子中具有轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能的在復(fù)制起始點(diǎn)前的特異DNA序列。啟動子(P257)：是基因DNA中一段特定的核苷酸序列，是RNA聚合酶在轉(zhuǎn)錄起始時(shí)對模板DNA的識別位點(diǎn)和結(jié)合位點(diǎn)，基因轉(zhuǎn)錄的開始部位。終止子(P269)：是基因DNA分子中決定轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物3'-OH端、釋放出已合成RNA分子的位點(diǎn)。2、思考題1.原核生物和真核生物基因轉(zhuǎn)錄的差異？答：①原核生物只有一種RNA聚合酶負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄所有類型的基因，而真核生物有三種以上的RNA聚合酶，負(fù)責(zé)不同基因類型的轉(zhuǎn)錄，合成不同類型的RNA，在細(xì)胞核內(nèi)的位置也不相同。②轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的差別。真核生物的初始產(chǎn)物很長，包含有內(nèi)含子序列，成熟mRNA只占其中的小部分。而原核生物的初始產(chǎn)物大多數(shù)為編碼序列，與蛋白質(zhì)序列成線性關(guān)系。③真核生物轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)歷加工、修飾過程，即內(nèi)含子剪接。5'端帽化和3'多聚A化。這是真核生物中初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的成熟過程，而原核生物的初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物直接是成熟的mRNA，很少需要成熟過程。④與基因結(jié)構(gòu)相吻合，原核生物mRNA是多順反子；大多數(shù)真核生物mRNA是單順子結(jié)構(gòu)。一般而言，一個(gè)真核的mRNA分子編碼一個(gè)蛋白質(zhì)分子。⑤原核細(xì)胞中，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物直接可以成為蛋白質(zhì)合成的模板，因而一邊轉(zhuǎn)錄合成mRNA，一邊翻譯合成蛋白質(zhì)。熟悉原核生物啟動子的結(jié)構(gòu)與功能、其中的－35區(qū)、－10區(qū)等的結(jié)構(gòu)？①域中的基序并與之結(jié)合，啟動轉(zhuǎn)錄的起始。一般將DNA上的轉(zhuǎn)錄位點(diǎn)定位+1來排序，其下游（右側(cè)）為正值，其上游（左側(cè)）為負(fù)值。原核生物不同基因的啟動子雖然結(jié)構(gòu)也有一定的差異，但明顯具有共同的特點(diǎn)?！艚Y(jié)構(gòu)典型，都含有識別（R），結(jié)合（B）和起始（I）三個(gè)位點(diǎn)；◆序列保守，如-35序列，-10序列結(jié)構(gòu)都十分保守；◆位置和距離都比較恒定；◆直接和多聚酶相結(jié)合；◆常和操縱子相鄰；◆都在其控制基因的5′端；◆決定轉(zhuǎn)錄的啟動和方向。②-35序列又稱為Sextama盒,其保守序列為TTGACA，與-10序列相隔16～19bp。其功能是：◆為RNA聚合酶的識別位點(diǎn)。RNA聚合酶的核心酶只能起到和模板結(jié)合和催化的功能，并不能識別-35序列，只有σ亞基才能識別-35序列，為轉(zhuǎn)錄選擇模板鏈?！?35序列和-10序列的距離是相當(dāng)穩(wěn)定的，過大或過小都會降低轉(zhuǎn)錄活性。這可能是因?yàn)镽NA聚合酶本身的大小和空間結(jié)構(gòu)有關(guān)。③-10序列也稱為Pribnow框盒,其保守序列為TATAAT，位于-10bp左右，其中3′端的“T”十分保守。A,T較豐富，易于解鏈。它和轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)“I”一般相距5bp。其功能是：◆與RNA聚合酶緊密結(jié)合；◆形成開放啟動復(fù)合體；◆使RNA聚合酶定向轉(zhuǎn)錄。3.原核生物轉(zhuǎn)錄的起始分幾個(gè)階段？（P261）答：①核心酶在σ因子參與下接觸到DNA上，形成特異性結(jié)合；②起始識別，RNA聚合酶與啟動子結(jié)合，形成封閉性起始復(fù)合物；③從封閉性轉(zhuǎn)變?yōu)殚_放性起始復(fù)合物，酶結(jié)合在－10序列，啟動子活化，并解開雙鏈結(jié)構(gòu)，暴露模板鏈；④形成DNA－酶－底物NTP的三元起始復(fù)合物，酶移動到轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，在起始位點(diǎn)加上開頭的幾個(gè)核苷三磷酸。4.真核生物基因類型II啟動子的結(jié)構(gòu)與功能？（P281）答：結(jié)構(gòu)：①轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，是RNA合成的開始位置。②基本啟動子，基本啟動子和Inr一起構(gòu)成核心啟動子。③轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)下游元件。④轉(zhuǎn)錄起始上游元件。5.真核生物基因轉(zhuǎn)錄的一般規(guī)律？P271答：①典型的真核基因轉(zhuǎn)錄單元為單順反子，而原核基因轉(zhuǎn)錄單元為多順反子。②真核生物的RNA聚合酶高度分工。③轉(zhuǎn)錄的正常進(jìn)行，除了需要RNA聚合酶以外，還需要許多蛋白質(zhì)因子的參與。④真核基因DNA的順式作用元件要比原核基因復(fù)雜得多。⑤真核基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控以正調(diào)控為主。第八章轉(zhuǎn)錄后加工名詞解釋轉(zhuǎn)錄后加工(P297)：原核生物的tRNA，rRNA轉(zhuǎn)錄成一個(gè)很長的RNA分子后，在酶和蛋白質(zhì)參與下，切斷、加工成為成熟分子。多順反子：在原核細(xì)胞中，通常是幾種不同的mRNA連在一起，相互之問由一段短的不編碼蛋白質(zhì)的間隔序列所隔開，這種mRNA叫做多順反子mRNA。RNA編輯(P327)：RNA編輯是RNA分子上一種轉(zhuǎn)錄后修飾現(xiàn)象，包括插入、缺失或核苷酸的替換。思考題1、內(nèi)含子RNA剪接的三種方式？第一類：自我剪切。由于內(nèi)含子的特殊結(jié)構(gòu)而能自發(fā)地進(jìn)行剪切。第二類：蛋白質(zhì)參與剪切的內(nèi)含子，主要在tRNA前體中發(fā)現(xiàn)。剪切在一系列酶催化下進(jìn)行。第三類：內(nèi)含子是snRNP參與剪接的內(nèi)含子。2、原核生物tRNA前體以幾種方式存在？P297①多個(gè)相同tRNA串聯(lián)排列在一起；②不同的tRNA串聯(lián)排列；③tRNA與rRNA混合串聯(lián)排列在一起(圖8—1)。因而RNA前體必須經(jīng)歷加工，在tRNA與一些RNA片段之間先切斷，完成此任務(wù)的似乎是RNaseⅢ。然后，RNA片段再進(jìn)行5’端、3’端加工，某些堿基進(jìn)行修飾3、真核生物RNA前體的加工過程包括？P301答：真核生物tRNA和rRNA前體的加工包括轉(zhuǎn)最初始產(chǎn)物中間隔序列的除去、內(nèi)含子的剪接、5’和3’端修飾、堿基的修飾等。這些過程需要酶和蛋白質(zhì)的參與。4、RNA前體的剪切過程要通過4個(gè)步驟：①首先在5’端切除非編碼的序列，生成41S中間物；②41S的RNA切成32S和20S兩段，分別含有28SrRNA和18SrRNA，32S中還含有5.8SrRNA；③20S剪切成18S；④32S剪切成28SrRNA和5.8SrRNA，它們相互進(jìn)行堿基配對5、5’端帽子結(jié)構(gòu)具有如下3個(gè)功能。(1)對mRNA的保護(hù)作用，保護(hù)mRNA免受RNase從5’端開始的攻擊。(2)5’端帽子結(jié)構(gòu)使mRNA具有可翻譯能力(translatability，或translatableness)。(3)5’端帽子有利于成熟的mRNA從細(xì)胞核輸送到細(xì)胞質(zhì)，只有成熟的mRNA才能進(jìn)行輸送。第9章1、名詞解釋tRNA荷載作用(P347)：氨基酸被活化，共價(jià)連接在tRNA上。開放閱讀框架(P355)：起始密碼子和下游的終止密碼子之間的序列。肽鏈合成的延伸(P364)：指第二個(gè)和以后的密碼子編碼的氨基酸不斷進(jìn)入核糖體，并形成肽鍵的過程。核定位信號(P377)：指引一個(gè)蛋白質(zhì)分子從胞質(zhì)到核內(nèi)的典型信號序列。共翻譯轉(zhuǎn)動機(jī)制(P379)：邊翻譯邊轉(zhuǎn)運(yùn)的機(jī)制。分子伴侶(P393)：在蛋白質(zhì)折疊或組裝過程中，需要某些蛋白質(zhì)或肽鏈參與相互作用，幫助達(dá)到正確的構(gòu)象折疊，但又不是折疊或組裝產(chǎn)物的一部分，起幫助作用的蛋白質(zhì)或肽鏈。分子伴素：非特異性地幫助蛋白質(zhì)折疊，建立起它的正確結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)或肽鏈。遺傳密碼的特點(diǎn)(P337)：①遺傳密碼是三聯(lián)密碼；②遺傳密碼無逗號；③遺傳密碼子不重疊；④遺傳密碼具有通用性；⑤遺傳密碼具有簡并性；⑥起始密碼子和終止密碼子。擺動假設(shè)要點(diǎn)(P339)：①密碼子和反密碼子之間的堿基配對中，密碼子的5端前兩位堿基必須嚴(yán)格按照Watson-Crick堿基配對原則同反密碼子配對。②密碼子的第3個(gè)核苷酸為A時(shí)，由于受到立體化學(xué)因素的影響，將產(chǎn)生與G,U和C配對的一組特異構(gòu)象。滑動搜索模型（P356）：是闡述核糖體在帶有5帽子結(jié)構(gòu)的真核生物mRNA上如何啟動翻譯的起始反應(yīng)。三位點(diǎn)模型（P366）：核糖體結(jié)合tRNA有三個(gè)位點(diǎn)，即P位點(diǎn)、A位點(diǎn)和E位點(diǎn)。信號肽的特點(diǎn)（P379）：①幾乎所有的信號肽在整體上都是疏水的。②信號肽一般位于蛋白質(zhì)的N端，進(jìn)入膜后被信號肽酶水解，真核細(xì)胞信號肽酶位于ER膜，原核細(xì)胞位于質(zhì)膜內(nèi)側(cè)。③信號肽的中部常常由12~14個(gè)殘基構(gòu)成疏水性核，稱為信號肽疏水核。④需要廣義地認(rèn)識信號肽，應(yīng)該認(rèn)為它是初生蛋白質(zhì)穿過膜所必須的疏水性肽段，它可以位于蛋白質(zhì)分子的各個(gè)部位。⑤信號肽幾乎沒有嚴(yán)格的專一性。⑥信號肽可能不是一一直線通過雙脂層膜，而是一種環(huán)狀結(jié)構(gòu)。導(dǎo)肽的特點(diǎn)（P384）：①帶正電荷的堿性氨基酸含量較豐富，從它們的分析來看是隨機(jī)性的。②不含或基本上不含有負(fù)電荷的酸性氨基酸。③羥基氨基酸含量較高。④有形成兩親的α螺旋結(jié)構(gòu)的傾向。2、思考題1．核糖體的組分和立體結(jié)構(gòu)？答：原核和真核生物翻譯的起始？兩者起始反應(yīng)的比較？（P363）答：相同點(diǎn)：①只在核糖體小亞基上結(jié)合荷載的起始tRNA；②在mRNA上必須找到合適的起始密碼子；③在已經(jīng)形成有小亞基、mRNA和起始tRNA的起始復(fù)合物之后，大亞基參與形成完整的起始復(fù)合物。不同點(diǎn)：①原核細(xì)胞中，mRNA首先與小亞基結(jié)合，再有起始tRNA加入形成起始復(fù)合物。而真核細(xì)胞中，起始tRNA首先結(jié)合于小亞基，形成四元復(fù)合物，然后在多種因子參與下結(jié)合mRNA，才形成起始復(fù)合物。②小亞基起始復(fù)合物在mRNA上尋找起始密碼子的方式不同。翻譯延伸和終止的過程？（P364、P372）答：延伸過程：①進(jìn)位反應(yīng)；②轉(zhuǎn)位反應(yīng)和肽鍵的形成；③移位反應(yīng)。終止過程：蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)的3種機(jī)制？（P376）答：①核孔對特定大分子起選擇性通道的作用，核孔以其充分折疊的構(gòu)象轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白質(zhì)；②分泌蛋白的邊翻譯邊轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制；③翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制。蛋白質(zhì)前體的共價(jià)修飾類型，蛋白質(zhì)的剪切形式，內(nèi)含肽的剪切過程？(P387,388,390)答：共價(jià)修飾的加工主要包括4種類型：肽鏈N端殘基fMet或Met的切除、二硫鍵的形成、化學(xué)修飾和肽的剪切。蛋白質(zhì)的剪切形式有：前胰島素原、胰凝乳蛋白酶原、凝血酶原的活化，以及蛋白質(zhì)內(nèi)含子、外顯子和自我剪切等問題。內(nèi)含肽的剪切過程：①由內(nèi)含肽的N端Ser殘基的酰胺鍵，在結(jié)構(gòu)式樣B中Ser,Thr殘基的-OH基的作用下，肽鍵變得不穩(wěn)定，呈順式構(gòu)象。②C端(下游)外顯肽的Ser/Thr/Cys殘基攻擊上游外顯肽的酯/硫酯鍵，導(dǎo)致N端(上游)外顯肽與內(nèi)含肽N端分離，而轉(zhuǎn)移到下游外顯肽的Ser/Thr/Cys的側(cè)鏈上，從而形成分支結(jié)構(gòu)。③內(nèi)含肽C端的Asn環(huán)化，形成琥珀酰亞胺環(huán)，導(dǎo)致C端剪切點(diǎn)斷裂。④?；亟M，上下游兩個(gè)外顯肽形成天然的肽鍵。6.蛋白質(zhì)折疊的意義和過程及自動裝配原則？（P391,392）答：意義：在結(jié)構(gòu)上，這個(gè)過程使伸展的肽鍵成為特定的三維結(jié)構(gòu)；在功能上，它使無活性的分子具有特定生物學(xué)功能的蛋白質(zhì)分子。自裝配原則：蛋白質(zhì)在離體就已具有自發(fā)裝配的能力，并且不需要外加能量。自裝配原則只適用于小分子的蛋白質(zhì)。第11章1、名詞解釋操縱子(P469)：基因組中相關(guān)的基因聚集、串聯(lián)在一起，共同表達(dá)、共同調(diào)控，構(gòu)成一個(gè)表達(dá)和調(diào)控的單元，這種單元稱為操縱子。結(jié)構(gòu)基因(P470)：指編碼細(xì)胞結(jié)構(gòu)和基本代謝活動所必要的RNA，蛋白質(zhì)或酶。調(diào)控基因(P470)：指那些編碼那些控制其他基因表達(dá)的RNA或蛋白質(zhì)的基因。反式作用因子(P470)：調(diào)控因子在細(xì)胞內(nèi)可以自由移動，尋找和結(jié)合到靶位點(diǎn)上，因此稱反作用因子。誘導(dǎo)作用(P470)：某種酶或一組酶的合成是對特定物質(zhì)作出的反應(yīng)。正調(diào)控(P471)：若調(diào)控因子使靶基因的表達(dá)水平上升，這種調(diào)控方式稱為正調(diào)控。負(fù)調(diào)控(P471)：若調(diào)控因子使靶基因的表達(dá)水平下降，甚至關(guān)閉，這種調(diào)控作用稱為負(fù)調(diào)控。乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)(P473)：E.coli的乳糖操縱子是乳糖分解代謝的3個(gè)基因，lacZ編碼β半乳糖苷酶,lacY編碼β半乳糖透性酶,lacA編碼β半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶構(gòu)成的一個(gè)典型的操縱子。色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)(P492)：包括結(jié)構(gòu)基因(E、D、C、B、A)：分別編碼合成色氨酸途徑的酶或酶亞基。以及調(diào)控區(qū)域：阻遏基因（R）、啟動子區(qū)（P）、操縱區(qū)（O）、前導(dǎo)肽編碼區(qū)（L），弱化子區(qū)（a）?？勺瓒粜偷呢?fù)調(diào)控(P429)：調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物阻遏蛋白使trp操縱子關(guān)閉，這種作用稱為可阻遏型的負(fù)調(diào)控。它是某些氨基酸等生物合成酶類有關(guān)基因表達(dá)調(diào)控的基本形式。弱化作用(P495)：是RNA聚合酶從啟動子出發(fā)（開始轉(zhuǎn)錄）的轉(zhuǎn)錄受到衰減子的調(diào)控。抗終止作用(P508)：抗終止因子pN和pQ依賴于基因內(nèi)特殊序列和特殊蛋白銀子的相互作用，影響RNA聚合酶對終止位點(diǎn)的識別功能，使RNA聚合酶在終止位點(diǎn)通讀，形成一個(gè)較長的mRNA。pN和NusA蛋白如果作用于nut位點(diǎn)，就能引起抗終止作用。2、思考題1.乳糖操縱子的正負(fù)調(diào)控？（P474）答：某種調(diào)控因子的存在，使操縱子的結(jié)構(gòu)基因關(guān)閉；而調(diào)控因子不存在，能使操縱子的結(jié)構(gòu)基因開啟的調(diào)控方式稱為負(fù)調(diào)控。2.前導(dǎo)肽序列的特點(diǎn)？（P495）答：①前導(dǎo)序列某些區(qū)段富含GC，GC區(qū)段之間容易形成莖環(huán)二級結(jié)構(gòu)，接著有8個(gè)U的寡聚區(qū)段構(gòu)成一個(gè)不依賴于ρ因子的終止信號。在一定條件下mRNA合成提前終止，產(chǎn)生162個(gè)核苷酸長度的前導(dǎo)RNA。②除了這個(gè)終止信號的發(fā)夾結(jié)構(gòu)之外，由1區(qū)和2區(qū)序列構(gòu)成第二個(gè)發(fā)夾結(jié)構(gòu)。其中1區(qū)處于14個(gè)氨基酸的前導(dǎo)肽序列中。③3區(qū)也可以與2區(qū)互補(bǔ)，形成另一個(gè)由2區(qū)和3區(qū)組成的發(fā)夾結(jié)構(gòu)。一旦2區(qū)與3區(qū)形成二級結(jié)構(gòu)，就會阻遏3區(qū)與4區(qū)之間形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)，即不形成終止信號。④前導(dǎo)序列RNA中編碼了一段14個(gè)氨基酸的前導(dǎo)肽，在它的前面有5個(gè)核糖體的強(qiáng)結(jié)合位點(diǎn)，在編碼序列之后有一終止密碼子UGA。⑤前導(dǎo)序列中并列兩個(gè)色氨酸密碼子。3.原核生物時(shí)序表達(dá)在轉(zhuǎn)錄調(diào)控點(diǎn)的3種方式？（P499）答：①幾種新的蛋白因子代替RNA聚合酶原來的σ因子，協(xié)助RNA聚合酶的核心酶識別新的啟動子。②合成新的RNA聚合酶，代替原有的酶，開動一套新的啟動子。③合成新的調(diào)控因子，影響RNA聚合酶對轉(zhuǎn)錄終止信號的行為，如抗終止因子控制不同階段的基因表達(dá)。4.λ噬菌體中DNA轉(zhuǎn)錄的3個(gè)階段？（P506）答：①早期基因從PL和PR啟動子開始。②晚早期基因的轉(zhuǎn)錄。③晚期基因的轉(zhuǎn)錄。5.溶源化和裂解的命運(yùn)選擇？（P520）答：①競爭決定于CI阻遏蛋s白與Cro蛋白的比例。如果cI占優(yōu)勢，將建立溶源化；如果cro占優(yōu)勢，感染細(xì)胞將進(jìn)入裂解生長。cII基因產(chǎn)物CII蛋白的濃度決定cI或者cro占優(yōu)勢。②決定λ感染命運(yùn)的生理?xiàng)l件。6.CI基因在溶源化過程中自我調(diào)控？（P514）答：①λ阻遏蛋白低濃度時(shí)，能促進(jìn)它自己的轉(zhuǎn)錄，產(chǎn)生更多的阻遏蛋白；②高濃度的阻遏蛋白能抑制，關(guān)閉自己基因的轉(zhuǎn)錄；③阻遏蛋白能阻遏Cro基因轉(zhuǎn)錄。CI阻遏蛋白在低濃度時(shí)，Cro轉(zhuǎn)錄有某些抑制作用；在高濃度時(shí)，Cro轉(zhuǎn)錄完全停止；在更高濃度時(shí)，CI嚴(yán)重受抑制。原核生物在翻譯水平上的自我調(diào)控？第12章1、名詞解釋染色質(zhì)的重塑：(P545)通常把染色質(zhì)和單個(gè)核小體內(nèi)發(fā)生的任何可檢測到的變化稱為染色質(zhì)的重塑。CPG島：(P551)在有一些DNA區(qū)段中，GC堿基對形成二核苷酸序列CpG的密度大，大雨10/100bp，這些富含CpG的區(qū)段稱為CpG島。關(guān)卡：II類基因(P551)：指真核細(xì)胞RNA聚合酶II負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的基因，一般都是編碼蛋白質(zhì)的基因。染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域(P542)：指基因表達(dá)過程中結(jié)構(gòu)發(fā)生改變的區(qū)域，其中至少包括一個(gè)活性轉(zhuǎn)錄單位，有時(shí)延伸得更遠(yuǎn)。2、思考題(1)染色質(zhì)的3種狀態(tài)？(P536)答：1.阻遏狀態(tài)。巨大的DNA分子被緊緊地壓縮在細(xì)胞核內(nèi)，這樣的結(jié)構(gòu)不利于基因的表達(dá)?；钚誀顟B(tài)。只有處于活性狀態(tài)的染色質(zhì)，才能導(dǎo)致基因表達(dá)。3.激活狀態(tài)。啟動子上結(jié)合了積儲轉(zhuǎn)錄因子，上游元件及增加子結(jié)合有激活因子，促使RNA聚合酶等在啟動子區(qū)域形成轉(zhuǎn)錄復(fù)合物。(2)組蛋白對基因活性的影響？(P537)答：1.組蛋白對5SrRNA基因轉(zhuǎn)錄的影響；2.組蛋白對II類基因轉(zhuǎn)錄的影響。II類轉(zhuǎn)錄調(diào)控子的類型？(P555)答：1.普遍性轉(zhuǎn)錄因子；2.組織和細(xì)胞特異性的調(diào)控因子；3.可誘導(dǎo)的調(diào)控因子。基因表達(dá)的調(diào)控（7步）(P529)答：1.染色體和染色質(zhì)水平上的活化。轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控，包括基因的開閉，轉(zhuǎn)錄活性水平的高低。RNA加工水平上的調(diào)控，對初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的活化、修飾、選擇性剪接等。4.轉(zhuǎn)錄后加工產(chǎn)物，如mRNA從細(xì)胞核向細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)過程受到的調(diào)控。5.翻譯的控制，選擇哪種mRNA提呈給核糖體翻譯，包括翻譯量的控制。6.蛋白質(zhì)合成后選擇性地被激活或失活，蛋白質(zhì)水平上的剪切、活性水平和降解的控制。7.控制mRNA的選擇性降解是基因表達(dá)調(diào)控的另一重要方面。SD序列：在細(xì)菌mRNA起始密碼子AUG上游10個(gè)堿基左右處，有一段富含嘌呤的堿基序列，能與細(xì)菌16SrRNA3’端識別，幫助從起始AUG處開始翻譯的序列。染色體、DNA、基因這三者的關(guān)系：染色體是DNA的主要載體，一般情況下，每個(gè)染色體有一個(gè)DNA分子，DNA上有很多個(gè)基因，基因是有遺傳效應(yīng)的DNA片斷，基因在染色體上呈線性排列。選擇題復(fù)習(xí)1．證明DNA是遺傳物質(zhì)的兩個(gè)關(guān)鍵性實(shí)驗(yàn)是：肺炎球菌在老鼠體內(nèi)的毒性和T2噬菌體感染大腸桿菌。這兩個(gè)實(shí)驗(yàn)中主要的論點(diǎn)證據(jù)是：(

C

)

(a)從被感染的生物體內(nèi)重新分離得到DNA，作為疾病的致病劑

(b)DNA突變導(dǎo)致毒性喪失

(c)生物體吸收的外源DNA(而并非蛋白質(zhì))改變了其遺傳潛能

(d)DNA是不能在生物體間轉(zhuǎn)移的，因此它一定是一種非常保守的分子

(e)真核生物、原核生物、病毒的DNA能相互混合并彼此替代2．1953年Watson和Crick提出：(

A

)

(a)多核苷酸DNA鏈通過氫鍵連接成一個(gè)雙螺旋

(b)DNA的復(fù)制是半保留的，常常形成親本—子代雙螺旋雜合鏈

(c)三個(gè)連續(xù)的核苷酸代表一個(gè)遺傳密碼

(d)遺傳物質(zhì)通常是DNA而非RNA

(e)分離到回復(fù)突變體證明這一突變并非是一個(gè)缺失突變3．雙鏈DNA中的堿基對有：(

CD

)

(a)A-U

(b)G-T

(c)C-G

(d)T-A

(e)C-A4．DNA雙螺旋的解鏈或變性打斷了互補(bǔ)堿基間的氫鍵，并因此改變了它們的光吸收特性。以下哪些是對DNA的解鏈溫度的正確描述：(

CD

)

(a)哺乳動物DNA約為45℃，因此發(fā)燒時(shí)體溫高于42℃是十分危險(xiǎn)的

(b)依賴于A—T含量，因?yàn)锳-T含量越高則雙鏈分開所需要的能量越少

(c)是雙鏈DNA中兩條單鏈分開過程中溫度變化范圍的中間值

(d)可通過堿基在260mm的特征吸收峰的改變來確定

(e)就是單鏈發(fā)生斷裂(磷酸二酯鍵斷裂)時(shí)的溫度5．DNA的變性：(

ACE

)

(a)包括雙螺旋的解鏈

(b)可以由低溫產(chǎn)生(c)是可逆的

(d)是磷酸二酯鍵的斷裂(e)包括氫鍵的斷裂6．在類似RNA這樣的單鏈核酸所表現(xiàn)出的“二級結(jié)構(gòu)”中，發(fā)夾結(jié)構(gòu)的形成：（

AD

）

(a)基于各個(gè)片段間的互補(bǔ)，形成反向平行雙螺旋

(b)依賴于A-U含量，因?yàn)樾纬傻臍滏I越少則發(fā)生堿基配對所需的能量也越少

(c)僅僅當(dāng)兩配對區(qū)段中所有的堿基均互補(bǔ)時(shí)才會發(fā)生

(d)同樣包括有像G-U這樣的不規(guī)則堿基配對

(e)允許存在幾個(gè)只有提供過量的自由能才能形成堿基對的堿基7．DNA分子中的超螺旋：(

ACE

)

(a)僅發(fā)生于環(huán)狀DNA中。如果雙螺旋在圍繞其自身的軸纏繞后(即增加纏繞數(shù))才閉合，則雙螺旋在扭轉(zhuǎn)力的作用下，處于靜止

(b)在線性和環(huán)狀DNA中均有發(fā)生。纏繞數(shù)的增加可被堿基配對的改變和氫鍵的增加所抑制

(c)可在一個(gè)閉合的DNA分子中形成一個(gè)左手雙螺旋。負(fù)超螺旋是DNA修飾的前

提，為酶接觸DNA提供了條件

(d)是真核生物DNA有絲分裂過程中固縮的原因

(e)是雙螺旋中一條鏈繞另一條鏈的旋轉(zhuǎn)數(shù)和雙螺旋軸的回轉(zhuǎn)數(shù)的總和

8．DNA在10nm纖絲中壓縮多少倍(長度)?(

A

)

(a)6倍

(b)1O倍

(c)40倍

(d)240倍

(e)1000倍

(f)100000倍

9．DNA在30nm纖絲中壓縮多少倍?(

C

)

(a)6倍

(b)10倍

(c)40倍

(d)240倍

(e)1000倍

(f)100000倍10．DNA在染色體的常染色質(zhì)區(qū)壓縮多少倍?(

E

)(a)6倍

(b)10倍

(c)40倍

(d)240倍

(e)1000倍

(f)100000倍11．DNA在中期染色體中壓縮多少倍?(

F

)

(a)6倍

(b)10倍

(c)40倍

(d)240倍

(e)1000倍

(f)1000O0倍12．組蛋白的凈電荷是：(

A

)

(a)正

(b)中性

(c)負(fù)13．核小體的電性是：(

B

)

(a)正

(b)中性

(C)負(fù)14．當(dāng)新的核小體在體外形成時(shí)，會出現(xiàn)以下哪些過程?(

C

)

(a)核心組蛋白與DNA結(jié)合時(shí)，一次只結(jié)合一個(gè)

(b)一個(gè)H32-H42核形成，并與DNA結(jié)合，隨后按順序加上兩個(gè)H2A—H2B二聚體

(c)核心八聚體完全形成后，再與DNA結(jié)合

15．當(dāng)一個(gè)基因具有活性時(shí)：(

AC

)

(a)啟動子一般是不帶有核小體的

(b)整個(gè)基因一般是不帶有核小體的

(C)基因被核小體遮蓋，但染色質(zhì)結(jié)構(gòu)已發(fā)生改變以致于整個(gè)基因?qū)怂崦附到飧用舾?6.原核細(xì)胞信使RNA含有幾個(gè)其功能所必需的特征區(qū)段，它們是：(

D

)

(a)啟動子，SD序列，起始密碼子，終止密碼子，莖環(huán)結(jié)構(gòu)

(b)啟動子，轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，前導(dǎo)序列，由順反子間區(qū)序列隔開的SD序列和ORF，

尾部序列，莖環(huán)結(jié)構(gòu)(c)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，尾部序列，由順反子間區(qū)序列隔開的SD序列和ORF，莖環(huán)結(jié)構(gòu)(d)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，前導(dǎo)序列，由順反子間區(qū)序列隔開的SD序列和ORF，尾部序列17.tRNA參與的反應(yīng)有：(

BC

)

(a)轉(zhuǎn)錄(b)反轉(zhuǎn)錄(C)翻譯(d)前體mRNA的剪接(e)復(fù)制18.氨酰tRNA的作用由(

B

)決定

(a)其氨基酸(b)其反密碼子(c)其固定的堿基區(qū)

(d)氨基酸與反密碼子的距離，越近越好

(e)氨酰tRNA合成酶的活性19.Ⅰ型內(nèi)含子能利用多種形式的鳥嘌呤，如：(

ABCD

)

(a)GMP

(b)GDP

(c)GTP

(d)dGDP

(e)ddGMP(2’，3’-雙脫氧GMP)20.Ⅰ型內(nèi)含子折疊成的復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)：(

ACDE

)

(a)有長9bp的核苷酸配對

(b)對突變有很大的耐受性

(c)形成可結(jié)合外來G和金屬離子的“口袋”

(d)使內(nèi)含子的所有末端都在一起

(e)在剪接過程中發(fā)生構(gòu)象重組

(f)利用Pl和P9螺旋產(chǎn)生催化中心21.RNaseP:(

ABCE

)

(a)其外切核酸酶活性催化產(chǎn)生tRNA成熟的5’末端

(b)含有RNA和蛋白組分

(c)體內(nèi)切割需要兩個(gè)組分

(d)體外切割需要兩個(gè)組分

(e)采用復(fù)雜的二級與三級結(jié)構(gòu)形成催化位點(diǎn)22．錘頭型核酶：(ABD

)

(a)是一種具有催化活性的小RNA

(b)需要僅含有17個(gè)保守核苷酸的二級結(jié)構(gòu)

(c)不需要Mg2+協(xié)助

(d)可用兩個(gè)獨(dú)立的RNA創(chuàng)建錘頭型核酶23.Ⅰ型剪接需要(

ABF

)

(a)單價(jià)陽離子(b)二價(jià)陽離子(c)四價(jià)陽離子(d)UlsnRNP

(e)一個(gè)腺苷酸分支點(diǎn)(f)一個(gè)鳥膘呤核苷酸作為輔助因子24.在Ⅰ型剪接的過程中，(

ADE

)

(a)游離的G被共價(jià)加到內(nèi)含子的5’端

(b)GTP被水解

(c)內(nèi)含子形成套馬索結(jié)構(gòu)

(d)在第一步，G的結(jié)合位點(diǎn)被外來的G占據(jù)，而在第二步時(shí)，被3’剪接位點(diǎn)的G所取代

(e)被切除的內(nèi)含子繼續(xù)發(fā)生反應(yīng)，包括兩個(gè)環(huán)化反應(yīng)25.DNA的復(fù)制：(

BD

)

(a)包括一個(gè)雙螺旋中兩條子鏈的合成(b)遵循新的子鏈與其親本鏈相配對的原則(c)依賴于物種特異的遺傳密碼(d)是堿基錯(cuò)配最主要的來源

(e)是一個(gè)描述基因表達(dá)的過程26.一個(gè)復(fù)制子是：(

C

)

(a)細(xì)胞分裂期間復(fù)制產(chǎn)物被分離之后的DNA片段

(b)復(fù)制的DNA片段和在此過程中所需的酶和蛋白

(c)任何自發(fā)復(fù)制的DNA序列(它與復(fù)制起始點(diǎn)相連)

(d)任何給定的復(fù)制機(jī)制的產(chǎn)物(如：單環(huán))(e)復(fù)制起點(diǎn)和復(fù)制叉之間的DNA片段27.真核生物復(fù)制子有下列特征，它們：(C

)

(a)比原核生物復(fù)制子短得多，因?yàn)橛心┒诵蛄械拇嬖?/p>

(b)比原核生物復(fù)制子長得多，因?yàn)橛休^大的基因組

(c)通常是雙向復(fù)制且能融合

(d)全部立即啟動，以確保染色體在S期完成復(fù)制

(e)不是全部立即啟動，在任何給定的時(shí)間只有大約15％是有活性的28.下述特征是所有(原核生物、真核生物和病毒)復(fù)制起始位點(diǎn)都共有的是：(

ACD

)

(a)起始位點(diǎn)是包括多個(gè)短重復(fù)序列的獨(dú)特DNA片段

(b)起始位點(diǎn)是形成穩(wěn)定二級結(jié)構(gòu)的回文序列

(c)多聚體DNA結(jié)合蛋白專一性識別這些短的重復(fù)序列

(d)起始位點(diǎn)旁側(cè)序列是A-T豐富的，能使DNA螺旋解開

(e)起始位點(diǎn)旁側(cè)序列是G—C豐富的，能穩(wěn)定起始復(fù)合物29.下列關(guān)于DNA復(fù)制的說法是正確的有：(

DEF

)

(a)按全保留機(jī)制進(jìn)行

(b)接3’→5’方向進(jìn)行

(c)需要4種dNMP的參與

(d)需要DNA連接酶的作用

(e)涉及RNA引物的形成

(f)需要DNA聚合酶Ⅰ30.滾環(huán)復(fù)制：(BDE

)

(a)是細(xì)菌DNA的主要復(fù)制方式

(b)可以使復(fù)制子大量擴(kuò)增

(c)產(chǎn)生的復(fù)制子總是雙鏈環(huán)狀拷貝

(d)是噬菌體DNA在細(xì)菌中最通常的—種復(fù)制方式

(e)復(fù)制子中編碼切口蛋白的基因的表達(dá)是自動調(diào)節(jié)的31.標(biāo)出下列所有正確的答案:(

BC

)

(a)轉(zhuǎn)錄是以半保留的方式獲得兩條相同的DNA鏈的過程

(b)DNA依賴的DNA聚合酶是負(fù)責(zé)DNA復(fù)制的多亞基酶

(c)細(xì)菌轉(zhuǎn)錄物(mRNA)是多基因的

(d)σ因子指導(dǎo)真核生物的hnRNA到mRNA的轉(zhuǎn)錄后修飾

(e)促旋酶(拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ)決定靠切開模板鏈而進(jìn)行的復(fù)制的起始和終止32.哺乳動物線粒體和植物葉綠體基因組是靠D環(huán)復(fù)制的。下面哪一種敘述準(zhǔn)確地描述了這個(gè)過程?(

CD

)

(a)兩條鏈都是從oriD開始復(fù)制的，這是一個(gè)獨(dú)特的二級結(jié)構(gòu),由DNA聚合酶復(fù)合體識別

(b)兩條鏈的復(fù)制都是從兩個(gè)獨(dú)立的起點(diǎn)同時(shí)起始的

(c)兩條鏈的復(fù)制都是從兩個(gè)獨(dú)立的起點(diǎn)先后起始的

(d)復(fù)制的起始是由一條或兩條(鏈)替代環(huán)促使的

(e)ter基因座延遲一條鏈的復(fù)制完成直到兩個(gè)復(fù)制過程同步33.DNA多聚體的形成要求有模板和一個(gè)自由3’—OH端的存在。這個(gè)末端的形成是靠：

(

ABDE

)

(a)在起點(diǎn)或?qū)槠纹鹗嘉稽c(diǎn)(3’—GTC)上的一個(gè)RNA引發(fā)體的合成

(b)隨著鏈替換切開雙鏈DNA的一條鏈

(c)自由的脫氧核糖核苷酸和模板一起隨機(jī)按Watson-Crick原則進(jìn)行配對

(d)靠在3’末端形成環(huán)(自我引發(fā))

(e)一種末端核苷酸結(jié)合蛋白結(jié)合到模板的3’末端34.對于一個(gè)特定的起點(diǎn)，引發(fā)體的組成包括：(

AC

)

(a)在起始位點(diǎn)與DnaG引發(fā)酶相互作用的一個(gè)寡聚酶

(b)一個(gè)防止DNA降解的單鏈結(jié)合蛋白

(c)DnaB解旋酶和附加的DnaC，DnaT，PriA等蛋白

(d)DnaB，單鏈結(jié)合蛋白，DnaC，DnaT，PriA蛋白和DnaG引發(fā)酶

(e)DnaB解旋酶，DnaG引發(fā)酶和DNA聚合酶Ⅲ35.在原核生物復(fù)制子中以下哪種酶除去RNA引發(fā)體并加入脫氧核糖核苷酸?(

C

)

(a)DNA聚合酶Ⅲ(b)DNA聚合酶Ⅱ(c)DNA聚合酶Ⅰ(d)外切核酸酶MFl(e)DNA連接酶36．λ阻遏蛋白是一種DNA結(jié)合蛋白，它屬于以下哪一組?(

)

(a)螺旋—環(huán)-螺旋蛋白(b)螺旋-轉(zhuǎn)角—螺旋蛋白

(c)鋅指蛋白(d)亮氨酸拉鏈蛋白(e)DNA脫甲基化酶37．λ原噬菌體的晚期基因的表達(dá)依靠：(

)

(a)聚合酶，σ因子，σRE，從啟動子PRE起始轉(zhuǎn)錄

(b)抗終止：N因于允許從啟動子PR開始轉(zhuǎn)錄的繼續(xù)

(c)抑制：Cro蛋白抑制從啟動子PR開始的轉(zhuǎn)錄

(d)抗終止：Q因子允許從啟動子PR開始轉(zhuǎn)錄的繼續(xù)

(e)以上全不對38．裂解細(xì)菌的噬菌體具有以下類型：(

)

(a)只有ssRNA

(b)只有dSRNA

(c)只有ssDNA

(d)只有dsDNA

(e)以上全有39．原噬菌體(整合到宿主基因組的噬菌體基因組)是自私DNA。這是因?yàn)椋?

)

(a)它總是與溶源菌的基因組一起增殖

(b)它獨(dú)立于溶源菌的基因組復(fù)制

(c)它對病毒顆粒的進(jìn)一步感染具有免疫力

(d)(a)和(c)對

(e)(b)和(c)對40．一個(gè)病毒有一個(gè)由單鏈負(fù)鏈RNA組成的基因組。以下哪一個(gè)過程正確描述了病毒

RNA的產(chǎn)生?(

)

(a)病毒單鏈負(fù)鏈RNA直接作為mRNA

(b)先合成雙鏈RNA，而后以新合成的正鏈作為mRNA

(c)先合成單鏈正鏈DNA，而后再轉(zhuǎn)錄成mRNA

(d)單鏈負(fù)鏈RNA病毒的基因組只編碼病毒tRNAs

(e)以上全不對41．溫和噬菌體從溶源到裂解的轉(zhuǎn)換可用以下哪個(gè)過程來描述：(

)

(a)自體調(diào)節(jié)的cⅠ基因的表達(dá)被Cro蛋白所抑制

(b)cro基因的表達(dá)被λ阻遏蛋白所抑制

(c)原噬菌體的復(fù)制被轉(zhuǎn)移因子(TF)介導(dǎo)的DNA聚合酶活性所誘導(dǎo)

(d)轉(zhuǎn)移σ因子介導(dǎo)的從PR啟動子開始轉(zhuǎn)錄的誘導(dǎo)

(e)以上全不對42．標(biāo)出以下所有正確表述：(

C

)

(a)轉(zhuǎn)錄是以半保留方式獲得序列相同的兩條DNA鏈的過程

(b)依賴DNA的DNA聚合酶是多亞基酶，它負(fù)責(zé)DNA的轉(zhuǎn)錄

(c)細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄物(mRNA)是多基因的

(d)σ因子指導(dǎo)真核生物hnRNA的轉(zhuǎn)錄后加工，最后形成mRNA

(e)促旋酶在模板鏈產(chǎn)生缺口，決定