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文檔簡介
第二節(jié)基因工程的酶學基礎演示文稿當前1頁,總共90頁。優(yōu)選第二節(jié)基因工程的酶學基礎當前2頁,總共90頁。第二章基因工程的酶學基礎第一節(jié)限制性核酸內切酶第二節(jié)DNA連接酶第三節(jié)DNA聚合酶和反轉錄酶第四節(jié)DNA修飾酶第五節(jié)外切核酸酶第六節(jié)單鏈內切核酸酶第七節(jié)RNA酶當前3頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶
任何一種生物體都存在防御外界物質進入的機制
限制/修飾系統
(R-M,Restriction-modificationsystem)當前4頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶
人們發(fā)現侵染大腸桿菌的噬菌體都存在著一些功能性障礙。即所謂的寄主控制的限制與修飾現象簡稱(R/M體系)。細菌的R/M體系類似于免疫系統,能辨別自身的DNA與外來的DNA,并能使后者降解掉。維護宿主遺傳穩(wěn)定的保護機制。一、寄主的限制與修飾現象當前5頁,總共90頁。
E.coliB含有EcoB核酸酶和EcoB甲基化酶
當λ(k)噬菌體侵染E.coliB時,由于其DNA中有EcoB核酸酶特異識別的堿基序列,被降解掉。而E.coliB的DNA中雖然也存在這種特異序列,但可在EcoB甲基化酶的作用下,催化S-腺苷甲硫氨酸(SAM)將甲基轉移給限制酶識別序列的特定堿基,使之甲基化。EcoB核酸酶不能識別已甲基化的序列。當前6頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶當前7頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶一、寄主的限制與修飾現象
當前8頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶一、寄主的限制與修飾現象
當前9頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶一、寄主的限制與修飾現象
基因工程中,應采用缺少限制作用的菌株作為受體。
當前10頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶二、限制性內切酶的類型
限制性核酸內切酶(限制性酶):在細胞內能夠識別雙鏈DNA分子中的特定核苷酸序列,并對DNA分子進行切割的一種酶。據限制性核酸內切酶的識別切割特性、催化條件及是否具有修飾酶活性,可分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型。主要特性Ⅰ型Ⅱ型Ⅲ型限制修飾蛋白結構輔助因子識別序列切割位點雙功能(具甲基化)異源三聚體ATPMg2+SAM距識別序列1kb處隨機性切割單一功能同源二聚體Mg2+
4-6bp回文序列識別序列內或附近特異切割雙功能(具甲基化)異源二聚體ATPMg2+
距識別序列下游24-26bp處隨機性切割基因工程中使用注:SAM為S-腺苷甲硫氨酸當前11頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶1.I型限制性內切酶首先由M.Meselson和R.Yuan在1968年從大腸桿菌B株和K株分離的。如EcoB和EcoK。(1)識別位點序列未甲基化修飾的特異序列。EcoB:TGA(N)8TGCTEcoK:AAC(N)6GTGC
當前12頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶(2)切割位點
在距離特異性識別位點約1000—1500bp處隨機切開一條單鏈。
(3)作用機理
需ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。
Recognizesite
cut
1-1.5kb
當前13頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶2.II類限制性內切酶首先由H.O.Smith和K.W.Wilcox在1970年從流感嗜血菌中分離出來。分離的第一個酶是HindⅡ
(1)識別位點序列未甲基化修飾的雙鏈DNA上的特殊靶序列(多數是回文序列),與DNA的來源無關。ABCC’B’A’
A’B’C’CBAA’B’N’BAABNB’A’
或當前14頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶(2)切割位點
識別位點處。
切開雙鏈DNA。形成粘性末端(stickyend)或平齊末端(bluntend)。如:
EcoRI5’-GAATTC-3’3’-CTTAAG-5’PstI5’-CTGCAG-3’3’-GACGTC-5’
產生粘性末端EcoRV5’-GATATC-3’3’-CTATAG-5’
產生平齊末端當前15頁,總共90頁。AAGCTTTTCGAAAAGCTTTTCGAAABCDDNADNAHindⅢHindⅢ切割位點核酸內切酶HindⅢ對雙鏈DNA分子的切割作用當前16頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶3.III類限制性內切酶在完全肯定的位點切割DNA(識別位點下游24-26bp),但反應需要ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。EcoP1:AGACC
EcoP15:CAGCAG
在基因工程操作中用途不大。當前17頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶主要特性Ⅰ型Ⅱ型Ⅲ型限制修飾蛋白結構輔助因子識別序列切割位點多功能(具甲基化)異源三聚體ATPMg2+SAM距識別序列1kb處隨機性切割單一功能同源二聚體Mg2+
4-6bp回文序列識別序列內或附近特異切割雙功能(具甲基化)異源二聚體ATPMg2+
距識別序列下游24-26bp處隨機性切割核酸限制性內切酶的類型及主要特性當前18頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶三、限制性內切酶的命名
1973年H.OSmith和D.Nathans提議的命名系統,命名原則如下:
1.用屬名的第一個字母和種名的頭兩個字母組成3個字母的略語表示寄主菌的物種名。
大腸桿菌(Escherichiacoli)用Eco表示;
流感嗜血菌(Haemophilusinfluenzae)用Hin表示。
2.
用一個右下標的大寫字母表示菌株或型。如EcoK,EcoR(現在都寫成平行,如EcoRI)。
3.
如果一種特殊的寄主菌內有幾種不同的限制與修復系統,用羅馬字母表示。如EcoRI,EcoRV。
4.
限制酶前面要帶上R(Restriction),
修飾酶前面要帶上M(Modification)(現已省略)。當前19頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶三、限制性內切酶的命名
EcoRIEscherichia屬名Coli種名Ry13株系編號
若種名頭2個字母相同則其中一個可用種名的第一和第三個字母。當前20頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶四、
Ⅱ限制性核酸內切酶的基本特性(一)識別序列識別順序的堿基數一般為4-6bp,少數識別更長,多數識別位點具有旋轉對稱性(回文結構),少數的識別位點在切割位點之外,具旋轉對稱性
4bp
HpaⅠ
CCGG
HaeⅢ
GGCC
5bp
AvaⅡ
GGWCC
EcoRⅡ
CCWGG
6bp
BamHⅠ
GGATTC
SmaⅠ
CCCGGG
11bp
Bg1Ⅰ
GCCNNNNNGGC
12bp
BstXⅠ CCANNNNNNTGC
N=A,T,G,C當前21頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶四、Ⅱ限制性核酸內切酶的基本特性(二)切割方式
Ⅱ限制性核酸內切酶切割雙鏈DNA,水解磷酸二酯鍵中3‘位酯鍵產生兩個末端,末端結構是5’-P和3’-OH,產生3種不同的切口。
當前22頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶1.5’突出的末端當前23頁,總共90頁。EcoRI等產生的5‘粘性末端5‘…G--C--T--G--A--A--T--T--C--G--A--G…3’3‘…C--G--A--C--T--T--A--A--G--C--T--C…5’EcoRI37℃5‘…G--C--T--G--OHP--A--A--T--T--C--G--A--G…3’3‘…C--G--A--C--T--T--A--A—POH--G--C--T--C…5’退火4--7℃5‘…G--C--T--G--A--A--T--T--C--G--A--G…3’3‘…C--G--A--C--T--T--A--A--G--C--T--C…5’第一節(jié)限制性核酸內切酶當前24頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶2.3’突出的末端當前25頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶PstI等產生的3‘粘性末端
5‘…C--T--G--C--A--G…3’3‘…G--A--C--G--T--C…5’PstI37℃5‘…C--T--G--C--A--OHP--G…3’3‘…G--POH--A--C--G--T--C…5’退火4--7℃5‘…C--T--G--C--A--G…3’3‘…G--A--C--G--T--C…5’當前26頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶粘性末端的意義
①連接便利
i)不同的DNA雙鏈:
只要粘性末端堿基互補就可以連接。
這比連接兩個平齊末端容易的多。
當前27頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶當前28頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶ii)同一個DNA分子內連接:
通過兩個相同的粘性末端可以連接成環(huán)形分子。
當前29頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶②5’末端標記
凸出的5’末端可用DNA多核苷酸激酶進行32P標記。
凸出的3’端可以通過末端轉移酶添加幾個多聚核苷酸的尾巴(如AAA或TTT等)造成人工粘性末端。③
補平成平齊末端
粘性末端可以用DNA聚合酶補平成平齊末端。當前30頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶3.平頭末端當前31頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶PvuII等產生的平頭末端
5‘…G--C--T--C--A--G--C--T--G--G--A--G…3’3‘…C--G--A--G--T--C--G--A--C--C--T--C…5’PvuII37℃5‘…G--C--T--C--A--G--OHP--C--T--G--G--A--G…3’3‘…C--G--A--G--T--C--POH--G--A--C--C--T--C…5’當前32頁,總共90頁。第一節(jié)限制性核酸內切酶當前33頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶四、
Ⅱ限制性核酸內切酶的基本特性(二)切割方式
同裂酶(isoschizomers):指來源不同但識別相同靶序列的核酸內切酶。同裂酶進行同樣的切割,產生不同或相同的末端。
同尾酶(isocaudamer):指來源不同、識別靶序列不同但產生相同的粘性末端的核酸內切酶。利用同尾酶可使切割位點的選擇余地更大(相容性末端)。當前34頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶同尾酶舉例:如:BamHIGGATCCBglIIAGATCTMboI,Sau3AINGATCN
常用的限制酶BamHⅠ、BclⅠ、
BglⅡ、Sau3AⅠ和XhoⅡ就是一組同尾酶,它們切割DNA之后都形成由GATC4個核苷酸組成的粘性末端。當前35頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶五、Ⅱ限制性核酸內切酶的反應條件
1U
核酸內切酶的酶活性:在最適反應條件和溫度下,保溫1小時,使1μgDNA完全降解所需的酶蛋白量即為一個酶單位,用U表示。
大部分II型限制性核酸內切酶需要相似反應條件:
Tris-HCl50mmol/LpH7.5
MgCl210mmol/L
NaCl0-150mmol/L
DTT1mmol/L
Volume20-100μL
Temperature37℃
Time1-1.5h(DDT:二硫蘇糖醇
BSA:牛血清蛋白)0-50mM低鹽酶100
mM中鹽酶150
mM高鹽酶Buffer當前36頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶五、Ⅱ限制性核酸內切酶的反應條件
在滅菌的1.5ml離心管中進行限制性酶切反應:
20μl體積反應體系如下:
DNA0.2-1μg
10×酶切buffer2.0μl
限制性內切酶
1-2U(單位)
加ddH2O至
20μl
多種酶消化時若緩沖液條件相同,可同時加入;否則,先做低溫或低鹽的酶消化,再做高溫或高鹽的酶消化。當前37頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶五、Ⅱ限制性核酸內切酶的反應條件
酶切反應的終止
EDTA(終濃度10mmol/L)或SDS[終濃度0.1%(W/V)]65oC溫育
20min
酚/氯仿抽提,乙醇沉淀
酶解結果鑒定
瓊脂糖電泳當前38頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶五、Ⅱ限制性核酸內切酶的反應條件
完全消化:內切酶在DNA上的所有識別位點都被切開。
局部消化:只有有限數量的酶切位點被切開。
通過縮短保溫時間、降低反應溫度或減少酶的用量可達到局部消化的目的。當前39頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶五、Ⅱ限制性核酸內切酶的反應條件
酶切的注意事項:
1.購買的限制性內切酶多保存于50%甘油中,于-20℃是穩(wěn)定的。
進行酶切消化時,將除酶以外的所有反應成分加入后即混勻,
再從
-20℃冰箱中取出酶,立即放置于冰上。每次取酶時都應更換一個無菌吸頭,以免酶被污染。加酶的操作盡可能快,用完后立即將酶放回-20℃冰箱。
2.盡量減少反應體積,但要確保酶體積不超過反應總體積的10%,否則酶活性將受到甘油的抑制。
3.通常延長時間可使所需的酶量減少,在切割大量DNA時可用。
當前40頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶六、影響限制性核酸內切酶活性的因素(一)酶的純度
(二)DNA樣品的純度
DNA樣中混有蛋白質、苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、SDS、NaCl等,都有可能抑制酶活性。
可采用以下方法,提高酶活性:加大酶的用量,1μgDNA用10U酶加大反應總體積延長反應時間當前41頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶六、影響限制性核酸內切酶活性的因素(三)DNA樣品的甲基化程度
采用去甲基化酶的大腸桿菌菌株來制備質粒DNA,可防止DNA的甲基化。
當前42頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶六、影響限制性核酸內切酶活性的因素(四)酶切反應的溫度與時間
多數標準反應溫度是37℃,如SmaI為25℃或30℃,SfiI為50℃
。反應溫度過度或過低都會影響酶活性,甚至導致酶失活。酶解時間可通過加大酶量而縮短,反之酶量較少時,可通過延長酶解時間以達到完全酶解DNA的目的。當前43頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶六、影響限制性核酸內切酶活性的因素(五)DNA的分子構型
某些酶切割超螺旋質粒DNA時,酶量比切割線性DNA時高出多倍,可高達20倍。酶最適溫度oC
酶最適溫度oC
酶最適溫度oC
ApaIBclIMaeIITaqI30505065ApyIBstEIIMaeIII306055BanIMaeISmaI504525當前44頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶六、影響限制性核酸內切酶活性的因素(六)限制性核酸內切酶的反應緩沖液
高濃度的酶、高濃度的甘油、低離子強度、極端pH值等,會使一些核酸內切酶的識別和切割序列發(fā)生低特異性,即所謂的“星活性”(staractivity)現象。
EcoRI*代表EcoRI的星號活力。
星活性的特點:限制酶識別序列特異性降低
例如:EcoRI(高pH值或低鹽離子強度)
5’GAATTC3’變成5’NAATTN3’,另有一種情況是對AATT中的A、T分辨不嚴格商品化的限制酶一般都帶有專用緩沖液。當前45頁,總共90頁。第一節(jié)
限制性核酸內切酶限制性核酸內切酶的應用:重組DNA前的切割
構建新質粒構建物理圖譜DNA分子雜交
用限制性內切酶消化受體DNA制備DNA探針
亞克隆以用作序列分析基因定位,DNA同源性研究當前46頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶剪刀—限制性內切酶針線、膠水—連接酶當前47頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶DNA連接酶當前48頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶一、概念與機理
DNA連接酶是1967年在三個實驗室同時發(fā)現的。它是一種能夠將DNA鏈上彼此相鄰的3’-羥基(OH)和5’-磷酸基團(-P),在NAD+或ATP供能的作用下,形成磷酸二酯鍵。大腸桿菌和其他細菌的DNA連接酶以NAD+作為能量來源,動物細胞和噬菌體的連接酶則以ATP作為能量來源。當前49頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶一、概念與機理
DNA連接酶只能連接缺口(nick),不能連接裂口(gap)。而且被連接的DNA鏈必須是雙螺旋DNA分子的一部分。
注意:缺口(或稱切口)和裂口的區(qū)別?。。。?!當前50頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶DNA連接酶對不同DNA分子的連接作用當前51頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶二、DNA連接酶的種類(一)T4噬菌體DNA連接酶
特點:
只連接ds-DNA分子,要求3’-羥基和5’-磷酸基
用途:
1)粘性末端的連接
2)平頭末端的相連
抑制劑:PO43->5mM,NaCl>25mM,Ca2+>0.1mM當前52頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶二、DNA連接酶的種類(二)大腸桿菌DNA連接酶連接具粘性末端DNA分子,以NAD作輔助因子(三)熱穩(wěn)定DNA連接酶以NAD為輔助因子,優(yōu)先作用于缺口連接酶使用注意事項
1)DNA連接酶不能催化兩單鏈DNA分子連接;
2)只能連接雙鏈DNA分子的單鏈切口(nick);
3)不能連接雙鏈中一個或多個核苷酸缺失所致的裂口(gap)。DNA連接酶的部分性質連接酶底物輔助因子巰基試劑粘性末端平末端DNA-RNA雜合體RNA-RNA雜合體大腸桿菌DNA連接酶可行可行不行不行NAD+Mg2+不需要T4DNA連接酶可行可行可行可行ATPMg2+
需DTT噬熱菌DNA連接酶可行不行不行不行NAD+Mg2+
需要當前53頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶DNA連接酶應用圖解(一)分子間的連接
(二)分子內的連接當前54頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶三、DNA連接酶的反應體系
10×T4DNALigaseBuffer1μlpMD18-T(30ng/μl)1μl已純化的PCR產物 Xμl*T4DNALigase2~3WeissUnitsddH2O 至10μl當前55頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶四、影響連接反應的因素
1.插入片段與載體的濃度比例:2-10:1增加插入片段與載體的接觸機會,減少載體自我連接的現象
2.反應溫度:一般4~16℃
3.ATP濃度
當前56頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶平末端DNA片段的連接(補充)1.同聚物加尾法
當前57頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶平末端DNA片段的連接(補充)2.銜接物連接法
當前58頁,總共90頁。第二節(jié)
DNA連接酶平末端DNA片段的連接(補充)3.DNA接頭(adaptor)連接法
問:銜接物和DNA接頭有什么區(qū)別???銜接物(linker)是一種人工合成的雙鏈DNA短片段,其上具有一個或數個在將與其連接的載體DNA上不存在的限制酶識別位點,可按平齊末端連接法給平齊末端片段加上相同識別位點的銜接物,再用在銜接物中具有識別位點的合適限制酶切割,用常規(guī)方法連接的方法,提高平齊末端間的連接作用效率。也可利用接頭進行DNA平齊末端門的連接。接頭(adaptor)是一種具有粘性末端的短核苷酸雙鏈,它與平齊末端連接后,不用經過切割即可與載體相連。當前59頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶DNA聚合酶
3’5’外切酶活性5’3’外切酶活性聚合速率
持續(xù)能力
大腸桿菌DNA聚合酶
低
有
中
低
Klenowfragment
低
無
中
低
T4DNA聚合酶
高
無
中
低
T7DNA聚合酶
高
無
快
高
化學修飾T7DNA聚合酶
低
無
快
高
遺傳修飾T7DNA聚合酶
無
無
快
高
逆轉錄酶
無
無
低
中
TaqDNA聚合酶
無
有
快
高
DNA聚合酶(DNApolymerase)是指能在引物和模板的存在下,將脫氧核糖單核苷酸連續(xù)地加到雙鏈DNA分子引物鏈的3‘-OH末端,催化核苷酸的聚合作用。分為:依賴于DNA的DNA聚合酶和依賴于RNA的DNA聚合酶。當前60頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶一、大腸桿菌DNA聚合酶I
1957年,美國的生物學家A.Kornberg首次證實,在大腸桿菌提取物中存在一種DNA聚合酶,即現在所說的DNA聚合酶I。當前61頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶CCGGGCTATCGGE.coliDNApolIMg2+,4dNTPCCGATAGCCGGCTATCGG1.5’→3’聚合酶活性GATAGCCAGCTATCGGTCGATAGCCAGCTATCGGE.coliDNApolIMg2++pC,pT5′TCGATAGCCAGCTATE.coliDNApolIMg2+TCGATAAGCTAT+pC,pG,pC5′2.5’→3’外切酶活性3.3’→5’外切酶活性
DNA聚合酶的三種活性當前62頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶一、大腸桿菌DNA聚合酶I用途:
1)除去3’-端突起的單鏈DNA(在無dNTP時)
2)補齊5’-突起端
3)合成第二條cDNA其中用途2)和3)常用大片段當前63頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶二、Klenow片段
(一)基本性質大腸桿菌DNA聚合酶I經枯草桿菌蛋白酶處理,獲得N端三分之二的大肽段,即Klenow片段。
Klenow片段仍擁有5`→3`的DNA聚合酶活性和3`→5`的核酸外切酶活性,但失去了5`→3`的核酸外切酶活性。
當前64頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶二、Klenow片段
(二)用途
1.3’端補平:補平限制性內切酶切后形成的3’隱蔽端。
2.DNA3’末端標記:在3’隱蔽端加上放射性標記的dNTP。5’klenow
klenow
5’
當前65頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶二、Klenow片段
(二)用途
3.cDNA第二鏈的合成
mRNAcDNA第一鏈逆轉錄cDNA第二鏈klenow
5’3’3’
5’
5’3’
引物
當前66頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶三、T4噬菌體DNA聚合酶(一)T4DNA酶的基本特性有3`→5`的核酸外切酶活性和5`→3的DNA聚合酶活性(降解單鏈更快)
。
在無dNTP時,可以從任何3`-OH端外切在四種dNTP均存在時,聚合活性占主導地位
當前67頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶三、T4噬菌體DNA聚合酶(二)用途當前68頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶四、T7噬菌體DNA聚合酶與測序酶
(一)T7噬菌體DNA聚合酶從T7噬菌體感染大腸桿菌細胞中純化出來的,由兩個亞基組成,已知DNA聚合酶中持續(xù)結合能力最強的一個。
(二)T7噬菌體DNA測序酶通過對T7DNA聚合酶進行化學修飾,去除3’5’外切酶活性,使DNA聚合能力和聚合速率提高了3倍。
當前69頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶二、TaqDNA聚合酶
來源:從耐熱細胞中純化,已有基因工程酶多種。
結構:單亞基MW=94000d。
特點:熱穩(wěn)定性,70℃反應2h殘留活性為原來的90%;93℃反應2h殘留活性為原來的60%;94℃反應2h殘留活性為原來的40%?;钚裕壕酆献钸m溫度為75-80℃,不具3’→5’外切酶活性,具5’→3’外切活性。用途:
1.PCR反應。
2.測序,高溫下進行DNA合成可減少模板二級結構。當前70頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶三、逆轉錄酶(reversetranscriptase)
依賴RNA的DNA聚合酶(RNA指導的DNA聚合酶)。
來源商品反轉錄酶有兩種:來自禽類成髓細胞瘤病毒(AMV)(42℃)。來自能表達Moloney鼠白血病毒(M-MLV)反轉錄酶基因的E.coli(37℃)。
結構和活性:酶類別肽鏈5’-3’聚合活性RNAseHAMVα62,000β94,000
++++M-MLV84,000++當前71頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶五、逆轉錄酶(reversetranscriptase)
用途:
(1)5’→3’聚合酶活性,能以RNA或DNA模板合成DNA分子;
(2)RNA酶H活性:對RNA:DNA雜交體中的RNA特異性地降解,免除了在反轉錄完成后再用NaOH降解RNA模板的步驟。
(3)用于3’凹陷末端的標記,雜交探針的制備和DNA序列測定。當前72頁,總共90頁。第三節(jié)
DNA聚合酶和反轉錄酶五、逆轉錄酶(reversetranscriptase)
RNaseH活性當前73頁,總共90頁。第四節(jié)DNA修飾酶一、末端脫氧核苷酸轉移酶來源及特點:
簡稱末端轉移酶(terminaldeoxynucleotidyltransferase,TdT),能催化5’脫氧核苷三磷酸進行5’→3’方向的聚合作用,逐個地將脫氧核苷酸分子加到線性DNA分子的3’-OH末端。
它不需要模板,可以用含有的3’-OHDNA片段為引物,在3’-OH端加入核苷酸達幾百個。它作用的底物可以是具有3’-OH末端的單鏈DNA,也可以是具有3’-OH突出末端的雙鏈DNA。用途:
1.催化[α-32P]-3’-脫氧核苷酸標記DNA片斷的3’末端。
2.催化非放射性的標記物摻入到DNA片斷的3’-末端:
生物素等,摻入后可產生熒光染料或抗生物素蛋白結合物的接受位點。
3.用于在平頭DNA上合成一段寡聚核苷酸,從而形成粘性末端。當前74頁,總共90頁。第四節(jié)DNA修飾酶當前75頁,總共90頁。末端轉移酶功能圖解第四節(jié)DNA修飾酶3‘突出末端當前76頁,總共90頁。一、T4噬菌體多核苷酸激酶來源從T4感染大腸桿菌細胞中分離出來。多種哺乳動物細胞中也發(fā)現這種酶。功能
催化磷酸從ATP轉給雙鏈或單鏈DNA或RNA的5’-OH端。
不論5’-OH端突出與否。
用途:DNA5’-OH端磷酸化、標記DNA的5’端。5’3’HO--OH5’3’HO--OH3’P--OH5’3’HO--P5’ATPT4多核苷酸激酶第四節(jié)DNA修飾酶當前77頁,總共90頁。二、堿性磷酸酶
1)堿性磷酸酶種類
細菌性堿性磷酸酶(Bacterialalkalinephosphatase,BAP),從大腸桿菌中分離出來。具有抗熱性。
小牛腸堿性磷酸酶(Calfintestinalalkalinephosphatase,CIAP),從小牛腸中純化出來。加熱68℃可完全失活。
2)堿性磷酸酶的特性
催化脫掉DNA(或RNA)5’端的磷酸根。
3’HO-
-P
5’
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