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1、1.打開(kāi)需要分析的cDNA序列第1頁(yè)/共26頁(yè)2.合并需要分析的cDNA序列第2頁(yè)/共26頁(yè)3.保存合并的cDNA序列文件(文件名后綴為.fas)第3頁(yè)/共26頁(yè)4.打開(kāi)clustalx.exe程序第4頁(yè)/共26頁(yè)5.將合并文件載入clustalx.exe程序中第5頁(yè)/共26頁(yè)6. 打開(kāi)文件名為1.fas第6頁(yè)/共26頁(yè)7. 執(zhí)行陰影的命令第7頁(yè)/共26頁(yè)8. 執(zhí)行命令，輸出文件(文件后綴為.aln)第8頁(yè)/共26頁(yè)9.打開(kāi)MEGA3.exe程序第9頁(yè)/共26頁(yè)10. 執(zhí)行命令第10頁(yè)/共26頁(yè)11. 執(zhí)行命令,點(diǎn)擊1.aln文件，點(diǎn)擊OK第11頁(yè)/共26頁(yè)12. 執(zhí)行命令，消除亂碼，另存此處

2、為文件末端，如果有亂碼，就需要?jiǎng)h除，然后再另存第12頁(yè)/共26頁(yè)13. 執(zhí)行命令，另存文件后綴為.meg第13頁(yè)/共26頁(yè)14. 執(zhí)行命令，文件名為1.meg，關(guān)閉程序第14頁(yè)/共26頁(yè)15. 重新打開(kāi)MEGA3.EXE程序，執(zhí)行命令，激活文件名1.meg點(diǎn)擊此處，激活文件第15頁(yè)/共26頁(yè)16. 激活文件名1.meg第16頁(yè)/共26頁(yè)選擇需要分析的種類(lèi)，此處選擇核酸分析點(diǎn)擊OK第17頁(yè)/共26頁(yè)點(diǎn)擊YES,此處為演示,對(duì)ORF分析,其實(shí)不能夠點(diǎn)YES的.最好是蛋白質(zhì)序列第18頁(yè)/共26頁(yè)點(diǎn)擊OK，得到結(jié)果如下圖第19頁(yè)/共26頁(yè)第20頁(yè)/共26頁(yè)第21頁(yè)/共26頁(yè)點(diǎn)擊，運(yùn)行完畢第22頁(yè)/共26頁(yè)得到進(jìn)化樹(shù)的圖形第23頁(yè)/共26頁(yè)可以選擇的格式復(fù)制此進(jìn)化樹(shù)圖片（放入WORD內(nèi)，可以做修改）第24頁(yè)/共26頁(yè)制作過(guò)程結(jié)束！

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