高斯軟件基礎教程

1、.gaussview界面教程【1】界面介紹gview是一個專門設計于高斯配套使用的軟件，其主要用途有兩個：構建高斯的輸入文件；以圖的形式顯示高斯計算的結(jié)果。除了可以自己構建輸入文件外，gview還可讀入chem3d，hyperchem和晶體數(shù)據(jù)等諸多格式的文件。從而使其可以于諸多圖形軟件連用，大大拓寬了使用范圍。開啟gaussview會看到一大一小兩個窗口，后面灰色背景的窗口為選擇窗口，在里面選擇要輸入的分子或基團；前面紫色的窗口為繪圖窗口，使用鼠標繪制想要繪制的圖形。精品.菜單欄 【file】主要功能是建立，打開，保存和打印當前的文件 【edit】完成對分子的剪貼、拷貝、刪除、抓圖等 【vi

2、ew】與顯示分子相關的都在這個菜單下，如顯示氫原子、鍵、元素符號、坐標等 【calculate】直接向gaussian提交計算 【results】接收并顯示gaussian計算后的結(jié)果 【windows】控制窗體，如關閉、恢復等 【help】幫助 快速工具欄【左面第一個】選擇元素與價鍵，單擊打開會看到一個元素周期表，通過它可以選擇需要繪制的元素以及價態(tài)。精品.【左面第二個】環(huán)工具，作用與上一個差不多，只是這里提供的都是環(huán)狀化合物殘基；精品.【左面第三個】提供常用的r基團模板，其中包括乙基、丙基、異丙基、異丁基等精品.【左面第四個】氨基酸殘基，使用它可以迅速繪制氨基酸【左面第五個】用戶自定義基團

3、，您可以將常用的基團存放到此處這條快速編輯欄中從左到右依次是【鍵調(diào)整】|【鍵角調(diào)整】|【二面角調(diào)整】|【查詢已有結(jié)構】|【增加化學鍵】|【刪除化學鍵】|【翻轉(zhuǎn)原子】|【單個選擇】|【框選】|【去除選擇】|【全選】這里面的所有選項都可以通過在繪圖窗口點擊右鍵得到。精品.3、常用工具欄這兩條條工具欄是最常用的，幾乎所有軟件都有的新建打開等工具gaussview教程【2】構建分子這里以構建一個間氟苯乙烷分子并從gaussview里遞交計算為例來說明。1、 開啟gview2、 雙擊按鈕，選擇苯基（第一個），會看到主程序框體中出現(xiàn)苯環(huán)精品.在工作窗口單擊，可以看到工作窗口也出現(xiàn)了一個苯環(huán)。單擊左鍵，可以

4、將主程序框體中的分子或基團加入到工作窗口；按上下左右鍵，或者左鍵單擊不放移動鼠標，可以調(diào)節(jié)分子的角度；滾動鼠標滾輪，可以放大縮小分子；按住shift鍵，左鍵單擊不放移動鼠標，可以移動分子；當工作窗口內(nèi)有多個分子時（在構建大的分子時，這種情況很容易出現(xiàn)）用shift+alt+鼠標左鍵組合，移動想要移動的分子；用ctrl+alt+鼠標左鍵組合調(diào)節(jié)其中一個分子的角度；雙擊圖標（或者左鍵不放），在元素周期表中選擇【f】元素，回到工作窗口在苯的任意一個【h】上單擊，使之變成【f】精品.雙擊圖標，從鏈烴庫中選擇【乙基】（第一個），然后點擊間位上的【h】即可精品.至此，分子式已經(jīng)構建完成，gview存儲個人

5、常用分子的功能，雙擊view上的圖標，在下面的對話框中鍵入相關項目，保存即可。（注：我的程序此項功能不行，用戶自定義基團）查看分子坐標：單擊gview界面的圖標，查看分子的坐標。精品.至此，我們保存一下我們構建好的間氟苯乙烷分子，在繪圖界面右鍵單擊【file】【save】然后選擇保存路徑即可。gaussview教程【3】向gaussian提交計算上一講我們已經(jīng)構建好了一個間氟苯乙烷分子，現(xiàn)在打開間氟苯乙烷分子。精品.點擊gview界面上的【calculate】【gaussian calculate setup】從對話框中我們可以選擇許多參數(shù)，下面依次選擇一下精品.【job type】工作類型：

6、【energy能量】|【optimization優(yōu)化】|【frequency頻率】|【opt+freq優(yōu)化頻率】|【scan掃描】|【stability穩(wěn)定性】|【nmr核磁】，這里我們選擇【nmr】核磁 【method】方法：每種計算模式都提供了若干種方法，這里選擇默認值即可 【title】題目：這項可以根據(jù)自己的項目自行命名 【link 0】給檢查點文件命名 其它選擇默認即可 精品.選好后點擊【submit】提交至gaussian，并保存。（最好存到安裝文件所在磁盤）系統(tǒng)會詢問是否提交至gaussian，選擇【ok】，gaussian會自動開啟并計算，計算時間因硬件配置而異精品.計算完畢后

7、系統(tǒng)會提示關閉gaussian，點擊【是】精品.計算完畢后會生成兩個文件，.log的是系統(tǒng)日志，便于查看計算結(jié)果。這里我們選擇.chk文件【ok】接下來我們又一次看到了剛才繪制的那個分子，表面上沒什么不同，但這次我們可以預言它的許多性質(zhì)了，在gview的主界面點擊【results】【summary】可以看到剛才的計算總結(jié)，點擊【view file】可以看到日志文件。精品.因為我們剛才選擇計算模式是【nmr】核磁，所以我們點擊【results】【nmr】，隨即我們看到了很熟悉的核磁圖譜，但似乎很亂，因為這是所有元素的核磁譜圖，在左下方【element】右方選擇【h】，即h譜，旁邊【reference】選擇【