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5TBE(組份濃度:5TBE,pH 8.3;配制量:1 L):稱取53.9 g Tris,27.5 g硼酸,量取20 ml 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0),置于1 L燒杯中;加入約800 ml超純水,充分?jǐn)嚢枞芙?;加超純水將溶液定容? L;室溫保存。10% 過硫酸銨(組份濃度:10% (W/V) 過硫酸銨;配制量:10 ml):稱取1 g過硫酸銨,置于1050 ml燒杯中;加入約8 ml超純水,攪拌溶解;加超純水將溶液定容至10 ml;4 保存(保存時(shí)間為2周左右,超過期限過硫酸銨將失去催化作用)。30% 丙烯酰胺(組份濃度:30% (W/V)丙烯酰胺;配制量:1 L):稱取290 g丙烯酰胺,10 g N,N-亞甲基雙丙烯酰胺,置于1 L燒杯中;加入約600 ml超純水,水浴加熱至37 ,充分?jǐn)嚢柚寥芙?;加超純水將溶液定容? L,用0.45 m濾膜過濾除去雜質(zhì);并檢測該溶液pH值應(yīng)不大于7;棕色瓶4 保存。0.1% AgNO3(組份濃度:0.1% (W/V) AgNO3;配制量:1 L):稱取1 g AgNO3,置于1 L燒杯中;加入約800 ml超純水, ;加超純水將溶液定容至1 L;棕色瓶室溫保存。顯色液(組份濃度:2% (W/V) NaOH,0.04% (W/V) Na2CO3,0.4% (W/V) 37%甲醛;配制量:1 L):稱取20 g NaOH,0.4 g Na2CO3,置于1 L燒杯中;加入約800 ml超純水,充分?jǐn)嚢枞芙?;? ml 37%甲醛溶液,加超純水將溶液定容至1 L;室溫保存。10% 冰乙酸(組份濃度:10% 冰乙酸;配制量:1 L):量取100 ml冰乙酸,置于1 L燒杯中;加入約800 ml超純水,攪拌混勻;加超純水將溶液定容至1 L;室溫保存。2.2.6 電泳檢測2.2.6.1 玻璃板清洗首先用去污粉將電泳用玻璃板、膠墊、梳子等反復(fù)清洗;然后用級蒸餾水漂洗23次,直至玻璃板表面出現(xiàn)均勻水膜,既不聚成水滴,也不成股流下;再用超純水漂洗1次,晾干;最后用無水乙醇擦拭,晾干備用74。2.2.6.2 緩沖液貯液和凝膠母液的制備緩沖液貯液用5TBE,具體配制方法見2.1.2.2,用時(shí)稀釋5倍。凝膠母液用30%丙烯酰胺,具體配制方法見2.1.2.2。2.2.6.3 聚丙烯酰胺凝膠的制備10% 非變性聚丙烯酰胺凝膠(兩塊,約55 ml)各組分用量如下58:30% 丙烯酰胺:18 ml5TBE:11 ml超純水:25 mlTEMED:36 ml10% 過硫酸銨:385 ml具體操作步驟如下75:首先,按要求組裝好垂直電泳板,兩塊玻璃板的底部用1.5% 瓊脂糖封邊,防止封閉不嚴(yán)而導(dǎo)致聚丙烯酰胺膠液漏出。然后,灌膠。分別量取配比用量的30% 丙烯酰胺、5TBE和超純水置于100 ml燒杯中,用玻璃棒攪拌混勻;然后用微量加樣器加入配比用量的10% 過硫酸銨和TEMED,加入后聚合即開始,迅速搖勻;立即用玻璃棒引流,將混合液灌注于兩塊玻璃板之間,灌膠過程一次性完成,避免產(chǎn)生氣泡;灌膠完成后,一次性平穩(wěn)插入樣梳以形成點(diǎn)樣孔。最后,待聚合完全后往電泳槽中加入1TBE緩沖液直至沒過點(diǎn)樣孔,且正負(fù)極槽內(nèi)緩沖液高度應(yīng)一致。聚合時(shí)間一般在3060 min左右,凝膠聚合完全的標(biāo)志是點(diǎn)樣孔附近形成清晰的界面,輕輕拔去樣梳,避免破壞點(diǎn)樣孔,并立即用電泳緩沖液沖洗點(diǎn)樣孔,以清除點(diǎn)樣孔中的氣泡和未凝固完全的膠液。2.2.6.4 電泳取PCR擴(kuò)增產(chǎn)物5 ml與1 ml上樣緩沖液混合均勻后點(diǎn)入點(diǎn)樣孔,用10% 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,以20 bp DNA ladder(Takara)作為分子量標(biāo)準(zhǔn),緩沖液為1TBE。接通電源,恒壓180200 V,電泳810 h,直至溴酚藍(lán)距離凝膠邊緣約1 cm時(shí),停止電泳。2.2.6.5 銀染、顯色具體步驟如下76-78:(1)卸下玻璃板,用塑料薄片撬去上面一塊玻璃板,并小心除去下方的瓊脂糖凝膠;然后將附有聚丙烯酰胺凝膠的玻璃板以凝膠面朝下浸入盛有約200 ml超純水的玻璃器皿中,凝膠即脫落于水中,輕輕搖晃15 sec,倒掉液體;(2)加入約200 ml 0.1% AgNO3,置于搖床之上,以輕搖20 min左右,倒掉液體;(3)加入約200 ml超純水,輕搖15 sec,倒掉液體;(4)加入約200 ml顯色液,輕搖510 min,直至出現(xiàn)清晰帶型,倒掉液體;(5)加入約200 ml超純水,輕搖15 sec,倒掉液體;(6)加入約200 ml 10% 冰乙酸,固定;(7)用Bio-Rad紫外凝膠成像系統(tǒng)觀察,照相以記錄電泳結(jié)果。1.4.3 聚丙烯酰胺凝膠改進(jìn)的銀染方法(1) 電泳結(jié)束后切斷電源, 從電泳槽中倒出緩沖液, 然后取下膠板, 將凝膠從玻板中取出放入裝有蒸餾水的瓷盤中, 用蒸餾水漂洗2 次。(2) 銀染: 加入染色液(0.2%的AgNO3、1%的冰醋酸、1
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