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文檔簡(jiǎn)介
1 化學(xué)繪圖軟件 ChemDrawChemWindowISISDrawChemSketch主要功能 繪制二維和三維化學(xué)結(jié)構(gòu)式 化學(xué)反應(yīng)方程式 化工流程圖 實(shí)驗(yàn)裝置圖以及相關(guān)文本的編輯 商業(yè)軟件 免費(fèi)軟件 一 概述 2 ChemDraw 當(dāng)前最常用的結(jié)構(gòu)式編輯軟件 除了以上所述的一般功能外 其ultra版本還可以預(yù)測(cè)分子的常見(jiàn)物理化學(xué)性質(zhì)如 熔點(diǎn) 生成熱等 對(duì)結(jié)構(gòu)按IUPAC原則命名 預(yù)測(cè)質(zhì)子及碳13化學(xué)位移等 ChemWindow 最突出的特點(diǎn)是與光譜結(jié)合 它的6 5Spectroscopy版本包括了一個(gè)約五萬(wàn)張13CNMR的數(shù)據(jù)庫(kù) 達(dá)250兆 因而其預(yù)測(cè)更加精確 除了根據(jù)化合物的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)13CNMR化學(xué)位移外 還能預(yù)測(cè)紅外圖譜 質(zhì)譜等 更可以讀入標(biāo)準(zhǔn)格式的NMR IR Raman UV及色譜圖 3 ChemSketch 功能沒(méi)有ChemDraw和ChemWindow強(qiáng)大 但操作方便 界面友善 ISISDraw 老牌繪圖軟件 界面簡(jiǎn)單 操作方便 4 軟件選擇 簡(jiǎn)單化學(xué)結(jié)構(gòu) 4個(gè)軟件都能滿足需要復(fù)雜化學(xué)結(jié)構(gòu) ChemDraw或ChemSketch處理光譜和色譜 DrawIt或ChemWindow3D模型 ChemDraw Chem3DChemOffice功能強(qiáng)大ChemSketch部分版本免費(fèi) 5 美國(guó)CambridgeSoft公司的重要產(chǎn)品之一專業(yè)的集成化學(xué)桌面辦公軟件標(biāo)準(zhǔn)界面的菜單簡(jiǎn)明 易于操作 方便快捷具有化學(xué)計(jì)算 化學(xué)分析和化學(xué)建模等實(shí)用功能 二 ChemOffice 6 1 ChemDraw是一個(gè)化學(xué)結(jié)構(gòu)繪圖軟件 可繪制和編輯高質(zhì)量的化學(xué)結(jié)構(gòu)圖 識(shí)別和顯示立體結(jié)構(gòu) 部分物性 將結(jié)構(gòu)和名稱進(jìn)行轉(zhuǎn)換 2 chem3D是一個(gè)用于設(shè)計(jì)化學(xué)模型的應(yīng)用軟件 可將二維平面的有機(jī)分子結(jié)構(gòu)圖形轉(zhuǎn)化成三維的空間結(jié)構(gòu) 可輔助計(jì)算分子半徑的幾何構(gòu)象和單個(gè)點(diǎn)的能量以及相關(guān)的性質(zhì) 例如優(yōu)化模型 構(gòu)象搜索 分子動(dòng)力學(xué)和計(jì)算分子的單點(diǎn)能量等 3 ChemInfo是基于國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)開(kāi)發(fā)的智能型數(shù)據(jù)管理系統(tǒng) 可以建立分子結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫(kù) 4 chemFinder是一個(gè)化學(xué)信息管理系統(tǒng) 可以用它來(lái)管理化學(xué)信息 組成 7 ChemOffiee的安裝 8 9 Chemdraw簡(jiǎn)介 Chemdraw是一個(gè)方便快捷的化學(xué)繪圖工具 可以迅速畫(huà)出各種各樣的化學(xué)結(jié)構(gòu)及化學(xué)反應(yīng)式 以及與化學(xué)有關(guān)的其它圖形表示 具有多種輸入輸出功能 可以直接將所繪制的圖片等以常見(jiàn)的格式輸出 可由word等文字處理器識(shí)別的 便于一般的文檔處理 10 Chemdraw簡(jiǎn)介 具有預(yù)測(cè)1HNMR和13CNMR 核磁共振 譜圖的功能 不僅可以生成圖譜 還可以直接計(jì)算出各個(gè)峰的位置和面積 高度 為化學(xué)研究帶來(lái)了極大的方便 CheroDraw已經(jīng)成為化學(xué)工作者撰稿和進(jìn)行學(xué)術(shù)交流公認(rèn)的化學(xué)結(jié)構(gòu)輸入軟件 化學(xué)軟件的泰斗 11 ChemDrawUltra8 0 超級(jí)版 ChemDrawPro8 0 標(biāo)準(zhǔn)版 ChemDrawStd8 0 專業(yè)版 ChemDrawLtd8 0 受限版 四種版本功能由強(qiáng)到弱 12 ChemDraw起始界面 13 圖形工具板 狀態(tài) 信息欄 編輯區(qū) 滾動(dòng)欄 菜單欄 工具欄 14 15 套索實(shí)鍵雙鍵虛鍵切割鍵切割楔鍵黑體鍵黑體楔鍵空心楔鍵波浪鍵表格長(zhǎng)鏈環(huán)丙烷環(huán)環(huán)戊烷環(huán)環(huán)庚烷環(huán)環(huán)己烷椅式環(huán)戊二烯環(huán) 蓬罩橡皮文本筆箭頭軌道繪圖元素基元化學(xué)符號(hào)弧形原子反應(yīng)模板環(huán)丁烷環(huán)環(huán)己烷環(huán)環(huán)辛烷環(huán)環(huán)己烷椅式苯環(huán) 16 鍵工具 模板工具 箭頭工具 軌道工具 畫(huà)圖工具 基元工具 符號(hào)工具 弧形工具 原子反應(yīng)工具 17 18 具體用法為 用鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)中所選擇的工具箱中的工具 然后在右邊用鼠標(biāo)拖動(dòng) 至到畫(huà)出你所需要的碳鏈 畫(huà)碳鏈 19 便捷地畫(huà)出各種各樣的環(huán)狀結(jié)構(gòu) 20 模板按鈕 氨基酸 AminoAcids 芳族 Aromatics 雙環(huán) Bicyclics 生物與膠體 Bioart 儀器1 Clipware part1 儀器2 Clipaware part2 構(gòu)型 Conformers 五元環(huán) CpRings 環(huán)烴 Cycloalkanes DNA Templates 功能團(tuán) FunctionalGroups 雜環(huán) Hexoses 苯環(huán) PhRings 多方體 Polyhedra RNA Templates 立體異構(gòu)體 Stereocenters 超分子 Supramolecules 21 模板工具 氨基酸模板工具 17類 22 模板工具 芳香化合物模板工具 23 模板工具 雙環(huán)模板工具 24 模板工具 生物模板工具 25 模板工具 玻璃儀器模板工具 I 26 模板工具 玻璃儀器模板工具 II 27 模板工具 構(gòu)象異構(gòu)體模板工具 28 模板工具 環(huán)戊二烯模板工具 29 模板工具 脂環(huán)模板工具 30 模板工具 DNA模板工具 31 模板工具 官能團(tuán)模板工具 32 模板工具 己糖模板工具 33 模板工具 苯環(huán)模板工具 34 模板工具 多面體模板工具 35 模板工具 RNA模板工具 36 模板工具 特殊符號(hào)模板工具 立體中心模板工具 37 38 39 40 41 42 43 44 快捷鍵 命令 灰色表示命令未激活 小三角表示子菜單 省略號(hào)表示新對(duì)話框 工具欄 45 文檔設(shè)置 頁(yè)面規(guī)劃 46 頁(yè)眉頁(yè)腳 47 繪圖 48 字體 49 原子格式 50 顏色 設(shè)置背景顏色 51 國(guó)外化學(xué)刊物默認(rèn)文檔格式 52 優(yōu)選項(xiàng) 53 優(yōu)選項(xiàng) 顯示設(shè)置 錯(cuò)誤警告 54 優(yōu)選項(xiàng) 打開(kāi) 存盤(pán) 默認(rèn)路徑 默認(rèn)打開(kāi)文件格式 默認(rèn)存盤(pán)文件格式 55 元素周期表 56 57 符號(hào)窗口 58 符號(hào)窗口 59 打開(kāi)文件 不同文件格式 60 文件格式介紹 1CDTemplate ctp ctr 用于保存模板文檔 2ChemDraw cdx ChemDraw原本格式 是一個(gè)公共標(biāo)記的文件格式 易被其它程序建立和解釋 常用格式 3ChemDrawSteylSheet cds 用于存儲(chǔ)文件設(shè)置和其它物體 4ConnectionTable ct 一種實(shí)例格式 存儲(chǔ)關(guān)于原子與元素 系列編號(hào) X和Y軸 鍵序 鍵類型等的連接和聯(lián)系的列表 是用于多類應(yīng)用程序間互換信息的通用格式 61 5DARC F1 fld QuestelDARC系統(tǒng)中存儲(chǔ)結(jié)構(gòu)的原本文件格式 7ISISReaction rxn MDL開(kāi)發(fā)的格式 用于存儲(chǔ)元素反應(yīng)信息 8ISISSketch skc 在Windows或Macintosh環(huán)境下 存儲(chǔ)并傳輸?shù)搅硗獾腎SIS應(yīng)用程序中 6DARC F1Query flq QuestelDARC系統(tǒng)中存儲(chǔ)查詢的原本文件格式 62 9MDLMolFile mol MDL 分子設(shè)計(jì)有限公司 MolFile文件格式用于其它一些在Windows Macintosh和Unix環(huán)境下的化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和繪畫(huà)應(yīng)用軟件 11JcampSpectra jdx dx 圖譜文件格式 可讀入紫外 質(zhì)譜 紅外 核磁等數(shù)據(jù)文件 12MSIChemNote msm 一種ASCII文本文件 可以用于像ChemNote一類的應(yīng)用程序 10GalacticSpectra spc 銀河圖譜文件格式 63 13SMD4 2 smd ASCII文本文件 一般用于檢索化學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù) 14WindowsMetafile wmf 圖片文件格式 可以將ChemDraw圖片傳輸?shù)狡渌鼞?yīng)用程序中 如Word WMF文件格式含有中ChemDraw的結(jié)構(gòu)信息 可被ChemDraw早期版本編輯 64 點(diǎn)位 移動(dòng)鼠標(biāo)直到鼠標(biāo)的光標(biāo)放到所要進(jìn)行操作的位置 如果選擇的位置在圖形結(jié)構(gòu)中的鍵 原子 線等的上面 一般出現(xiàn)黑方塊 稱之為光標(biāo)塊 選擇塊或操作塊 光標(biāo)塊 常用術(shù)語(yǔ) 65 單擊 快速按下鼠標(biāo)鍵 左或右鍵 然后快速抬起 雙擊 快速操作兩次單擊 拖動(dòng) 由三部分動(dòng)作組成 按下鼠標(biāo)左鍵選擇對(duì)象 移動(dòng)鼠標(biāo) 將被選的對(duì)象移動(dòng)到指定位置后抬起鼠標(biāo) 選擇 用鼠標(biāo)的光標(biāo)選中某種選擇 使對(duì)象產(chǎn)生光標(biāo) 選擇對(duì)象并不意味著動(dòng)作 只是標(biāo)記要操作的對(duì)象和點(diǎn)位 66 鍵 單擊 按下特殊的鍵和單擊鼠標(biāo)鍵同時(shí)進(jìn)行 如 Shift 單擊 意思是按下 Shift 鍵和單擊鼠標(biāo)鍵 鍵 拖動(dòng) 按下特殊的鍵和鼠標(biāo)鍵 移動(dòng)鼠標(biāo) 如 Shift 拖動(dòng) 意思是按下 Shift 鍵和拖動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo) 67 示例1 阿司匹林的結(jié)構(gòu) 68 優(yōu)化結(jié)構(gòu) CleanUpStructure 旋轉(zhuǎn)和縮放 圖形存盤(pán) 粘貼至word或ppt 檢查結(jié)構(gòu)錯(cuò)誤 CheckStructure 69 示例2 根據(jù)化合物名稱得到結(jié)構(gòu)式 Structure ConvertNametoStructure InsertStructure 輸入 阿司匹林可輸入2 acetoxybenzoicacid或aspirinEDTA 嗎啡morphine 70 示例3 根據(jù)結(jié)構(gòu)得出化合物命名 繪制腎上腺素的結(jié)構(gòu)式 選中結(jié)構(gòu) 執(zhí)行 sturucture convertstructuretoname 71 將名稱轉(zhuǎn)化成結(jié)構(gòu) 72 示例 三肽分子的繪制 73 示例4 預(yù)測(cè)核磁共振化學(xué)位移 心得安結(jié)構(gòu)式 74 1HNMR預(yù)測(cè) 1HNMR位移 75 1HNMR預(yù)測(cè)結(jié)果 76 預(yù)測(cè)結(jié)果 77 13CNMR預(yù)測(cè) 13CNMR位移 78 13CNMR預(yù)測(cè)結(jié)果 79 部分預(yù)測(cè)結(jié)果 80 H NMR C NMR 81 示例5 分析結(jié)構(gòu)估計(jì)性質(zhì) 82 83 分析結(jié)果窗口 分子式 精確質(zhì)量 分子量 質(zhì)譜分析 元素分析 結(jié)果粘貼 兩位小數(shù) 質(zhì)譜圖 84 示例6 顯示分子化學(xué)性質(zhì) 85 86 View ShowChemicalPropertiesWindow 菜單 87 示例6 反應(yīng)方程式 88 選擇 點(diǎn)位 拖動(dòng) 定位 單擊 單擊 定位 單擊生成雙鍵 拖動(dòng)生成雙鍵 反應(yīng)方程式 89 雙擊生成文本框 輸入字母 按Ctrl鍵 拖動(dòng)復(fù)制 反應(yīng)方程式 90 反應(yīng)方程式 定位 單擊生成一單鍵 再定位 連續(xù)單擊生成三單鍵 定位 雙擊后輸入OH 91 反應(yīng)方程式 用套索或蓬罩進(jìn)行部分選擇 92 反應(yīng)方程式 按Ctrl鍵 拖動(dòng)復(fù)制 生成獨(dú)立的兩個(gè)分子 93 反應(yīng)方程式 選擇反應(yīng)箭頭 在兩個(gè)分子中單擊生成一反應(yīng)箭頭 94 反應(yīng)方程式 箭頭上方建立文本框 輸入反應(yīng)條件 95 反應(yīng)方程式 選擇電荷 定位 添加負(fù)電荷 96 反應(yīng)方程式 選擇居中 分子下方建立文本框 97 反應(yīng)方程式 依次輸入文本信息 98 反應(yīng)方程式 選擇陰影框 將反應(yīng)方程式全部罩上 99 練習(xí) 繪制化學(xué)反應(yīng)式 100 示例7 繪制中間體結(jié)構(gòu) 101 繪制中間體結(jié)構(gòu) 選擇環(huán)己烷以建立六員環(huán)模型 選擇橡皮 擦去六員環(huán)一部 102 繪制中間體結(jié)構(gòu) 選擇單鍵定位 連續(xù)單擊生成新的單鍵 單擊單鍵中央 生成雙鍵 103 繪制中間體結(jié)構(gòu) 在原子上定位建立標(biāo)記 104 繪制中間體結(jié)構(gòu) 選擇筆工具 在曲線菜單中選擇箭頭位于末端 105 繪制中間體結(jié)構(gòu) 定位拖動(dòng)鼠標(biāo)左鍵 定位單擊生成曲線箭 按Esc鍵退出繪制模式 106 單擊箭頭 繪制中間體結(jié)構(gòu) 用小手形光標(biāo)移動(dòng)造另一虛線 107 小手形光標(biāo)選中虛線柄 繪制中間體結(jié)構(gòu) 拖動(dòng)改變虛線箭形狀 按Esc鍵 108 示例8 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 109 示例8 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 選擇環(huán)己烷 并添加第一個(gè)環(huán) 添加第二個(gè)環(huán) 110 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 橡皮擦去多余部分 111 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 選擇鍵工具 單擊生成新的單雙鍵 112 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 在原子上定位建立標(biāo)記 113 示例9 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 114 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 選擇鍵工具 連續(xù)單擊生成五連鍵 115 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 建立與五連鍵垂直的水平鍵 116 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 在原子上定位建立標(biāo)記 117 示例10 透視圖形 118 透視圖形 選擇環(huán)己烷 旋轉(zhuǎn)環(huán)己烷 在原子上定位建立標(biāo)記 旋轉(zhuǎn)指示箭頭 119 透視圖形 添加垂直鍵 按Alt鍵 任意鍵長(zhǎng) 120 透視圖形 選擇套索工具 陰影右下腳按Shift鍵 向上按動(dòng) 垂直壓縮50 121 透視圖形 在原子上定位建立標(biāo)記 122 透視圖形 選擇黑體楔鍵 單擊下部?jī)蓚?cè)鍵的中央 123 透視圖形 選擇黑體鍵 單擊底鍵的中央 124 六 Newman結(jié)構(gòu) 125 六 Newman結(jié)構(gòu) 選擇鍵工具 連續(xù)單擊生成三鍵對(duì)稱結(jié)構(gòu) 按Ctrl鍵 拖動(dòng)復(fù)制 126 六 Newman結(jié)構(gòu) 選擇鍵工具 按住Alt鍵 連接兩個(gè)結(jié)構(gòu) 127 六 Newman結(jié)構(gòu) 選擇軌道工具 定位中心原子 按住Alt鍵 按下鼠標(biāo)鍵 向外按動(dòng)建立軌道 128 六 Newman結(jié)構(gòu) 部分選擇上面分結(jié)構(gòu) 右上腳雙擊旋轉(zhuǎn)柄 對(duì)話框中輸入180 單擊旋轉(zhuǎn) 129 六 Newman結(jié)構(gòu) 從Object菜單選擇BringtoFront命令 130 六 Newman結(jié)構(gòu) 后面結(jié)構(gòu)移至前面 按Esc鍵 添加陰影框 131 七 立體化學(xué) 132 七 立體化學(xué) 133 七 立體化學(xué) 134 七 立體化學(xué) 135 七 立體化學(xué) 136 反應(yīng)裝置 示例11 實(shí)驗(yàn)裝置 137 示例12 薄層色譜圖 薄層色譜圖 138 示例13 質(zhì)譜碎片 基團(tuán)分割工具 139 基團(tuán)分割鍵 140 繪制完結(jié)構(gòu)后 在ChemF網(wǎng)站查找相關(guān)信息 ChemDraw在線信息 141 該化合物的相關(guān)數(shù)據(jù) 壬二酸 142 該化合物的供應(yīng)商查詢 143 兩個(gè)查詢結(jié)果 144 化合物名稱 化合物其它名稱 145 索取詳細(xì)資料 146 詳細(xì)資料展示
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