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熱點(diǎn)專題13

PCR技術(shù)及其應(yīng)用(本欄目對(duì)應(yīng)學(xué)生用書P312)[熱點(diǎn)歸納]1.概念PCR是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的縮寫,它是一項(xiàng)根據(jù)DNA半保留復(fù)制原理,在體外提供參與DNA復(fù)制的各種組分與反應(yīng)條件,迅速擴(kuò)增DNA片段的技術(shù),它能以極少量的DNA為模板,在短時(shí)間內(nèi)復(fù)制出上百萬份的DNA。2.PCR的原理(1)DNA分子的熱變性原理。當(dāng)溫度超過90℃時(shí),DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)將解體,雙鏈分開,這個(gè)過程稱為變性。溫度緩慢降低到50℃左右時(shí),兩條彼此分離的DNA鏈重新結(jié)合成雙鏈,這個(gè)過程稱為復(fù)性。DNA雙鏈DNA單鏈(2)耐高溫的DNA聚合酶。高溫解決了打開雙鏈的問題,但是,又導(dǎo)致DNA聚合酶失活的問題,耐高溫的DNA聚合酶解決了高溫導(dǎo)致DNA聚合酶失活的問題,促成了PCR技術(shù)的自動(dòng)化。(3)關(guān)于引物。①概念:引物是一小段能與DNA母鏈的一段堿基序列互補(bǔ)配對(duì)的短單鏈核酸。用于PCR的引物長(zhǎng)度一般為20~30個(gè)核苷酸。②作用:使DNA聚合酶能夠從引物的3'端開始連接脫氧核苷酸,見下圖:

(4)PCR(體外的DNA復(fù)制)的條件。①控制溫度,但不需解旋酶。②DNA模板。③原料:dNTP,包含dATP、dCTP、dGTP、dTTP,除提供原料外,還提供能量。④耐高溫的DNA聚合酶。⑤分別與兩條模板鏈相結(jié)合的兩種引物。⑥需要在一定的緩沖液中進(jìn)行。3.PCR的過程(1)一般情況下,DNA模板鏈較長(zhǎng),需要PCR擴(kuò)增的基因只是DNA模板鏈的一段。(2)第一輪循環(huán),兩引物與模板鏈互補(bǔ),DNA分子模板鏈最長(zhǎng),新合成的DNA單鏈(含有引物的鏈)較短。(3)第二輪循環(huán),以含有引物的母鏈為模板合成的DNA分子,會(huì)出現(xiàn)含有引物的DNA,其中新合成的單鏈b會(huì)比母鏈量更短,其實(shí)b就是我們所需擴(kuò)增的目的基因的長(zhǎng)度,只是b為單鏈。(4)第三輪循環(huán),以b為模板合成的DNA片段就是目的基因片段的長(zhǎng)度。(5)結(jié)果分析。①兩條單鏈等長(zhǎng)DNA(目的基因)從第三輪循環(huán)開始出現(xiàn)(甲、乙)。隨循環(huán)次數(shù)的增加,目的基因含量會(huì)不斷增加。②通過以上分析可知,PCR反應(yīng)的產(chǎn)物不都是所需的目的基因片段,除目的基因外,還會(huì)存在四種類型的DNA分子(這四種類型同第二輪循環(huán)產(chǎn)生的4個(gè)DNA分子)。③DNA聚合酶只能特異性地復(fù)制處于兩個(gè)引物之間的DNA序列,等長(zhǎng)DNA(目的基因)從第三輪循環(huán)開始出現(xiàn),隨著循環(huán)次數(shù)的增多,呈指數(shù)擴(kuò)增。4.PCR的應(yīng)用現(xiàn)在PCR技術(shù)已廣泛應(yīng)用于遺傳病的診斷、刑偵破案、古生物學(xué)、基因克隆和基因測(cè)序等?!镜淅咳绻阎恍《蜠NA的序列,可采用PCR的方法,簡(jiǎn)捷地分析出已知序列兩側(cè)的序列,具體流程如圖(以EcoRⅠ酶切為例):請(qǐng)據(jù)圖回答問題。(1)步驟Ⅰ用的EcoRⅠ主要存在于

生物中,限制酶存在于該類生物中的主要作用是

。

(2)步驟Ⅱ用的DNA連接酶催化相鄰核苷酸之間的3'-羥基與5'-磷酸間形成

;PCR每次循環(huán)一般可分為

(按順序書寫)三步,其中第二步的目的是

。原核切割外源DNA,保證自身安全磷酸二酯鍵變性、復(fù)性、延伸引物與兩條模板DNA單鏈結(jié)合(3)若下表所列為已知的DNA序列和設(shè)計(jì)的一些PCR引物,步驟Ⅲ選用的PCR引物必須是

(從引物①②③④中選擇,填編號(hào))。

項(xiàng)目DNA序列(虛線處省略了部分核苷酸序列)已知序列PCR引物①5'-AACTATGCGCTCATGA-3'②5'-AGAGGCTACGCATTGC-3'③5'-GCAATGCGTAGCCTCT-3'④5'-TCATGAGCGCATAGTT-3'③④(4)對(duì)PCR產(chǎn)物測(cè)序,經(jīng)分析得到了片段F的完整序列。下列DNA單鏈序列中(虛線處省略了部分核苷酸序列),結(jié)果正確的是

。

A.5'-AACTATGCG……AGCCCTT-3'B.5'-TTGATACGC……CGAGTAC-3'C.5'-GCAATGCGT……TCGGGAA-3'D.5'-AATTCCATG……CTGAATT-3'D【解析】(1)步驟Ⅰ用的EcoRⅠ是一種限制酶,主要存在于原核生物中,它能夠識(shí)別雙鏈DNA分子的某種特定核苷酸序列,進(jìn)而在特定部位將雙鏈DNA切開,顯然限制酶在原核生物中能切割外源DNA,保證自身安全。(2)步驟Ⅱ用的是

DNA

連接酶,DNA連接酶催化形成的是磷酸二酯鍵,即催化相鄰核苷酸之間的

3'-羥基與

5'-磷酸間形成磷酸二酯鍵;PCR循環(huán)包括變性、復(fù)性和延伸三步,該過程中升溫到95

℃是為了使DNA變性解旋,進(jìn)而獲得DNA單鏈,其中第二步復(fù)性是指引物與兩條模板DNA單鏈結(jié)合,進(jìn)而為后續(xù)的延伸做準(zhǔn)備。(3)由于DNA聚合酶只能從5'→3'方向催化子鏈延伸,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則可知,引物①是以目的基因下邊那條鏈的左端為模板向右側(cè)延伸,引物②是以目的基因上邊那條鏈為模板的右端向左側(cè)延伸,引物③是以目的基因下邊那條鏈的右端為模板向右側(cè)延伸,引物④是以目的基因上邊那條鏈的左端為模板向左側(cè)延伸,本題的目的是要擴(kuò)增已知序列兩側(cè)的未知序列,因此,應(yīng)該選擇引物③和④。(4)選項(xiàng)中,A、B、C都是已知序列,只有D是未知序列,而要測(cè)定的是未知序列,故選D。解題指導(dǎo)

熟知PCR擴(kuò)增技術(shù)的原理、步驟和相關(guān)的技術(shù)流程是解答本題的關(guān)鍵,正確分析圖示的信息是解答本題的前提,明確題意是解答本題的基礎(chǔ),掌握堿基互補(bǔ)配對(duì)原則是解答本題的法寶。[高考試練]1.(2024年四川部分學(xué)校一模)人們所需要的大部分核酸的堿基對(duì)數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過DNA合成儀可以合成的最長(zhǎng)核酸鏈的堿基對(duì)數(shù)量,而這種大片段基因的人工合成則可以利用重疊延伸PCR的方法(合成過程如圖所示)。據(jù)圖分析回答下列問題。(1)利用重疊延伸PCR人工合成大片段基因,首先需要設(shè)計(jì)n條單鏈寡核苷酸片段作為引物(如圖中P1~P15),合成這些引物的前提是已知_______

。根據(jù)圖示分析,相鄰近的每2條引物之間均有15~25bp的序列

,若第1輪循環(huán)需要加入引物P6~P9,請(qǐng)?jiān)谙聢D中標(biāo)注出每個(gè)引物的位置。

一段目的基因的核苷酸序列重疊(2)第1輪循環(huán)

(填“需要”或“不需要”)添加模板;第2輪循環(huán)選擇Px和Py分別對(duì)應(yīng)引物

。圖示多輪循環(huán)

(填“能”或“不能”)在同一個(gè)PCR體系中完成,原因是_____________________________

。(3)利用重疊延伸PCR人工合成大片段基因相對(duì)于普通PCR還需要用到

酶;結(jié)合上述內(nèi)容分析利用該技術(shù)合成基因的優(yōu)勢(shì)有______

。

需要P7、P4不能引物之間存在重疊區(qū)域,在同一個(gè)PCR體系中引物之間會(huì)因?yàn)榘l(fā)生堿基互補(bǔ)配對(duì)而無法完成PCR擴(kuò)增DNA連接可以實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)突變、定點(diǎn)敲除【解析】(1)PCR過程中需要有一對(duì)引物,引物設(shè)計(jì)的前提是已知一段目的基因的核苷酸序列;根據(jù)圖示分析,相鄰近的每2條引物之間均有15~25bp的序列存在重疊區(qū)域;若第1輪循環(huán)需要加入引物P6~P9,結(jié)合圖示可知,

引物的位置可標(biāo)注如下:

。(2)PCR擴(kuò)增時(shí)需要模板,故第一輪循環(huán)也需要加入模板;引物需要與模板的3'端結(jié)合,結(jié)合圖示箭頭方向可知,第2輪循環(huán)選擇Px和Py分別對(duì)應(yīng)引物是P7、P4;由于引物之間存在重疊區(qū)域,在同一個(gè)PCR體系中引物之間會(huì)因?yàn)榘l(fā)生堿基互補(bǔ)配對(duì)而無法完成PCR擴(kuò)增,故圖示多輪循環(huán)不能在同一個(gè)PCR體系中完成。(3)利用重疊延伸PCR人工合成大片段基因需要連接不同的DNA片段,故相對(duì)于普通PCR還需要用到DNA連接酶;結(jié)合上述內(nèi)容分析利用該技術(shù)合成基因的優(yōu)勢(shì)有可以實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)突變、定點(diǎn)敲除。2.(2025年湖南長(zhǎng)沙階段練習(xí))豬大腸桿菌會(huì)引起仔豬發(fā)生腸炎、腸毒血癥等疾病。LTB和ST1是豬源大腸桿菌腸毒素基因。研究人員通過重組PCR技術(shù)構(gòu)建了LTB-ST1融合基因,其表達(dá)產(chǎn)物L(fēng)TB-ST1融合蛋白可有效預(yù)防仔豬黃痢,該融合基因構(gòu)建過程如圖所示。請(qǐng)回答下列問題:(1)重組PCR技術(shù)依據(jù)的生物學(xué)原理是

。(2)PCR1和PCR2是在兩個(gè)不同反應(yīng)體系中進(jìn)行的,兩個(gè)反應(yīng)體系中加入的物質(zhì)中不同的是

。PCR1和PCR2的目的是__________

,從而有利于LTB基因和ST1基因融合。

(3)在②過程中,PCR1和PCR2產(chǎn)物的作用是作為

。DNA的半保留復(fù)制模板、引物擴(kuò)增出末端部分堿基序列互補(bǔ)配對(duì)的LTB和ST1單鏈模板、引物(4)引物的作用是_______________________________________________

。(5)定點(diǎn)突變是指使基因特定位點(diǎn)發(fā)生堿基對(duì)的增添、缺失或者替換。重組PCR技術(shù)不僅可用于構(gòu)建融合基因,還可用于基因定點(diǎn)突變。請(qǐng)結(jié)合下圖,說明利用重組PCR技術(shù)進(jìn)行基因內(nèi)部定點(diǎn)突變的方法:__________

。

使耐高溫的DNA聚合酶能夠從引物的3'端開始連接脫氧核苷酸根據(jù)突變位點(diǎn)的堿基序列設(shè)計(jì)引物b和引物c,進(jìn)行重組PCR【解析】(1)PCR是一項(xiàng)根據(jù)DNA半保留復(fù)制的原理,在體外提供參與DNA復(fù)制的各種組分與反應(yīng)條件,對(duì)目的基因的核苷酸序列進(jìn)行大量復(fù)制的技術(shù)。(2)PCR1和PCR2是在兩個(gè)不同反應(yīng)體系中進(jìn)行,擴(kuò)增的是兩個(gè)不同的基因,所以加入的模板不同,引物也不同;由圖可知,PCR1和PCR2的目的是擴(kuò)增出末端部分堿基序列互補(bǔ)配對(duì)的LTB和ST1單鏈,以便于將兩個(gè)基因單鏈根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)接到一起,再以剩下的單鏈部分互為模板擴(kuò)增出LTB—ST1融合基因。(3)PCR1和PCR2的產(chǎn)物是末端部分堿基序列互補(bǔ)配對(duì)的LTB和ST1單鏈,以便于將兩個(gè)基因連接到一起,所以PCR1和PCR2產(chǎn)物堿基互補(bǔ)序列可起到引物的作用,剩余未互補(bǔ)序列可作為PCR擴(kuò)增的模板。(4)(耐高溫的)DNA聚合酶不能從頭開始將脫氧核苷酸聚合為核

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