SZDBZ 92-2014 生物基因信息數(shù)據(jù)庫建設(shè)與管理規(guī)范

SZDB/ZSZDB/Z92—2014生物基因信息數(shù)據(jù)庫建設(shè)與管理規(guī)范2014-01-23發(fā)布2014-02-01實(shí)施深圳市市場監(jiān)督管理局發(fā)布 Ⅱ Ⅲ 1 1 1 4 4 5 5 本國家遺傳學(xué)研究所管理的核酸序列數(shù)據(jù)庫。在我國，雖然生物基因信息數(shù)據(jù)庫的建設(shè)在快速發(fā)展,但1對應(yīng)相同或相似的符號（在核酸中是A、T（或U）、C和G，在蛋白質(zhì)中是氨基2基因組測序過程中，基于構(gòu)建文庫獲得的一定大小片段兩端的序列確定一些重疊群之間的順序關(guān)將數(shù)據(jù)以它的語義來呈現(xiàn)出它的外觀，但是隱藏起它的實(shí)現(xiàn)細(xì)節(jié)，用來減少數(shù)據(jù)的復(fù)雜度,使得工3生物數(shù)據(jù)存儲biologicaldatas直接附加存儲direct-attach在局部區(qū)域網(wǎng)絡(luò)中配置一臺中央備份服務(wù)器，數(shù)據(jù)全部通過網(wǎng)絡(luò)傳輸?shù)奖镜貍浞莘?wù)器上進(jìn)行備4存儲區(qū)域網(wǎng)無服務(wù)器備份storageareanet持續(xù)數(shù)據(jù)保護(hù)continuousdataprDNA:脫氧核糖核酸（Deoxyri56.1.2倫理審查委員會(huì)的成員組成應(yīng)涉及多學(xué)科和多部門，并且有能力對所有倫理6.5.2數(shù)據(jù)庫的日常工作包括數(shù)據(jù)采集、數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)使用、數(shù)據(jù)備和對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息分析得到的數(shù)據(jù)。從已有生物基因信息數(shù)據(jù)庫下載的——第一行是序列標(biāo)識以及相關(guān)的描述信息6GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAA+FASTA序列由標(biāo)準(zhǔn)的IUB/IUPAC核酸代碼表示,如表1所示。FASTA文件每行不應(yīng)超過80個(gè)字符。一個(gè)AAACCGCGCAGTTATTTAAAATATGAATATTTTAAAACTTTTCTTTGTTTTTGTGGCAATGTCTCTGGTGTCATGTAGTACAGCCGCTCCAGCAAAAAGCTURYMKSWHBVDN-——第一列為序列的編號，編號的有效字符為大小寫字母（a-z和A-Z）、數(shù)字（0-9）和一些特殊7——第六列為得分，是注釋信息可能性的說明，可以是序列相似性比對時(shí)的E-value值或基因預(yù)測——第八列為起始編碼的位置，僅對注釋類型為“CDS”有效——第九列為序列的屬性，以多個(gè)鍵值對組成的注釋信息描述，鍵與值之間用“=”，不同的鍵值1.+.ID=id0;Dbxref=taxon:1032845sy.+.ID=gene0;Name=Rh054_00005;Dbxre.+0ID=cds0;Name=YP_00476371.+.ID=gene1;Name=Rh054_00010;Dbxre在進(jìn)行數(shù)據(jù)處理過程中，不同的生物信息分析軟件得到的數(shù)據(jù)格式各不相同。7.1.2不同數(shù)據(jù)格式之間可以用特定的軟件進(jìn)行相互轉(zhuǎn)換。在數(shù)據(jù)采集過程中7.1.3在數(shù)據(jù)采集過程中，應(yīng)對數(shù)據(jù)進(jìn)行嚴(yán)格的科學(xué)性審查。對于涉及人的基8測序數(shù)振 數(shù)據(jù)過濾b測序數(shù)振 數(shù)據(jù)過濾b拼接與組突變和變異:檢測序列重復(fù)性分析突變和變異:檢測序列重復(fù)性分析基因預(yù)測基因注釋基因組注釋可變剪切和融合基因檢:測注2：序列比對，比較測序序列和參考序列的相似性或不相似性，尋找核苷酸的連續(xù)產(chǎn)生模式，找出基因序列中的注6：基因組注釋，利用生物信息學(xué)方法和工具，對基因組所有基因的生物學(xué)功能進(jìn)行注釋，包括序列的重復(fù)性分97.4.1應(yīng)按存儲文件的用戶分組和重要性設(shè)置相應(yīng)的使用權(quán)限。文件的用戶分rwx 7.4.2應(yīng)由數(shù)據(jù)庫管理機(jī)構(gòu)任命系統(tǒng)管隸屬于數(shù)據(jù)庫管理機(jī)構(gòu)，具有存儲系統(tǒng)最高管理權(quán)限，負(fù)責(zé)存儲系7.4.3除管理員賬戶外，一般賬戶通過向一般管理員提供申請表獲得。賬號申7.5.3數(shù)據(jù)備份應(yīng)填寫數(shù)據(jù)備份申請表。數(shù)據(jù)申請表應(yīng)包括備份的內(nèi)容描述、7.5.4數(shù)據(jù)備份過程中，應(yīng)為文件和文件夾創(chuàng)建備份標(biāo)記，備份時(shí)只需選中那7.7.1.2數(shù)據(jù)庫中各種對象的命名和程序代碼的編寫應(yīng)規(guī)范，數(shù)據(jù)庫應(yīng)用系統(tǒng)7.7.1.4根據(jù)計(jì)算機(jī)硬件和網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)確定情況對數(shù)據(jù)庫進(jìn)行邏輯設(shè)計(jì)和物理設(shè)計(jì),根據(jù)應(yīng)用系統(tǒng)的事物大小和服務(wù)器的性能調(diào)整數(shù)據(jù)庫服務(wù)器的系統(tǒng)參數(shù),選擇合適的數(shù)據(jù)類型,盡可能使數(shù)據(jù)庫性能達(dá)到