基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控

轉(zhuǎn)錄調(diào)控實驗課GWAS:genomewideassociationstudy背景：經(jīng)過：發(fā)現(xiàn)：GWAS找到疾病相關(guān)的SNP(單核苷酸多態(tài)性)位點近十年國際國內(nèi)發(fā)展迅猛大部分的SNP位點存在于非編碼區(qū)這些SNP位點的意義？ENCODE:EncyclopediaofDNAElements背景：經(jīng)過：發(fā)現(xiàn)：研究熱點領(lǐng)域：ENCODE計劃外顯子組只占約1.5%90%的疾病相關(guān)SNP位于蛋白編碼區(qū)域之外2003年發(fā)起，2012年初步成果發(fā)表非編碼DNA至少80%是有生物活性，多種DNA元件參與基因表達調(diào)控如何研究這些基因表達調(diào)控？Nature.

2012Sep6;489(7414):57-74。Nature.2012Sep6;489(7414):57-74.Nature.2012Sep6;489(7414):75-82.Nature.2012Sep6;489(7414):83-90.Nature.2012Sep6;489(7414):91-100.Nature.2012Sep6;489(7414):101-8.Nature.2012Sep6;489(7414):109-13.轉(zhuǎn)錄調(diào)控轉(zhuǎn)錄調(diào)控p21TFTF結(jié)合位點報告基因

藥物篩選，遺傳學(xué)分析，基礎(chǔ)研究EMSA:電泳遷移率變動分析

遺傳學(xué)分析，基礎(chǔ)研究ChIP：chromatinimmunoprecipitation染色質(zhì)免疫共沉淀

遺傳學(xué)分析，基礎(chǔ)研究教學(xué)要求轉(zhuǎn)錄調(diào)控：雙熒光素酶報告基因的應(yīng)用（1）教學(xué)內(nèi)容：a.基因表達調(diào)控實驗概述；b.雙熒光素報告基因的原理、實驗測定；c.簡要介紹EMSA、ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實驗；

（2）教學(xué)要求：了解基因組ENCODE計劃和表達調(diào)控的原理，基因表達調(diào)控相關(guān)實驗；對報告基因、EMSA、ChIP等實驗有綜合分析，熟悉不同實驗的優(yōu)缺點。通過報告基因的測定，掌握雙熒光素酶報告基因的原理和實驗步驟，掌握細胞轉(zhuǎn)染、細胞裂解、雙熒光素酶儀器使用等實驗操作過程，熟悉報告基因?qū)嶒灥某Ｒ妴栴}；通過講解，了解EMSA實驗原理和基本實驗步驟，包括放射性實驗和生物素標(biāo)記實驗；通過講解和視頻演示，了解ChIP實驗原理和基本步驟；三種方法的比較報告基因EMSAChIP體外+體內(nèi)體外體內(nèi)（原位狀態(tài)）DNAPCR克?。▎幼?，幾百bp-2kb左右）合成（探針，20-30bp左右）基因組DNA蛋白轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄因子/組蛋白應(yīng)用應(yīng)用廣，實驗相對簡單；遺傳學(xué)分析基因表達調(diào)控背景較深的實驗室開展；遺傳學(xué)分析過程復(fù)雜，但應(yīng)用逐漸增多用途驗證啟動子活性（啟動子，幾百bp-2kb左右）或DNA元件活性驗證蛋白與DNA