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光皮松微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用的開題報(bào)告(以下為光皮松微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用的開題報(bào)告,僅供參考)1.選題背景光皮松(Pinuskoraiensis)是東北地區(qū)的重要經(jīng)濟(jì)樹種之一,其木材、松果、樹脂等均具有重要價(jià)值,是木材加工、食品生產(chǎn)、化工等行業(yè)的重要原料。為了更好地保護(hù)和利用光皮松資源,開展其遺傳多樣性研究,定量評價(jià)光皮松林分的遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性,是十分必要的。微衛(wèi)星標(biāo)記是一種被廣泛應(yīng)用的遺傳多態(tài)性檢測工具,其分辨率高、多態(tài)性強(qiáng)、重復(fù)性好,是進(jìn)行光皮松遺傳多樣性評價(jià)的重要手段之一。2.研究目的本研究的目的是開發(fā)一批基于光皮松基因組的微衛(wèi)星標(biāo)記,并應(yīng)用這些標(biāo)記對光皮松林分的遺傳多樣性進(jìn)行評價(jià),研究其遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性。3.研究內(nèi)容(1)基于光皮松基因組數(shù)據(jù),篩選出合適的微衛(wèi)星標(biāo)記位點(diǎn);(2)設(shè)計(jì)相應(yīng)的引物,開展PCR擴(kuò)增反應(yīng);(3)通過聚丙烯酰胺凝膠電泳,檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,并將多態(tài)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析;(4)應(yīng)用所開發(fā)的微衛(wèi)星標(biāo)記,對光皮松林分的遺傳多樣性進(jìn)行評價(jià)。4.預(yù)期結(jié)果(1)開發(fā)出一批具有較高穩(wěn)定性和多態(tài)性的光皮松微衛(wèi)星標(biāo)記;(2)應(yīng)用這些標(biāo)記,對光皮松林分的遺傳多樣性進(jìn)行評價(jià),研究其遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性;(3)對光皮松遺傳資源的保護(hù)和利用提供科學(xué)依據(jù)。5.研究意義(1)開發(fā)基于光皮松基因組的微衛(wèi)星標(biāo)記,豐富了研究光皮松遺傳多樣性的手段;(2)對光皮松林分的遺傳多樣性進(jìn)行評價(jià),能夠?yàn)槠浔Wo(hù)和利用提供科學(xué)依據(jù);(3)本研究的方法和思路,對其他樹種的遺傳多樣性研究具有借鑒意義。6.研究方法(1)基于光皮松基因組數(shù)據(jù),結(jié)合SSRHunterv1.3.4軟件,篩選出合適的微衛(wèi)星標(biāo)記位點(diǎn);(2)根據(jù)所選位點(diǎn),設(shè)計(jì)引物序列,開展PCR擴(kuò)增反應(yīng);(3)將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)過聚丙烯酰胺凝膠電泳,進(jìn)行多態(tài)性分析。7.研究進(jìn)度安排(1)前期準(zhǔn)備:2021年10月-2021年11月(2)基因組分析、微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選:2021年11月-2022年1月(3)引物設(shè)計(jì)、PCR反應(yīng):2022年2月-2022年4月(4)聚丙烯酰胺凝膠電泳、數(shù)據(jù)分析、結(jié)果統(tǒng)計(jì)2022年5月-2022年8月(5)論文撰寫:2022年9月-2022年11月8.預(yù)計(jì)費(fèi)用本次研究預(yù)計(jì)費(fèi)用為10萬元左右,主要包括實(shí)驗(yàn)耗材和設(shè)備費(fèi)用、數(shù)據(jù)分析軟件購買等。其中,設(shè)備費(fèi)用包括PCR儀、電泳儀等,預(yù)計(jì)約為3萬元;實(shí)驗(yàn)耗材包括引物、試劑盒、瓊脂等,預(yù)計(jì)約為5萬元。數(shù)據(jù)分析軟件購買費(fèi)用預(yù)計(jì)約為2萬元。9.參考文獻(xiàn)(1)ZengQ.,ZhangD.andWangQ.,2019.Genome-widemicrosatellitemarkerdevelopmentandtheirapplicationinanativeredpine(PinuskoraiensisSieb.etZucc.)population.JournalofForestryResearch,30(5):1593-1601.(2)WuM.X.etal.,2020.DevelopmentofmicrosatellitemarkersinPinuskoraiensis(Pinaceae)andcross-speciestransferwithinthegenusPinus.ApplicationsinPlantSciences
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