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文檔簡介
分子生物學(xué)常用檢測技術(shù)DNA—四種核苷酸(A-T-C-G)組成的多聚骨架所有組成DNA的核苷酸dATP,dTTP,dCTP,dGTP都由三種成分組成:1)一個2’-脫氧核糖(戊糖)2)一個含氮堿基嘌呤:A\G嘧啶:T/C3)三個磷酸基團(tuán)各單個核苷酸由5’和3’-碳形成的磷酸二酯鍵連接在一起變性、復(fù)性、退火和淬火基因分子生物學(xué)常用技術(shù)
PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))核酸分子雜交基因芯片技術(shù)(biochip)DNA測序(DNAsequencing)DNA重組技術(shù)(DNArecombination)
一、聚合酶鏈反應(yīng)
(PolymeraseChainReaction,PCR)體外基因擴(kuò)增技術(shù)
特異性強(qiáng)靈敏度高操作簡單、省時對待檢原始材料質(zhì)量要求低高效率的基因擴(kuò)增技術(shù)(一)PCR原理原理雙鏈DNA變性
退火鏈延伸
(膜板)
(雙鏈分成單鏈)
(膜板與引物雜交)
(DNA合成)不斷重復(fù)PCR反應(yīng)體系Mg2+Mn2+dCTPdGTPdTTPdATPTaq
DNA聚合酶模板引物
和或和(二)PCR反應(yīng)的設(shè)計(jì)及影響因素TaqMan探針reverseprimerRQforwardprimer3'3'5'5'3'5'5'1.PolymerisationprobeRQ3'3'5'5'3'5'5'2.StranddisplacementQ3'3'5'5'3'5'5'3.CleavageR3'5'5'3'5'5'4.PolymerisationcompletedQRR=ReporterQ=Quencher3'熒光定量PCR定量PCR的數(shù)學(xué)原理PCR理論方程N(yùn)=N0x(1+E)nN:擴(kuò)增數(shù)量N0:起始模板數(shù)量E:擴(kuò)增效率N:循環(huán)數(shù)
Log[DNA]循環(huán)數(shù)線性增長期Linear平臺期Plateauy=
N0(1+e)n指數(shù)增長期Geometric定量PCR的數(shù)學(xué)原理Rn(熒光強(qiáng)度)循環(huán)數(shù)CycleNumber指數(shù)增長期平臺期CT=-klogN0+bCt
(Cyclethreshold)值:是指每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達(dá)設(shè)定域值(threshold)時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。PCR的臨床應(yīng)用對病原微生物核酸進(jìn)行快速檢測彌補(bǔ)免疫檢測的缺陷縮短診斷的窗口期(如HBV,HIV)用于藥物療效監(jiān)測和評估用于腫瘤基因表達(dá)方面的研究用于遺傳病的診斷樣本采集要求二、核酸分子雜交根據(jù)核酸變性和復(fù)性的原理,不同來源的變性單鏈核酸分子在合適的條件下,通過堿基互補(bǔ)形成雙鏈雜交體的過程稱為核酸分子雜交(molecularhybridization)。1、遺傳病的診斷2、病原體的鑒定3、癌基因突變的檢測4、組織配型5、親子鑒定核酸分子雜交的臨床應(yīng)用三、基因芯片技術(shù)基質(zhì)材料分,有尼龍膜、玻璃片、塑料、硅膠晶片、微型磁珠等。
用點(diǎn)樣法固定在玻璃板上的DNA探針陣列原位合成法在玻璃等硬質(zhì)表面上直接合成的寡核苷酸探針陣列基因芯片技術(shù)的應(yīng)用1、藥物篩選和新藥開發(fā)2、疾病診斷3、環(huán)境保護(hù)4、司法5、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)四、測序技術(shù)CTTGATCTTCAGGTAGGCCTGAATCCT(一)一代測序技術(shù)(二)二代測序技術(shù)Illumina公司的Solexa和Hiseq應(yīng)該說是目前全球使用量最大的第二代測序機(jī)器,這兩個系列的技術(shù)核心原理是相同的。Illumina/SolexaGenomeAnalyzer測序的基本原理是邊合成邊測序。在Sanger等測序方法的基礎(chǔ)上,通過技術(shù)創(chuàng)新,用不同顏色的熒光標(biāo)記四種不同的dNTP,當(dāng)DNA聚合酶合成互補(bǔ)鏈時,每添加一種dNTP就會釋放出不同的熒光,根據(jù)捕捉的熒光信號并經(jīng)過特定的計(jì)算機(jī)軟件處理,從而獲得待測DNA的序列信息。技術(shù)特點(diǎn)比較第一代測序技術(shù)的主要特點(diǎn)是測序讀長可達(dá)1000bp,準(zhǔn)確性高達(dá)99.999%,但其測序成本高,通量低等方面的缺點(diǎn),嚴(yán)重影響了其真正大規(guī)模的應(yīng)用。第二代測序技術(shù)大大降低了測序成本的同時,還大幅提高了測序速度,并且保持了高準(zhǔn)確性,但在序列讀長方面比起第一代測序技術(shù)則要短很多。五、基因重組技術(shù)基因重組是指一個基因的DNA序列是由兩個或兩個以上的親本DNA組合起來的。基因重組是遺傳的基本現(xiàn)象,病毒、原核生物和真核生物都存在基因重組現(xiàn)象。轉(zhuǎn)基因植物
(抗蟲、抗凍、抗病、高產(chǎn))轉(zhuǎn)基因動物基因工程藥物和疫苗基因治療基因重組技術(shù)的應(yīng)用小結(jié)疾病的診斷感染性疾病診斷腫瘤
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