病原體分子分型實驗室監(jiān)測數據網絡傳輸和分析系統(tǒng)

1、病原體分子分型實驗室監(jiān)測數據網絡傳輸和分析系統(tǒng)一、系統(tǒng)簡介“病原體分子分型實驗室監(jiān)測數據網絡傳輸和分析系統(tǒng)”是基于國家十二 五重大科技專項開發(fā)的專業(yè)軟件系統(tǒng)。PFGE脈沖場凝膠電泳圖譜分析（官微），留 言進行相關事宜咨詢。系統(tǒng)主要功能是PFGE圖譜分子分型在線識別和處理，提供二叉層級聚樹， MLVA、MLST字符類型的最小生成樹，SEQUENCE基因片段類型的親緣樹計算和圖 形繪制，用于分析菌株之間的相關性，協(xié)助追蹤感染來源以及有效控制疫情。系統(tǒng)結合了計算機技術、分子生物學、統(tǒng)計學、圖像識別技術、地理信息技 術，能夠對微生物的分子分型數據進行專業(yè)處理和分析，準確識別出相似性。系統(tǒng)于2015年6

2、月通過由國家疾控中心、解放軍疾病預防控制所、軍事醫(yī) 學科學院、清華大學以及國內著名醫(yī)院等單位組成的專家組驗收。專家組認為本 系統(tǒng)在疾控行業(yè)、食品衛(wèi)生行業(yè)、醫(yī)院以及科研部門均有較強的易用性和穩(wěn)定性， 業(yè)務邏輯清晰，功能齊全，且具自主知識產權，安全可控；系統(tǒng)申報2項發(fā)明專 利，并已獲得12個軟件著作權。二、系統(tǒng)解決的主要問題1、疾控行業(yè)：送檢樣本細菌的相似性判定和帶型編碼、疾病暴發(fā)的溯源分 析、疾病分布特征分析和預警分析。在發(fā)生感染和疫情時，可以幫助業(yè)務 人員盡早定位感染來源，提高疫情調查、追蹤和控制的效率。2、醫(yī)療機構：院內感染問題、醫(yī)學研究。3、食品檢疫：對食品中常見致病微生物進行分子分型分析

3、、食源性疾病微 生物的溯源。4、農業(yè)和林業(yè)：家畜和動物攜帶治病菌的溯源、引發(fā)動物流行性感冒的研 究和監(jiān)控、動物、環(huán)境和飼養(yǎng)員耐藥菌的研究。三、系統(tǒng)特點1、優(yōu)秀的成本控制：采用B/S模式，一次性部署即可搭建成功，在采購成本、升級成本、維護成本上，具有壓倒性優(yōu)勢。2、高效的計算能力：擁有計算功能強大的分析計算服務，可以一次性聚類 1000株菌，并在15秒內完成。3、強大的客戶端繪圖能力：客戶端提供直觀的圖形展示和良好的交互體驗， 操作簡便，分析結果一目了然。4、良好的易用性：全中文操作界面，簡單易用，確保用戶可以快速上手。5、可靠的用戶信息安全保障：自主知識產權軟件，為用戶的信息安全提供 可靠的保

4、障。6、實驗數據的積累：系統(tǒng)在使用過程中會積累下多樣化的實驗數據，數據 積累的數量越多、年份跨度越廣，則分析結果的準確性越高。四、系統(tǒng)使用效果對比1、使用前（1）細菌的識別定性采用傳統(tǒng)的物理和化學檢測，識別準確度相對差。（2）細菌的識別分型結果，不能在相關機構中統(tǒng)一認可。（3）疾病暴發(fā)、食品中毒、院內感染發(fā)生時，不能及時應對情況，造成診 斷延遲，失去了最佳的處置時機。（4）沒有相關的分子分型數據留存，不利于醫(yī)療研究和診斷經驗數據積累。2、使用后（1）細菌的識別定性與國際接軌，識別準確度高。（2）識別結果可以在不同機構之間比較，識別結果權威性高。（3）當疾病暴發(fā)、食品中毒、院內感染發(fā)生時，機構可以直接采集樣本， 分析識別定性。（4）能夠積累大量的細菌分子分型數據，提高機構在重大疫情中的溯源成 功率，提高機構的知名度。五、