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文檔簡(jiǎn)介
1、成都艾力生物技術(shù)研究所創(chuàng)立于1999年,由5名留學(xué)歸國(guó)博士牽頭組建,是目前國(guó)內(nèi)專(zhuān)業(yè)化的動(dòng)保產(chǎn)品科研機(jī)構(gòu)。研究所主要致力于獸用生物疫苗(豬苗、犬苗)、新型飼料原料、動(dòng)物藥品的開(kāi)發(fā)工作,同時(shí),也為規(guī)?;B(yǎng)殖企業(yè)提供疾病防治成套解決方案。目前,研究所已為國(guó)內(nèi)200多家獸藥、飼料生產(chǎn)企業(yè),規(guī)模化養(yǎng)雞場(chǎng)、養(yǎng)豬場(chǎng)提供了多項(xiàng)技術(shù)成果和技術(shù)方案。- 中國(guó)生命科學(xué)論壇 (- 文獻(xiàn)與檢索技巧 (- PubMed完全攻略 (- 作者:tianlanlan-
2、0; 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:30:00- PubMed完全攻略第一章 進(jìn)入PubMed魔法學(xué)校-PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感嘆:"你們現(xiàn)在真是幸福,我們那時(shí)候要查一篇相關(guān)的文獻(xiàn),要到圖書(shū)館一本一本目錄去檢索。尤其是做一些別人不太做的課題時(shí),要搜集幾篇有用的文獻(xiàn),竟要花上3,4個(gè)月時(shí)間,而你們現(xiàn)在。"趁他打頓的時(shí)候,我告訴他,"快的話(huà),可能只要3秒鐘"。從他兩個(gè)厚厚的酒瓶底后面露出一絲羨慕的眼神。我可以想見(jiàn)他當(dāng)時(shí)在一大堆期刊中埋頭查閱的情形
3、,但對(duì)于現(xiàn)在的醫(yī)學(xué)工作者來(lái)說(shuō),我已經(jīng)無(wú)法想像,如果我們失去PubMed,世界將會(huì)怎樣。盡管在因特網(wǎng)上,類(lèi)似于PubMed的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。還有非常重要的一點(diǎn),正如它的名字(PubMedPublic+Medicine)所暗示的, PubMed是免費(fèi)向公眾開(kāi)放的。無(wú)論何時(shí)何地,你只要在瀏覽器地址欄中輸入:/pubmed/ 就可以立刻進(jìn)入PubMed的界面并開(kāi)始享受PubMed所給你帶來(lái)的無(wú)窮便利。
4、160; 俗話(huà)說(shuō),喝水不忘掘井人。PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館(NLM)所屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開(kāi)發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng),位于美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)的平臺(tái)上。有不少西方人有在飯前祈禱感恩的習(xí)慣,不知道我們是否也有必要每次使用PubMed前都感謝NCBI呢? PubMed覆蓋了全世界70多個(gè)國(guó)家4300多種主要生物醫(yī)學(xué)期刊的摘要和部分全文。其覆蓋的時(shí)間段也非常長(zhǎng),早的可以追溯到20世紀(jì)60年代,通常而言,這已經(jīng)足夠早了,很少有人會(huì)需要查閱在此之前的文獻(xiàn)。當(dāng)然,研究生物醫(yī)學(xué)史的工作者可能是個(gè)例外。而最新的文獻(xiàn)幾乎就在此時(shí)
5、此刻。與PubMed掛鉤的出版商會(huì)自動(dòng)向PubMed提供最新的文獻(xiàn)摘要,而往往在這個(gè)時(shí)候文獻(xiàn)還沒(méi)有正式出版。所以盡管生物醫(yī)學(xué)的文章從被期刊接受到出版往往要好幾個(gè)月的時(shí)間,但借助于PubMed,我們?nèi)耘f可以隨時(shí)掌握最新的動(dòng)向,從而大大有利于自己的臨床和研究工作。還有些出版商通過(guò)PubMed提供文獻(xiàn)的全文,有時(shí)甚至是免費(fèi)的,這樣,我們就可以在PubMed上真正享受"坐擁書(shū)城"的感覺(jué)了(關(guān)于如何獲取全文將在以后的章節(jié)中詳述)。 進(jìn)入PubMed的主界面后, 首先映入我們眼簾的就是頁(yè)面上方的檢索框和功能鍵(如下圖)。這是PubMed的核
6、心部分。大部分工作,我們只要利用這"一框五鍵"(檢索框,Limit鍵, Preview/Index鍵, History鍵,Clipboard鍵和Details鍵)即可完成。 在主界面的左側(cè)框(如左圖),有:· Journal Browser 期刊瀏覽· MeSh Browser可以用它來(lái)分層流覽MeSH表· Single Citation Matcher輸入期刊的信息可以找到某單篇的文獻(xiàn)或整個(gè)期刊的內(nèi)容。· Batch Citution Matcher用一種特定的形式輸入期刊的信息一次搜索多篇文獻(xiàn)。· Clinical Qu
7、eries這一部分為臨床醫(yī)生設(shè)置,通過(guò)過(guò)濾的方式將搜索的文獻(xiàn)固定在4個(gè)范圍:治療、診斷、病原學(xué)與預(yù)后。· Old PubMed (使用舊式的PubMed查詢(xún)方式)3) Related Resources· Order Documents可以使用戶(hù)在當(dāng)?shù)氐玫轿墨I(xiàn)的全文, 但這是要收費(fèi)的,至于如何免費(fèi)獲得文獻(xiàn)全文,我將在后面的有關(guān)章節(jié)中詳述。· Grateful Med是對(duì)另一個(gè)NLM基于網(wǎng)絡(luò)的查詢(xún)系統(tǒng)的鏈接。Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且還有一些其他的數(shù)據(jù)庫(kù)如AIDSLINE、HISTLINE等等。· Consumer Healt
8、h提供與MEDLINEplus的鏈接,MEDLINEplus是與消費(fèi)者健康信息相關(guān)的國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)。· Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH資助的臨床研究成果的發(fā)利用左側(cè)框的這些服務(wù),我們不僅能夠進(jìn)行功能更加強(qiáng)大的檢索,而且還能得到不少非常有用的服務(wù)。這些都將在后續(xù)章節(jié)中介紹。 總體而言,PubMed的界面相當(dāng)簡(jiǎn)潔清晰,幾乎是傻瓜式的。 然而傻瓜式的界面并不意味著傻瓜式的操作。我看到很多人用了幾年的PubMed,還是只知道在檢索框里輸入一個(gè)關(guān)鍵字,然后按一下"Go"按鈕這樣一種單一原始的檢
9、索方式。雖然有一半左右的情況,這樣的操作就足以得到令人滿(mǎn)意的信息,但對(duì)于另一半情況,就沒(méi)有那么幸運(yùn)了,要么你真正所需的信息湮沒(méi)在大量紛繁蕪雜的"無(wú)用"信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人費(fèi)解的是,很多醫(yī)務(wù)工作者寧可在每次檢索時(shí)都花上成倍的時(shí)間,卻不愿花上幾個(gè)小時(shí)的時(shí)間去認(rèn)真研究一下PubMed。"君欲善其事,必先利其器", PubMed就好像一把功能強(qiáng)大的槍?zhuān)銢Q不能僅僅滿(mǎn)足于知道扣動(dòng)扳機(jī)就可以發(fā)射子彈,更重要的是,你要知道如何利用準(zhǔn)星瞄準(zhǔn),如何把這把槍的功能發(fā)揮到及至。 在以后的章節(jié)中,
10、我們將逐步深入地了解PubMed,相信通過(guò)這些章節(jié)的學(xué)習(xí),我們可以真正熟練掌握PubMed,從而使自己的工作事半功倍。 - 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:31:00- 第二章 PUBMED簡(jiǎn)單檢索技巧 一在這一章里,我們將對(duì)如何應(yīng)用PUBMED這一得力助手檢索文獻(xiàn),作以簡(jiǎn)單介紹。 1當(dāng)你打開(kāi)瀏覽器,在地址欄內(nèi)鍵入/PubMed/ 或是http:/www.PubM/后,就進(jìn)入了PUBMED檢索系統(tǒng)主頁(yè),可以見(jiàn)
11、到如下的頁(yè)面。2在靠近頁(yè)面上部的地方,首先映入我們眼簾的,即是供我們輸入所需查詢(xún)內(nèi)容的檢索框。 在檢索框中輸入查詢(xún)?cè)~,然后單擊"go"按鈕或按回車(chē)鍵,PubMed將會(huì)自動(dòng)開(kāi)始檢索,并將檢索到的相關(guān)條目顯示在屏幕上。在檢索框前面,你還可以選定所要檢索內(nèi)容的數(shù)據(jù)庫(kù)范圍,除NCBI的數(shù)據(jù)庫(kù)以外,可供選擇的還有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。 說(shuō)到這里,很多人可能以為只需傻瓜式的輸入幾個(gè)字符然后回車(chē)一敲便可萬(wàn)事大吉,其實(shí)不然。每個(gè)人搜索效率的高低往往存在很大差別。在這里提供以下建議僅
12、供讀者參考: 明確你索要檢索的關(guān)鍵概念及詞語(yǔ),即關(guān)鍵字; 考慮到關(guān)鍵字的類(lèi)似說(shuō)法,即有可能出現(xiàn)的同義詞; 通過(guò)限定DATES, STUDY GROUP等,精煉你的檢索范圍; 多向有經(jīng)驗(yàn)的人求教,因?yàn)椴煌膶?zhuān)業(yè)背景以及個(gè)人的差異,都有可能形成不同的方法和技巧。 3通過(guò)布爾(BOOLEAN)運(yùn)算來(lái)提高你的效率 最常用的
13、三種布爾運(yùn)算即是AND,OR,和NOT。 AND提供的運(yùn)算方式即不管所輸入的兩個(gè)關(guān)鍵詞語(yǔ)所出現(xiàn)的位置在哪,只要他們都出現(xiàn)在索引文章的某一處,就將其列出。 而OR則是將出現(xiàn)至少一個(gè)關(guān)鍵詞的文章列出,這種運(yùn)算在想將相似主題的文章羅列在一起時(shí),十分有效。 NOT運(yùn)算可以在你的檢索范圍內(nèi)將某些不需要的部分除去。但是在使用的時(shí)候要特別注意,會(huì)有可能將一些你所需要的文章漏掉。比如當(dāng)你的檢索詞為L(zhǎng)EAD POISONING NOT CHILDREN時(shí),除了會(huì)刪除掉那
14、些僅討論兒童的文章,同時(shí)也會(huì)刪去那些同時(shí)討論兒童及其他年齡組的文章。 4PUBMED檢索類(lèi)型 通常我們所要查詢(xún)的單詞類(lèi)型大致可以分為: 詞語(yǔ)(主題)檢索 這時(shí)我們?cè)赑ubMed主頁(yè)的檢索框中鍵入的是英文單詞或短語(yǔ)(大寫(xiě)或小寫(xiě)均可)。然后回車(chē)或點(diǎn)擊"Go", PubMed即使用其詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行檢索,并將檢索結(jié)果直接顯示在主頁(yè)下方。例如:鍵入"vitamin c common cold"后回車(chē)或點(diǎn)擊"Go
15、", PubMed開(kāi)始檢索并將檢索結(jié)果顯示出來(lái)。 著者檢索 當(dāng)我們所要查詢(xún)的是著作者時(shí), 在檢索框中鍵入著者姓氏全稱(chēng)和名字的首字母縮寫(xiě),格式為:"著者姓 空格 名字首字母縮寫(xiě)",例如smith ja,然后回車(chē)或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)到著者字段去檢索,并顯示檢索結(jié)果。 刊名檢索 在檢索框中鍵入刊名全稱(chēng)或MEDLINE形式的簡(jiǎn)稱(chēng)、ISSN號(hào),例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524,然后回車(chē)或點(diǎn)擊
16、Go,系統(tǒng)將在刊名字段檢索,并顯示檢索結(jié)果。 日期或日期范圍檢索 可以在檢索框中鍵入日期或日期范圍,然后回車(chē)或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)會(huì)按日期段檢索,并將符合條件的記錄予以顯示。日期的錄入格式為YYYY/MM/DD;如:1999/09/08 也可以不錄月份和日子,如:2000或1999/12。 檢索期刊子集(輯) 檢索的格式為:檢索詞AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。可供檢索的期刊子庫(kù)有3種:Abridged Index Medicus(有120種重要核心期刊)、Den
17、tal和Nursing。分別使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn進(jìn)行限定。 檢索帶文摘的記錄 檢索的格式為:檢索詞AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE記錄中沒(méi)有文摘。 布爾邏輯檢索 PubMed系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索,只要在檢索框中鍵入布爾邏輯運(yùn)算符(AND,OR或NOT)。具體使用時(shí)要注意的問(wèn)題,詳見(jiàn)上第3點(diǎn)所述。
18、0;5如何處理檢索結(jié)果 當(dāng)你點(diǎn)擊GO或回車(chē)后,PubMed將會(huì)自動(dòng)運(yùn)行檢索命令,在屏幕的下方顯示出符合檢索要求的項(xiàng)目,并且在查詢(xún)框內(nèi)保留原檢索詞。此時(shí)要注意的是符合檢索要求的項(xiàng)目是以SUMMARY(簡(jiǎn)要格式)顯示出來(lái)的,就是列出作者,文章題目,以及文章來(lái)源的一些信息。 在DISPLAY鍵后還可以選擇別的顯示格式,點(diǎn)擊DISPLAY鍵后,系統(tǒng)按所選格式全部檢索結(jié)果。 如果只需要顯示其中一部分記錄,則需點(diǎn)擊該記錄左邊的查詢(xún)框,使標(biāo)記后,再點(diǎn)擊Display鍵;如
19、果只需顯示一條記錄,則可直接點(diǎn)擊該記錄中的作者姓名超鏈接,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)顯示該記錄的文摘格式。 還有一點(diǎn),系統(tǒng)所設(shè)定的默認(rèn)值為每頁(yè)顯示20條選項(xiàng),這點(diǎn)可以在SHOW后的下拉菜單處選擇。 如果選中所感興趣的內(nèi)容,即可進(jìn)行保存,打印等等操作。PubMed系統(tǒng)允許最多可保存5000條記錄。要保存全部檢索結(jié)果時(shí),打開(kāi)Summary下拉菜單選擇其中一種格式,然后點(diǎn)擊Save鍵;要保存特定記錄時(shí),點(diǎn)擊記錄左邊的選擇框予以標(biāo)記后,再點(diǎn)擊Save鍵。 使用瀏覽器的打印功能,即可
20、把感興趣的內(nèi)容打印出來(lái)。系統(tǒng)允許每頁(yè)最多顯示500條記錄。如果想打印成文本格式,請(qǐng)先點(diǎn)擊Text鍵,然后再打印。 下一章我們將用幾個(gè)實(shí)例來(lái)使大家熟悉以上檢索技巧。- 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:35:00- 第三章 PUBMED簡(jiǎn)單檢索實(shí)例 在上一章里,我們已經(jīng)對(duì)如何用PUBMED來(lái)查詢(xún)我們感興趣問(wèn)題的文獻(xiàn)。在這一章,我們可以通過(guò)幾個(gè)簡(jiǎn)單的實(shí)例來(lái)具體熟悉PUBMED的用法。 例一
21、160;1明確所要檢索的內(nèi)容。如果我們要查詢(xún)的問(wèn)題是"維生素C對(duì)于普通感冒的防治作用"。首先我們應(yīng)分析這一問(wèn)題中的關(guān)鍵詞語(yǔ),主要由"維生素C",和"普通感冒"構(gòu)成。即"VITAMIN C"和"COMMON COLD"。 2分析所要檢索的兩個(gè)相關(guān)詞語(yǔ)的關(guān)系。根據(jù)我們的日常生活經(jīng)驗(yàn),可以將兩個(gè)關(guān)鍵詞之間的關(guān)系定義為"AND",于是我們可以在檢索框內(nèi)鍵入"VITAMIN C AND COMMON COLD".,然后點(diǎn)
22、擊"GO",進(jìn)行檢索。下面的畫(huà)面即為經(jīng)過(guò)上面檢索過(guò)程后所得到的相關(guān)文章。 3以上初步檢索后所顯示的結(jié)果都以默認(rèn)的SUMMER格式顯示出來(lái),在經(jīng)過(guò)對(duì)SUMMER的閱讀后,我們可以進(jìn)一步篩選文獻(xiàn)的內(nèi)容。如我們感興趣的是第二、三、五篇的話(huà),選中這幾篇文獻(xiàn)左側(cè)的方框。如果我們想要同時(shí)看到這幾篇的ABSTRACT,在DISPLAY鍵后的下拉菜單選擇ABSTRACT,然后點(diǎn)擊DISPLAY。即可看到所要結(jié)果。例二 1 如果這一次我們想要查找的是與一個(gè)作者相關(guān)的文章,如這位作者的名字是Hemila h,則我們所要檢索的內(nèi)容就很明確了,是這位作者的名字H
23、emila h。2 在檢索框內(nèi)輸入Hemila h,點(diǎn)擊GO鍵,屏幕上即會(huì)顯示出與這位作者相關(guān)的文獻(xiàn)。 3 在所列出的 39項(xiàng)文獻(xiàn)內(nèi),我們?nèi)绻朐谝黄羶?nèi)看到所有的選項(xiàng),可以在SHOW后面的下拉菜單內(nèi)選擇想要顯示的數(shù)量,如50篇。 4 在PUBMED所檢索到的文獻(xiàn)里,我們對(duì)第 1篇很感興趣,點(diǎn)擊該篇文章左側(cè)的方框,然后拉下Display鍵后的多選框,選擇文獻(xiàn)的顯示類(lèi)型,(如Abstract-摘要,Brief-提綱 ,Citation-引言等),一般情況下,以選擇Abstract居多,這樣一目了然。在確定好顯示內(nèi)容后,點(diǎn)擊Display鈕,即可閱讀
24、相關(guān)內(nèi)容了第三章 PUBMED簡(jiǎn)單檢索實(shí)例 在上一章里,我們已經(jīng)對(duì)如何用PUBMED來(lái)查詢(xún)我們感興趣問(wèn)題的文獻(xiàn)。在這一章,我們可以通過(guò)幾個(gè)簡(jiǎn)單的實(shí)例來(lái)具體熟悉PUBMED的用法。 例一 1明確所要檢索的內(nèi)容。如果我們要查詢(xún)的問(wèn)題是"維生素C對(duì)于普通感冒的防治作用"。首先我們應(yīng)分析這一問(wèn)題中的關(guān)鍵詞語(yǔ),主要由"維生素C",和"普通感冒"構(gòu)成。即"VITAMIN C"和"COMMON COLD"。
25、60; 2分析所要檢索的兩個(gè)相關(guān)詞語(yǔ)的關(guān)系。根據(jù)我們的日常生活經(jīng)驗(yàn),可以將兩個(gè)關(guān)鍵詞之間的關(guān)系定義為"AND",于是我們可以在檢索框內(nèi)鍵入"VITAMIN C AND COMMON COLD".,然后點(diǎn)擊"GO",進(jìn)行檢索。下面的畫(huà)面即為經(jīng)過(guò)上面檢索過(guò)程后所得到的相關(guān)文章。 3以上初步檢索后所顯示的結(jié)果都以默認(rèn)的SUMMER格式顯示出來(lái),在經(jīng)過(guò)對(duì)SUMMER的閱讀后,我們可以進(jìn)一步篩選文獻(xiàn)的內(nèi)容。如我們感興趣的是第二、三、五篇的話(huà),選中這幾篇文獻(xiàn)左側(cè)的方框。如果我們想要同時(shí)看
26、到這幾篇的ABSTRACT,在DISPLAY鍵后的下拉菜單選擇ABSTRACT,然后點(diǎn)擊DISPLAY。即可看到所要結(jié)果。例二 1 如果這一次我們想要查找的是與一個(gè)作者相關(guān)的文章,如這位作者的名字是Hemila h,則我們所要檢索的內(nèi)容就很明確了,是這位作者的名字Hemila h。2 在檢索框內(nèi)輸入Hemila h,點(diǎn)擊GO鍵,屏幕上即會(huì)顯示出與這位作者相關(guān)的文獻(xiàn)。 3 在所列出的 39項(xiàng)文獻(xiàn)內(nèi),我們?nèi)绻朐谝黄羶?nèi)看到所有的選項(xiàng),可以在SHOW后面的下拉菜單內(nèi)選擇想要顯示的數(shù)量,如50篇。 4 在PUBMED所檢索到的文
27、獻(xiàn)里,我們對(duì)第 1篇很感興趣,點(diǎn)擊該篇文章左側(cè)的方框,然后拉下Display鍵后的多選框,選擇文獻(xiàn)的顯示類(lèi)型,(如Abstract-摘要,Brief-提綱 ,Citation-引言等),一般情況下,以選擇Abstract居多,這樣一目了然。在確定好顯示內(nèi)容后,點(diǎn)擊Display鈕,即可閱讀相關(guān)內(nèi)容了。 5 在確定對(duì)檢索到的內(nèi)容感興趣后,如果想把它保存下來(lái),可以單擊Save按鍵,如果想保存在剪貼板里,即可單擊Clipboard,保存于剪貼板。點(diǎn)擊"文件"菜單內(nèi)的打印即可將該文打印出來(lái)。 上述是運(yùn)用Pubmed進(jìn)行簡(jiǎn)單檢索的兩個(gè)實(shí)例。如果經(jīng)過(guò)上述的檢索
28、過(guò)程,仍然不能滿(mǎn)足你的需要,我們可以進(jìn)行較為復(fù)雜的高級(jí)檢索。在以后的幾章中,我們會(huì)詳細(xì)介紹。 - 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:35:00- 第四章 PUBMED高級(jí)檢索技巧 在以上兩章我們已經(jīng)掌握了如何運(yùn)用初級(jí)檢索法達(dá)到檢索文獻(xiàn)的目的。不過(guò)在我們所要檢索的問(wèn)題相對(duì)較為復(fù)雜的時(shí)候,僅僅靠初級(jí)檢索就遠(yuǎn)遠(yuǎn)達(dá)不到需求了。為了使得我們的檢索更為準(zhǔn)確,高效,我們可以充分利用PubMed所提供的高級(jí)檢索功能。在你進(jìn)入PubMed首頁(yè)之后,在檢索框的下方,有PubMed所提供的五個(gè)重
29、要的功能按鈕,即Limits按鈕, Preview/Index按鈕, History按鈕, Clipboard按鈕,及Details按鈕。如果你能夠充分的利用好這幾個(gè)功能按鈕,那你的檢索則很有可能事半功倍。 首先,讓我們來(lái)簡(jiǎn)單的了解一下這幾個(gè)按鈕的主要功能。 1. Limits 按鈕當(dāng)你單擊Limits按鈕后,你可以看到如下界面。(fig1)第四章 PUBMED高級(jí)檢索技巧 在以上兩章我們已經(jīng)掌握了如何運(yùn)用初級(jí)檢索法達(dá)到檢索文獻(xiàn)的目的。不過(guò)在我們所要檢索的問(wèn)題相對(duì)較為復(fù)雜的時(shí)候,僅僅靠初級(jí)檢索就遠(yuǎn)遠(yuǎn)達(dá)不到需求了。為了使得
30、我們的檢索更為準(zhǔn)確,高效,我們可以充分利用PubMed所提供的高級(jí)檢索功能。在你進(jìn)入PubMed首頁(yè)之后,在檢索框的下方,有PubMed所提供的五個(gè)重要的功能按鈕,即Limits按鈕, Preview/Index按鈕, History按鈕, Clipboard按鈕,及Details按鈕。如果你能夠充分的利用好這幾個(gè)功能按鈕,那你的檢索則很有可能事半功倍。 首先,讓我們來(lái)簡(jiǎn)單的了解一下這幾個(gè)按鈕的主要功能。 1. Limits 按鈕當(dāng)你單擊Limits按鈕后,你可以看到如下界面。(fig1)在這里可以進(jìn)行以下設(shè)定:
31、0; 將搜索范圍設(shè)定在一個(gè)特定的域。 將搜索范圍設(shè)定在特定的年齡組、性別組、人類(lèi)或動(dòng)物學(xué)范圍。 也可以將搜索限定在某一語(yǔ)種出版的或某一特定的文章類(lèi)型(如綜述)。 設(shè)定只搜索包含摘要的文獻(xiàn)。 設(shè)定搜索Entrez數(shù)據(jù)庫(kù)或Publication數(shù)據(jù)庫(kù)。 設(shè)定搜索范圍為PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的某一子數(shù)據(jù)庫(kù)(如Abridged Index Medicus 或
32、AIDS相關(guān)的條目)。 例如 在All Fields域選擇下拉菜單里,你可以把搜索詞限定在一個(gè)特定的域,缺省設(shè)置是所有的域;打開(kāi)下拉菜單就可以選擇所需的域名了。又如"Only items with abstracts"指只檢索那些有文摘的記錄(1975年前出版的文章的記錄中沒(méi)有文摘) 2Preview/Index 按鈕 在按下Preview/Index按鈕之后,我們可以進(jìn)行的設(shè)定有: 在顯示
33、條目之前顯示所查到的文獻(xiàn)數(shù)。 隨時(shí)通過(guò)增加查詢(xún)單詞來(lái)修改查詢(xún)方案。 在特定的搜索域中向方案里加入查詢(xún)?cè)~。 從Index中查看并選擇詞語(yǔ)來(lái)修改查詢(xún)方案。 在你修改查詢(xún)時(shí)查看方案。 Preview(預(yù)覽) 使用此功能可以在顯示條目之前顯示所查到的文獻(xiàn)數(shù)。使用時(shí),在輸入框中鍵入搜索詞,然后單擊Preview,PubMed返回的信息是條目的數(shù)量。
34、; Index(索引) 使用此功能,可以從特定域中選擇以索引的單詞,并把他們加入查詢(xún)方案之中;可以查看某一個(gè)特定搜索域中詞語(yǔ)列表;也可以使用布爾運(yùn)算符來(lái)建立一個(gè)查詢(xún)方案。 3History 按鈕 History (歷史記錄)歷史記錄中保存的是你所有的查詢(xún)方案與查詢(xún)結(jié)果,只有當(dāng)你運(yùn)行了一次查詢(xún)之后,History中才有內(nèi)容。History屏幕將會(huì)顯示:你的查詢(xún)方案、查詢(xún)時(shí)間、查詢(xún)到的文獻(xiàn)數(shù)量。Preview顯示的是歷史記錄中最近的三條記錄,而使用History可以看到最近100次的查
35、詢(xún)結(jié)果。一旦查詢(xún)數(shù)量超過(guò)100,PubMed會(huì)將最早的查詢(xún)除去,加進(jìn)最新的一次查詢(xún)。如果兩次查詢(xún)內(nèi)容相同,PubMed會(huì)將頭一次的去除。 4Clipboard 按鈕 剪貼板可以幫助你保存或查看在一個(gè)或多個(gè)查詢(xún)中選擇的條目,然后就可以打印、保存、訂購(gòu)剪切板中的內(nèi)容了。將條目左邊的復(fù)選框選中,單擊"Add to clipboard"就可以將其加入剪切板中。當(dāng)點(diǎn)擊 Clear History可以將History中的所有內(nèi)容清除。 剪切板中最大的
36、儲(chǔ)存數(shù)是500條。而放在剪切板中的內(nèi)容如果在一小時(shí)內(nèi)沒(méi)有任何操作,將會(huì)自動(dòng)消失。 5Details 按鈕 Details是用于幫助你查看PubMed的檢索策略。即在提問(wèn)框中鍵入的檢索詞被PubMed自動(dòng)地轉(zhuǎn)換成了那些詞,并使用了什么樣的檢索規(guī)則和檢索語(yǔ)法。此外,使用Details鍵可以對(duì)檢索策略進(jìn)行編輯,然后再一次檢索。在PubMed Query框內(nèi)顯示的是PubMed實(shí)際使用的檢索策略和語(yǔ)法。該框下有四個(gè)區(qū)域:Result區(qū)顯示檢索結(jié)果的記錄總數(shù),點(diǎn)擊這個(gè)數(shù)字,可回到檢索結(jié)果顯示
37、屏;Translation區(qū)顯示檢索詞轉(zhuǎn)換的詳細(xì)情況;Database區(qū)顯示檢索的數(shù)據(jù)庫(kù);User Query 區(qū)顯示用戶(hù)鍵入的檢索詞或檢索式。 要對(duì)檢索策略進(jìn)行編輯可直接點(diǎn)擊PubMed Query框中的檢索策略,將其增加、刪除或修改后點(diǎn)擊Search鍵。 除了以上五個(gè)主要功能鍵以外,利用PubMed提供的其他一些功能,如MeSH 等,也可以在很大一部分程度上提高我們的檢索效率。在以后的若干章里,我們將會(huì)以詳盡的筆墨來(lái)系統(tǒng)的剖析這些功能用法。 通過(guò)對(duì)Pub
38、Med的進(jìn)一步認(rèn)識(shí),我們可以在初級(jí)檢索的基 - 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:36:00- 第五章 PUBMED高級(jí)檢索技巧實(shí)例 在我們對(duì)如何運(yùn)用PubMed進(jìn)行較為復(fù)雜的檢索有了初步的了解后,我們來(lái)看幾個(gè)應(yīng)用性的實(shí)例。 例一 現(xiàn)在讓我們來(lái)查找一下有關(guān)于"鋅對(duì)于兒童成長(zhǎng)的作用"的文獻(xiàn)。 步驟一,我們先來(lái)對(duì)這一話(huà)題進(jìn)行初步的檢索。我們確定了它的關(guān)鍵字應(yīng)為&
39、quot;Zinc Infant Growth",把它輸入查詢(xún)框,按GO鍵進(jìn)行檢索。共有492篇相關(guān)文獻(xiàn)。顯然如果我們對(duì)這些文獻(xiàn)一一打開(kāi)逐項(xiàng)閱讀,將是一項(xiàng)非常繁復(fù)的工作。這時(shí)我們就需要用高級(jí)檢索的方法來(lái)減少工作量。 步驟二,如果我們所要檢索的文獻(xiàn)要求是反映比較新的動(dòng)態(tài)進(jìn)展,那么我們可以點(diǎn)擊功能鍵Limits按鈕.在其中的Publication Date的輸入框內(nèi)輸入FROM"2000 01 01" TO"2002 01 01".("Entrez Date"指錄入系統(tǒng)的日期;&q
40、uot;Publication Date"指出版日期)步驟三,如果我們進(jìn)一步要求文章是用英文發(fā)表,且PubMed可以顯示出Abstract的,我們可以依照上面的方法類(lèi)推,在Languages下拉菜單內(nèi)選擇English,選中"Only items with abstracts"前的方框。然后點(diǎn)擊GO鍵,開(kāi)始檢索。共有61篇,在當(dāng)前頁(yè)內(nèi)顯示出最新的20篇。(fig1) 其實(shí),如果我們一開(kāi)始就很明確所要檢索的Limits限制,以上三步其實(shí)可以合成一步完成。在此僅僅是為了方便說(shuō)明問(wèn)題,我們將其分開(kāi)描述。 例二
41、還是查找有關(guān)于"鋅對(duì)于兒童成長(zhǎng)的作用"的文獻(xiàn)。 如果當(dāng)我們進(jìn)行了很多檢索(包括上述的例一檢索)之后,我們發(fā)現(xiàn)在以前的檢索步驟中還有想要翻看的檢索的歷史,首先我們可以點(diǎn)擊Preview/Index按鈕。這時(shí)屏幕上將會(huì)顯示出我們檢索過(guò)的內(nèi)容。(fig2)使用History可以看到最近100次的查詢(xún)結(jié)果,而Preview顯示的是歷史記錄中最近的三條記錄。其次,輸入我們想要看的以前那次檢索過(guò)的檢索字,如"Zinc Infant Growth",點(diǎn)擊Preview按鍵,屏幕上則會(huì)顯示出以前檢索過(guò)"Zinc I
42、nfant Growth"的記錄。 如果我們要進(jìn)一步修改查詢(xún)方案,可以在檢索框內(nèi)加入另外的單詞,如"iron"等,點(diǎn)擊Preview。依此方法我們可以繼續(xù)加入另外的詞語(yǔ),點(diǎn)擊Preview直到你希望得到的內(nèi)容。使用這種功能可以幫助你看到以前的搜索方案與查詢(xún)結(jié)果的數(shù)量。 以上的兩個(gè)簡(jiǎn)單實(shí)例,說(shuō)明了如何應(yīng)用PubMed所提供的強(qiáng)大功能按鈕來(lái)提高我們的檢索效率。其實(shí)在實(shí)際應(yīng)用中還有很多技巧有待于我們?nèi)ヌ剿?,希望筆者的介紹能起到拋磚引玉的作用,幫助你在PubMed的海洋里自在地暢游
43、。- 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:36:00- 第六章 談MeSH Browser(醫(yī)學(xué)主題詞瀏覽器)何為MeSH? MeSH其實(shí)是Medical Subject Headings的縮略詞,即醫(yī)學(xué)主題詞,是用規(guī)范化的醫(yī)學(xué)術(shù)語(yǔ)來(lái)描述生物醫(yī)學(xué)概念。NIH的工作人員按MeSH詞表規(guī)定,瀏覽生物醫(yī)學(xué)期刊全文后標(biāo)引出每篇文獻(xiàn)中的MeSH主題詞,其中論述文獻(xiàn)中心的主題詞稱(chēng)主要主題詞(major topic headings),論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱(chēng)為
44、副主題詞。 那么為什么要使用醫(yī)學(xué)主題詞呢? 我們先來(lái)看個(gè)比喻,如果有人問(wèn)你感冒了嗎?你會(huì)不會(huì)回答"沒(méi)有啦,我只是有點(diǎn)著涼發(fā)燒而已"呢?當(dāng)然不會(huì),因?yàn)槟阒栏忻熬褪侵鴽霭l(fā)燒。但一個(gè)檢索系統(tǒng),如果你不告訴它的話(huà),它就有可能不知道這一點(diǎn)。在期刊中,對(duì)于同一個(gè)概念往往可能有不同的描述形式,如Tumor和Neoplasm都是指腫瘤。當(dāng)一個(gè)查詢(xún)者希望查閱腫瘤和diet(飲食)相關(guān)的文獻(xiàn)時(shí),他可能會(huì)輸入Tumor,也可能輸入Neoplasm作為關(guān)鍵字,但其實(shí)這兩者之間是沒(méi)有區(qū)別的。一個(gè)愚蠢的檢索系統(tǒng)可能就認(rèn)識(shí)不到這點(diǎn),而像PubMed這樣
45、的"智能化"檢索系統(tǒng)就能夠準(zhǔn)確的意識(shí)到這點(diǎn),從而不會(huì)造成檢索結(jié)果的遺漏。 如何使用 如果你希望使用醫(yī)學(xué)主題詞進(jìn)行檢索,可以從PubMed首頁(yè)上點(diǎn)擊PubMed Services下方的MeSH Browser即可進(jìn)入以下界面。 舉例說(shuō)明,如果你想要檢索Neoplasms和bone的相關(guān)文獻(xiàn),首先在MeSH Browser的檢索框內(nèi)輸入檢索詞Neoplasms,然后點(diǎn)擊Browse按鈕,系統(tǒng)顯示其定義及在樹(shù)狀等級(jí)結(jié)構(gòu)中的位置,如下圖。如果需要的話(huà),你可以選擇Detailed display,如同所示:
46、160; 在這里,檢索系統(tǒng)將顯示詳細(xì)的內(nèi)容,可選擇特定的副主題詞,也可進(jìn)行主要主題詞或單個(gè)主題詞檢索,其選項(xiàng)如下: (1)Add the search to the following subheadings:點(diǎn)擊副主題詞前的方框,表示選中該副主題詞,可連續(xù)選擇多個(gè)詞,它們之間的邏輯關(guān)系為OR。 (2)Restrict Search to Major Topic headings only:若將檢出結(jié)果限定在主要主題詞(Major Topic Heading)則可提高查準(zhǔn)率。
47、160; (3)Do Not Explode this term:系統(tǒng)要檢索某一主題詞時(shí),會(huì)自動(dòng)擴(kuò)展檢索(Explode),即將該主題詞的下位詞一并檢出。如果只需檢索單個(gè)主題詞,可點(diǎn)擊此按鈕。 完成上述選項(xiàng)后,點(diǎn)擊"Add"按鈕,稍后在下一屏Current Query的方框中將顯示所選的主題詞。 然后,我們?cè)僭贛eSH瀏覽器內(nèi)輸入bone, 按檢索按鈕,系統(tǒng)會(huì)告訴你bone不是一個(gè)主題詞,但它會(huì)自動(dòng)將其轉(zhuǎn)換成主題詞Bone and Bones, 同樣,其下方也會(huì)
48、顯示出其定義及在樹(shù)狀等級(jí)結(jié)構(gòu)中的位置。你一樣可以選擇Detailed display以便進(jìn)行更為精細(xì)的選擇,選擇完成后,點(diǎn)擊"Add"按鈕,則進(jìn)入下面的界面。這時(shí),你只需點(diǎn)擊PubMed Search按鈕即開(kāi)始檢索,查詢(xún)出用這兩個(gè)主題詞為關(guān)鍵字以及所選擇的相應(yīng)邏輯關(guān)系的文獻(xiàn)檢索結(jié)果。 總而言之,主題詞檢索法雖然稍嫌繁瑣,但其檢索結(jié)果的準(zhǔn)確性高,遺漏率低,是最佳的檢索方法,一旦熟練掌握,將使得我們的檢索工作事半功倍。- 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:36:00-
49、第七章 如何獲取全文 當(dāng)很多人開(kāi)始了解PubMed,并且逐漸得心應(yīng)手的時(shí)候,都會(huì)面臨一個(gè)棘手的問(wèn)題,即如何獲取全文?的確,PubMed真正向公眾(public)免費(fèi)開(kāi)放的只是摘要部分,而絕大部分文章都沒(méi)有全文提供。當(dāng)然,最省事最直截了當(dāng)?shù)淖龇ㄊ窃赑ubMed上花錢(qián)購(gòu)買(mǎi),但一篇文章動(dòng)輒十幾甚至幾十美金,使很多醫(yī)學(xué)工作者只好望而卻步。其實(shí),只要我們掌握一些技巧,還是有可能獲得一些文章的全文的。筆者查閱文獻(xiàn)數(shù)年,為獲取全文也做了不懈努力,積累了一些經(jīng)驗(yàn)供大家參考。一、PubMed PubMed上約有5的文獻(xiàn)
50、是可以免費(fèi)看到全文的,通常這些文獻(xiàn)的左上角會(huì)有一個(gè)Free Full Text的小標(biāo)記。你只要點(diǎn)擊這個(gè)圖標(biāo),系統(tǒng)就自動(dòng)鏈接入該文獻(xiàn)的全文。但有兩點(diǎn)值得注意的是,第一,很多時(shí)候,這個(gè)圖標(biāo)在PubMed處于顯示簡(jiǎn)要(summary)狀態(tài)下并不出現(xiàn),而只有在選擇顯示摘要(abstract)時(shí)才出現(xiàn)。因此,如果你不只是泛泛瀏覽,而希望看到全文的話(huà),我強(qiáng)烈建議你在display下拉菜單中選擇摘要(abstract)狀態(tài)。第二,有些時(shí)候,小圖標(biāo)上僅標(biāo)著Full Text,而并沒(méi)有Free字樣,但仍然可以鏈接入全文,你不妨試一試。二、免費(fèi)提供全文的期刊 天下沒(méi)有
51、免費(fèi)的午餐,這句老話(huà)也不一定正確。有些期刊就提供全文免費(fèi)檢索。比如著名的美國(guó)Science(科學(xué))雜志,以前國(guó)內(nèi)很多高校、研究所的資料室都流傳著Science雜志的影印本,印刷質(zhì)量低劣,而且有盜版之嫌。后來(lái)Science的老板充分理解到中國(guó)的國(guó)情,干脆順手做個(gè)人情,就與中國(guó)有關(guān)方面達(dá)成協(xié)議,使在中國(guó)大陸的讀者都可以在網(wǎng)上免費(fèi)看到Science的全文。 方法如下: (1)先登錄Science網(wǎng)址: 。注意,不是,否則你
52、得不到全文。 (2)點(diǎn)擊中間那個(gè)SEARCH按鈕,就進(jìn)入查詢(xún)頁(yè)了。你可以選擇簡(jiǎn)單檢索還是復(fù)雜檢索。 (3)輸入您要找的關(guān)鍵詞(不一定是MESH標(biāo)準(zhǔn)主題詞),再點(diǎn)擊search就可以了。 (4)找出文章后,點(diǎn)擊標(biāo)題后的Full Text,就可以瀏覽原文了。 除了Science, 其他一些期刊如美國(guó)科學(xué)院院報(bào)(PNAS),Genetics等都可以在網(wǎng)上獲取全文,甚至能夠下載文獻(xiàn)的pdf格式,這樣就和真正在期刊上
53、的排版形式一模一樣了。一般而言,那些相應(yīng)期刊的網(wǎng)址是以org為域名的,往往提供免費(fèi)的全文。例如上面提到的兩家期刊的網(wǎng)址就分別是: ; 。 這里,我特別推薦一個(gè)提供免費(fèi)全文的網(wǎng)站 High Wire Press。該網(wǎng)站號(hào)稱(chēng)擁有地球上最大最全的免費(fèi)的科學(xué)文獻(xiàn)全文數(shù)據(jù)庫(kù)。輸入網(wǎng)址/即可登錄該網(wǎng)站,首頁(yè)即列出幾個(gè)生物醫(yī)學(xué)相關(guān)欄目,包括: 1、生命科學(xué)(包含:生物化學(xué),細(xì)胞和分子生物學(xué) / 微生物學(xué)與病毒學(xué) /
54、免疫與免疫學(xué) / 神經(jīng)科學(xué)與神經(jīng)生物學(xué) / 生理學(xué) / 植物學(xué) / 其他生命科學(xué) /) 2、醫(yī)學(xué)(包含:心血管醫(yī)學(xué) / 臨床醫(yī)學(xué) / 精神病學(xué)與心理學(xué) / 醫(yī)學(xué)研究 /) 3、自然科學(xué) 以及其他科學(xué)欄目。 你可以在這些欄目中選擇自己需要的期刊。然后,你需要重點(diǎn)看一下該期刊后面的的說(shuō)明信息,尤其是提供免費(fèi)全文的方式,如 free ISSUES是在多長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)可以享受免費(fèi)索取原文,從5年到一個(gè)月不等。而 free TR
55、IAL 是在限定時(shí)間內(nèi),可以免費(fèi)提供原文。至于free SITE 則是可以完全免費(fèi)獲取全文的站點(diǎn)。 當(dāng)然,你也可以在檢索框內(nèi)輸入關(guān)鍵字,然后點(diǎn)擊首頁(yè)右上方的 Search all journals ,你就可以在所有的224種期刊里查找文獻(xiàn)了。不過(guò)由于所檢索到的結(jié)果僅僅局限于這200多種期刊,因此你一定要記住絕對(duì)不能用此網(wǎng)站來(lái)代替PubMed,來(lái) 了解所研究課題的最新進(jìn)展。我個(gè)人的建議是,先在PubMed上檢索,而僅以High Wire Press作為獲取全文的一個(gè)途徑而已。三、利用一些高校圖書(shū)館網(wǎng)站 國(guó)
56、內(nèi)一些高等院校,尤其是一些名牌高校的圖書(shū)館經(jīng)常和國(guó)外一些大的出版商簽訂協(xié)議,支付不菲的費(fèi)用,從而可以檢索并看到所有由這些出版商出版的期刊的全文。你可以就近到這些高校的圖書(shū)館的電子檢索廳去檢索,或者鏈接到大學(xué)圖書(shū)館的網(wǎng)站(如復(fù)旦大學(xué)圖書(shū)館的網(wǎng)址是),然后通過(guò)該網(wǎng)站的鏈接進(jìn)入相應(yīng)的檢索系統(tǒng)??上У氖牵瑥墓娋W(wǎng)到教育網(wǎng)之間的傳輸效率太低,很有可能等它等到你心痛,網(wǎng)頁(yè)還是猶抱琵琶半遮面。四、Free Medical Journals 與High Wire Press相似,該網(wǎng)站也提供了免費(fèi)各種可能搜集到的全文期刊的列表。網(wǎng)址是 在這里,除了英文期刊,你還能
57、檢索到一些小語(yǔ)種的期刊全文。方法是在這個(gè)網(wǎng)站的左面是導(dǎo)航條,點(diǎn)擊"Other Languages",里面有:法語(yǔ)、德語(yǔ)、加泰羅尼亞語(yǔ)、荷蘭語(yǔ)、希臘語(yǔ)、意大利語(yǔ)、挪威語(yǔ)、土耳其語(yǔ)、西班牙語(yǔ)和葡萄牙語(yǔ)等等。五、向作者索要 這種方法究竟效率如何,沒(méi)有人統(tǒng)計(jì)過(guò),不過(guò)在以上方法都沒(méi)有用時(shí)不妨試一試。你可以根據(jù)作者的Email地址給作者去封信,先把對(duì)方的文章大大的吹捧一番,說(shuō)它如何如何exciting,如何如何innovative,對(duì)自己的研究如何如何重要,然后說(shuō)自己目前無(wú)法access to the full text,最后非??锨械卣?qǐng)求
58、他能否通過(guò)email把全文寄來(lái)。這里,我有兩條重要的建議。第一,不要簡(jiǎn)單的套用所謂的書(shū)信模板,應(yīng)該多談一談你現(xiàn)在的研究?jī)?nèi)容以及對(duì)方的文章對(duì)自己的研究的重要性。這樣才有可能引起作者的興趣,不至于因?yàn)榍宦啥粚?duì)方直接刪除到垃圾箱里。我總結(jié)的另一個(gè)技巧是,向第一作者而不是通信作者要全文。為什么這樣說(shuō)呢?我們知道,一篇醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)往往有好幾個(gè)作者。文獻(xiàn)上有一個(gè)所謂的通信作者,通常是該實(shí)驗(yàn)室的老板。既然是老板,往往各種應(yīng)酬套磁自然頗多,每天email信箱里的信雜七雜八一大堆,他的私人秘書(shū)只會(huì)挑選出一些重要的信件,而那些明顯無(wú)關(guān)緊要的訊問(wèn)信件自然就遭受冷落了。而文獻(xiàn)的第一作者,即該實(shí)驗(yàn)的主要承擔(dān)者,應(yīng)酬不
59、會(huì)那么多,有email來(lái)訊問(wèn)或索取文獻(xiàn)也樂(lè)于答復(fù)。那么又如何知道第一作者的email地址呢?其實(shí)這很容易,你只要到PubMed上顯示出文獻(xiàn)摘要,上面亦包括作者的單位,然后從google上找到該單位網(wǎng)址,從網(wǎng)站上通常就不難查找到作者的通信方法。筆者就曾經(jīng)多次用這種方法獲取過(guò)全文,第一作者有一半以上都及時(shí)給予了答復(fù),而通信作者大部分都有如石沉大海。六、作者主頁(yè) 有些作者會(huì)在他們的個(gè)人主頁(yè)或?qū)嶒?yàn)室主頁(yè)上放上所發(fā)表論文的全文,你也可以去看看。我就曾經(jīng)為查找一篇文獻(xiàn)的全文嘗試了各種方法,最后竟然就在其作者的主頁(yè)上意外地發(fā)現(xiàn)了。大有踏破鐵鞋無(wú)覓處,得來(lái)全不費(fèi)工
60、夫之感覺(jué)。 當(dāng)然,盡管在網(wǎng)絡(luò)化生存的世界里,你也不要忘記最傳統(tǒng)的辦法,即到圖書(shū)館、資料室去查閱期刊文獻(xiàn),聞聞?dòng)∷⑵返奶厥庀阄叮雎?tīng)嘩嘩的翻頁(yè)聲,這些都是網(wǎng)絡(luò)世界中無(wú)法體驗(yàn)的獨(dú)特感受。- 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:37:00第八章 期刊瀏覽器、引文匹配器及其他瀏覽器的使用 在PubMed首頁(yè)P(yáng)ubMed Services下方,點(diǎn)擊Journal Browser按鈕即進(jìn)入期刊瀏覽器的界面。在檢索框中你可輸入刊名全稱(chēng)、MED
61、LINE 的期刊縮寫(xiě)或國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)期刊號(hào)(ISSN),然后點(diǎn)擊"Go"按鈕,便可獲得上述信息。此外通過(guò)journals with links to full-text web sites,便可鏈接入所有與PubMed建立鏈接的生物醫(yī)學(xué)期刊列表。這一期刊列表不斷更新,目前約有兩千六百多種,每一期刊后面列出其相應(yīng)的MEDLINE 標(biāo)準(zhǔn)縮寫(xiě)形式,這在當(dāng)你發(fā)表文章列參考文獻(xiàn)時(shí)還是很有用的。后面還可鏈接入期刊的全文,只是大多是收費(fèi)的。 同樣在PubMed首頁(yè)P(yáng)ubMed Services下方,還有Single Citation Matche
62、r(引文匹配器) 和Batch Citation Matcher。有不少人以為Citation Matcher(引文匹配器)只是一些輔助功能,甚至用了數(shù)年P(guān)ubMed也沒(méi)有嘗試去了解它。其實(shí)使用引文匹配器,絕對(duì)能夠大大提高你的工作效率。我舉一個(gè)最簡(jiǎn)單的例子。在查找文獻(xiàn)的過(guò)程中,我們可能每個(gè)人都遇到過(guò)下面的情形,如記得某篇文獻(xiàn)所發(fā)表的期刊和作者,但不太清楚它具體的標(biāo)題,或是隱約記得標(biāo)題中的某個(gè)詞和作者等等。這時(shí)候,當(dāng)然你可以嘗試用復(fù)雜檢索模式去搜索,但通常不容易準(zhǔn)確定位,而如果用Citation Matcher(引文匹配器)一切就可迎刃而解了。你在Citation Matcher界面中對(duì)應(yīng)的框內(nèi)
63、輸入你所知道的信息(見(jiàn)下圖),不知道的就空在那兒,然后按"search"按鈕就可以迅速得到結(jié)果,很少會(huì)有出入。需要特別說(shuō)明的是,作者姓名的格式一定要符合標(biāo)準(zhǔn),否則將會(huì)檢索不到結(jié)果。此外,如輸入Smith j將會(huì)同時(shí)檢索出Smith ja, Smith jb, Smith jc等等作者的文獻(xiàn),如果出現(xiàn)這種情況的話(huà),你應(yīng)該把Smith j置于引號(hào)中,即"Smith j",然后再進(jìn)行檢索就可以避免這種偏差了。 此外,當(dāng)你要投稿時(shí),一定會(huì)需要整理參考文獻(xiàn),使之格式符合相應(yīng)期刊的要求,一篇長(zhǎng)的論文往往可能有數(shù)十篇參考
64、文獻(xiàn),如果你手工輸入的話(huà),不僅費(fèi)時(shí)費(fèi)力,而且極易出錯(cuò),我勸你趕緊放棄這種吃力不討好的事情吧,在PubMed的引文匹配器,你只需隨意輸入已知的信息,便可以迅速獲得文獻(xiàn)的刊名、出版日期、卷、期、頁(yè)次、著者等,而且都是標(biāo)準(zhǔn)格式,只需拷貝粘貼過(guò)來(lái)就可以了。 Clinical Queries(臨床問(wèn)題) 這是專(zhuān)門(mén)為臨床醫(yī)生設(shè)計(jì)的搜索引擎,在Clinical Queries的主頁(yè)上列有臨床醫(yī)生常用的類(lèi)目,如therapy(治療)、diagnosis(診斷)etiology、(病因)和prognosis(預(yù)后)。檢索的方法并沒(méi)有什么特殊的
65、,只需在檢索框內(nèi)輸入檢索詞,然后點(diǎn)擊上述類(lèi)目即可。 Clinical Queries提供Sensitivity(檢出相關(guān)文獻(xiàn))和Specificity(檢出密切相關(guān)文獻(xiàn))兩種檢索方式。 需要特別說(shuō)明的是,Clinical Queries利用內(nèi)在的濾器使其檢索結(jié)果更加貼近臨床的需要,包括臨床的診療等。但如果你需要查閱的并不僅僅局限于臨床,也包括基礎(chǔ)研究,就不應(yīng)該使用這個(gè)檢索引擎。 作者:tianlanlan- 發(fā)布時(shí)間:2004-6-12 16:37:00-&
66、#160; 第九章 精確導(dǎo)航系統(tǒng)-談Limits用法 從一個(gè)擁有上千萬(wàn)篇文獻(xiàn)的檢索引擎上去查找某些文獻(xiàn),就好像是大海撈針。而PubMed 所提供的種種功能、服務(wù),目的正是為了方便我們能夠盡可能快速準(zhǔn)確的查找到所需要的文獻(xiàn)。Limits就是其中一個(gè)非常重要的功能鍵。我們?cè)谇懊娴母呒?jí)檢索技巧中曾經(jīng)簡(jiǎn)要的介紹 了Limits所包含的內(nèi)容,在這一章,你將會(huì)進(jìn)一步對(duì)Limits進(jìn)行全面詳盡的了解。 在PubMed首頁(yè)上的特征欄上,單擊"Limits"按鈕,進(jìn)入Limits設(shè)置界面,
67、如圖所示: 在這里,你可以限制你的文獻(xiàn)檢索結(jié)果,包括年齡組、性別、人類(lèi)或動(dòng)物學(xué)、文獻(xiàn)的語(yǔ)種、文獻(xiàn)類(lèi)型以及出版日期等等。你還可以進(jìn)行設(shè)定使檢索只在某一特定的數(shù)據(jù)庫(kù)子集內(nèi)進(jìn)行,例如艾滋病相關(guān)文獻(xiàn)或護(hù)理學(xué)期刊等等。顯而易見(jiàn)的是,如果能夠熟練的使用Limits功能,將會(huì)使你迅速找到目的文獻(xiàn),具備大海撈針的本領(lǐng)。 在詳細(xì)介紹Limits之前,需要說(shuō)明一點(diǎn)的是,必須確定在Limits按鈕前面的方框內(nèi)已經(jīng)打上鉤(見(jiàn)下圖),才表示你所設(shè)定Limits對(duì)檢索結(jié)果起作用。否則,你可不要抱怨為什么設(shè)置了Limits卻什么
68、效果也沒(méi)有。 如果需要的話(huà),你可以選擇Detailed display,如同所示: Field Selection 在這里,你可以把你的檢索條目限制于某一特定的區(qū)域,如文獻(xiàn)的作者,標(biāo)題等等。比如你或許會(huì)希望查找僅在標(biāo)題中含有你輸入的關(guān)鍵字的文獻(xiàn),那么你就選擇title區(qū)域。系統(tǒng)缺省將檢索所有的區(qū)域。 在Field Selection 左邊有一個(gè)可選框"Only Items with Abstra
69、cts",如果選中這個(gè)選項(xiàng),你便把檢索結(jié)果限定于那些擁有摘要的條目中。在PubMed, 1975年以前出版的文章是沒(méi)有摘要的,此外1975年以后的部分文章如Science上的不少文獻(xiàn)等也沒(méi)有摘要。(但利用 "如何獲取全文"一章中介紹的技巧,你便可以看到 Science的摘要乃至全文)。Publication Types 眾所周知,正式的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)形式多種多樣,如臨床試驗(yàn)報(bào)告,社論,通信,綜述等。你可以在此進(jìn)行設(shè)置,選擇特定的文章類(lèi)型,包括: Clinical Trial Editorial
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