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1、植物逆境應(yīng)答轉(zhuǎn)錄因子DREB的研究進(jìn)展 趙爽吉林師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院 四平 136000 指導(dǎo)教師:金太成摘要:DREB轉(zhuǎn)錄因子即干旱應(yīng)答元件結(jié)合蛋白質(zhì),能特異結(jié)合DRE/ CRT 順式作用元件,可以以非ABA 依賴的滲透脅迫信號(hào)的傳遞途徑調(diào)控大量逆境相關(guān)基因,在增強(qiáng)植物抗逆性中扮演重要角色。在本文中,我們總結(jié)了DREB結(jié)構(gòu)特征和表達(dá)調(diào)控,對(duì)于DREB植物耐非生物脅迫也作了簡(jiǎn)單介紹。關(guān)鍵詞:逆境應(yīng)答基因 ;DREB轉(zhuǎn)錄因子 ;植物抗逆性Research advance on plant stress responsive DREB transcription factors.Zhao Shu
2、angCollege of science, Jilin Normal University, Siping 136000, chinaInstructor:JIN Tai-chengAbstract:DREB transcription factors, specifically interacting with the dehydration-responsive element / C-repeat(DRE/CRT) cis-acting element, play an important role in plant tolerance to abiotic stress by con
3、trolling the expression of its downstream genes in an ABA-independent pathway. In this paper, we summarized the structural and expressional characteristics of DREB. Moreover, the application of DREB in plant tolerance to abiotic stresses were also briefly introduced.Keywords:Stress responsive gene D
4、REB transcription factor plant tolerance to abiotic stress干旱、低溫和土壤鹽漬化一直是制約農(nóng)作物生長發(fā)育和增產(chǎn)增收的主要逆境因子,又稱非生物脅迫因子。干旱可導(dǎo)致植物細(xì)胞失水,造成細(xì)胞膨壓完全喪失,,嚴(yán)重者甚至導(dǎo)致植物死亡。零下低溫使植物細(xì)胞間隙結(jié)冰,細(xì)胞內(nèi)水分不斷向胞間移動(dòng),造成細(xì)胞脫水,細(xì)胞質(zhì)濃縮,同時(shí)產(chǎn)生冰晶機(jī)械壓力,結(jié)果使植物失綠透明;融冰后出現(xiàn)水漬狀傷害,組織壞死。低溫也破壞了植物的正常代謝,減低了細(xì)胞間水分和有機(jī)物質(zhì)的運(yùn)輸以及根系的透水性,因而使植物萎蔫和壞死。高濃度鹽分特別是當(dāng)葉片中鹽分因蒸騰而濃縮時(shí),會(huì)對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生傷害。堿性
5、鹽主要是鎂、鈣、鈉的碳酸鹽,對(duì)根系有腐蝕作用。鈉離子過多會(huì)降低鈣、鎂的可給程度。因此,人們通過探討植物在各種不良環(huán)境條件下的抗逆機(jī)理,就可以采取相應(yīng)措施去減少逆境對(duì)植物的損害等。這些對(duì)于提高經(jīng)濟(jì)作物的產(chǎn)量具有重要意義。一直以來,有許多科研工作者都致力于植物遺傳育種改良的工作,目的是培育出抗逆性強(qiáng)的作物和植物品種來普遍提高和改善植物對(duì)逆境的抵抗和忍耐能力。然而,改善植物的抗逆性,單從傳統(tǒng)的遺傳育種已難以滿足現(xiàn)實(shí)的優(yōu)良抗逆品種的開發(fā)現(xiàn)狀,因此隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展以及一些植物遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)的建立,利用轉(zhuǎn)基因生物技術(shù)得到抗逆性強(qiáng)的植物來改進(jìn)植物抗逆性,已成為一條捷徑2,3。 近年來,科研工作者分離鑒
6、定的DREB(dehydration resistance element binding protein) 類轉(zhuǎn)錄因子是一類與抗逆相關(guān)的基因。它是AP2/EREBP 轉(zhuǎn)錄因子家族中的成員。DREB轉(zhuǎn)錄因子能夠特異地識(shí)別DRE(干旱應(yīng)答元件)順式作用元件并與之發(fā)生作用,從而激活植物體內(nèi)一系列逆境應(yīng)答基因的表達(dá)。1 AP2/ EREBP轉(zhuǎn)錄因子家族與.DREB 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)特征1.1 AP2/ EREBP 轉(zhuǎn)錄因子家族轉(zhuǎn)錄因子是一種具有特殊結(jié)構(gòu)、行使調(diào)控基因表達(dá)功能的蛋白質(zhì)分子,也稱為反式作用因子。它是轉(zhuǎn)錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉(zhuǎn)錄因子時(shí)處于不表達(dá)狀態(tài),RNA聚合
7、酶自身無法啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄,只有當(dāng)轉(zhuǎn)錄因子(蛋白質(zhì))結(jié)合在其識(shí)別的DNA序列上后,基因才開始表達(dá)。研究還表明植物的抗逆性轉(zhuǎn)錄因子偏向在根部表達(dá),或在根部表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子往往是與抗逆性有關(guān)的4 。在擬南芥中,3個(gè)最大的轉(zhuǎn)錄因子家族是AP2/EREBP,Myb-(R1)R2R3和BHLH家族,每種大約占總轉(zhuǎn)錄因子數(shù)的9%。 擬南芥基因組編碼至少1 533種轉(zhuǎn)錄因子,大約占其總基因數(shù)的5.9%5。植物中存在的轉(zhuǎn)錄因子中,有相當(dāng)一部分與抗逆性有關(guān),例如:DREB。有些轉(zhuǎn)錄因子能被幾種脅迫誘導(dǎo),例如:ABA、高滲、低溫、衰老都可以誘導(dǎo)AtMyb2轉(zhuǎn)錄因子。50%以上的一致或預(yù)測(cè)再根部特異性表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子都能由
8、這樣或那樣的脅迫所誘導(dǎo)。此轉(zhuǎn)錄因子家族為植物所特有,至少有144個(gè)成員。可以根據(jù)AP2/EREBP域的數(shù)目將其分為兩類:一、含兩個(gè)AP2/EREBP域,包括AP2、AINTEGUME、NTA和Glossy15;二、含一個(gè)AP2/EREBP域,包括EREBPS、TINY、DREBs、AtEBP。DREB 轉(zhuǎn)錄因子屬于AP2/ EREBP 轉(zhuǎn)錄因子家族。 A P2/EREBP等這些轉(zhuǎn)錄因子主要參與植物的細(xì)胞周期、生長發(fā)育以及生物和非生物脅迫相關(guān)的基因的表達(dá)調(diào)控,它們都含有非常保守的DNA結(jié)合區(qū),即AP2/EREBP結(jié)構(gòu)域,有60個(gè)左右的氨基酸殘基組成,起核定位信號(hào)的作用。Reichmann等人分析
9、了A. thaliana荃因組全序列,發(fā)現(xiàn)有144個(gè)AP2/EREBP型轉(zhuǎn)錄因子,并根據(jù)含DNA結(jié)合區(qū)的數(shù)目分為三個(gè)亞族: RAV亞族,有2個(gè)不同的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,AP2/EREBP結(jié)構(gòu)域和B3結(jié)構(gòu)域,共有6個(gè)成員; EREBP亞族,僅含1個(gè)AP2/EREBP結(jié)構(gòu)域,共有124個(gè)成員,主要參與調(diào)控植物對(duì)激素(乙烯)、病原、干早、高鹽和低溫等脅迫應(yīng)答反應(yīng)以及AP2(APETALA2)亞族,有2個(gè)AP2/EREBP結(jié)構(gòu)域,共有14個(gè)成員,主要參與調(diào)節(jié)細(xì)胞的生長發(fā)育。Sakuma等人分析At liana基因組全序列,發(fā)現(xiàn)有145個(gè)AP2/EREBP型轉(zhuǎn)錄因子,并進(jìn)一步將其分為5個(gè)亞族:AP2亞族,
10、RAV亞族,DREB亞族,ERF亞族和AL079349。蛋白 質(zhì) 三 維分析表明,AP2/EREBP結(jié)構(gòu)域含有3個(gè)一折疊,對(duì)識(shí)別順式作用元件起關(guān)鍵作用。其中位于第二個(gè)一折疊中的第14和19位的兩個(gè)氨基酸殘基決定了轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的特異性。AP2/ EREBP 家族轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)如圖1 所示。圖1 AP2/ EREBP 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)示意Figure 1 AP2 / EREBP transcription factors indicate1.2 DREB因子的結(jié)構(gòu)特征DREB 轉(zhuǎn)錄因子含有一個(gè)保守的AP2/EREBP 結(jié)構(gòu)域、酸性轉(zhuǎn)錄激活區(qū)和堿性核定位信號(hào)區(qū)。它一般由核定位信號(hào)區(qū)、DNA 結(jié)合區(qū)、寡聚
11、化位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)4 個(gè)功能區(qū)域組成。DREB 屬于AP2/ EREBP 轉(zhuǎn)錄因子家族。其中 ,AP2PEREBP 結(jié)構(gòu)域是由大約60個(gè)氨基酸殘基組成的高度保守區(qū)6,7。AP2/ EREBP 結(jié)構(gòu)域由60 個(gè)左右的保守氨基酸殘基組成,位于第14 位的纈氨酸和第19 位的谷氨酸對(duì)轉(zhuǎn)錄因子與順式元件的結(jié)合至關(guān)重要(圖2) 8 。圖2DREB蛋白AP2/ EREBP 結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列比對(duì)分析Figure 2Amino acid sequence alignment of conserved AP2/ EREBP domain of DREB proteinsAP2/ EREBP 轉(zhuǎn)錄因子家族典型特
12、征是DNA 結(jié)合區(qū)均為由5770 個(gè)氨基酸殘基組成的AP2/ EREBP 保守結(jié)構(gòu)域。Liu 等9利用One-Hybrid System從擬南芥中分離到5個(gè)AP2/EREBP類轉(zhuǎn)錄因子基因,分別屬于兩個(gè)亞族。分別命名為DREB1、DREB1B、DREB1C、和DREB2A、DREB2B。2 DREB轉(zhuǎn)錄因子DREB在應(yīng)用方面研究進(jìn)展2.1DREB 轉(zhuǎn)錄因子在植物抗逆中的作用擬南芥DR EB1/ CB F 基因能夠誘導(dǎo)靶基因的表達(dá),從而提高轉(zhuǎn)基因煙草和蕓薹植物對(duì)低溫、干旱和氧脅迫的耐性10 。在擬南芥中過表達(dá)OsDR EB1A 基因,提高了轉(zhuǎn)基因植物對(duì)高鹽和低溫的耐性11 。玉米DR EB1 類
13、基因ZmDR EB1A 參與調(diào)控低溫應(yīng)答基因的表達(dá),提高了擬南芥對(duì)干旱和低溫脅迫的耐性12 。Xue等13,14 從大麥中分離到兩個(gè)CBF/ DREBl 類轉(zhuǎn)錄因子,分別命名為HvCBFl 和HvCBF2 ,它們的表達(dá)均特異性地受到低溫的誘導(dǎo),并均具有反式激活能力。Xue等15 在2004 年報(bào)道從大麥中克隆到另一與DRE結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,命名為HvDRFl ,他們發(fā)現(xiàn)該基因的表達(dá)受干旱、高鹽脅迫和外源ABA 的誘導(dǎo),并且在胚中和籽粒成熟時(shí)期表達(dá)量升高。2.2rd29A因子DREB轉(zhuǎn)錄因子自被發(fā)現(xiàn)以來,很受人們的關(guān)注。有很多的科研工作者通過進(jìn)一步的研究,逐步的發(fā)現(xiàn)了更多的與植物抗性有關(guān)的轉(zhuǎn)錄基因
14、。如圖表1。有人將DREB2A及DREB2A CA的cDNA序列置于35S啟動(dòng)子轉(zhuǎn)入到擬南芥中,發(fā)現(xiàn)了在非脅迫條件下DREB2A CA轉(zhuǎn)基因植株中基因的表達(dá)量明顯高于DREB2A轉(zhuǎn)基因植株,但是前者的轉(zhuǎn)基因植株都出現(xiàn)了矮化的現(xiàn)象。使用了rd29A啟動(dòng)子以后,植株的矮化現(xiàn)象便會(huì)消除。有的基因在低溫或干早誘導(dǎo)下的表達(dá)需要ABA基因,有的基因就不需要ABA基因。比如說擬南芥的水分脅迫基因rd29B,就是一個(gè)依賴于ABA表達(dá)的基因。干早誘導(dǎo)型基因rd29A16在逆境下的表達(dá)式不需要ABA的參與的。Rd29A啟動(dòng)子區(qū)的序列為TACCGACAT。,在rd29A 基因的啟動(dòng)子區(qū)域含有2個(gè)20bp的正向重復(fù)序
15、列。核心序列為CCGA。表1 功能已被鑒定的DREB基因Table1: Functiom of DREB genes have been identified2.3 DREB 轉(zhuǎn)錄因子應(yīng)用前景的展望DREB 轉(zhuǎn)錄因子是一類與應(yīng)答植物干旱、高鹽和低溫逆境脅迫相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子,參與植物非ABA 依賴的滲透脅迫信號(hào)的傳遞途徑。雖然對(duì)的研究己經(jīng)取得了不少進(jìn)展, 對(duì)轉(zhuǎn)錄因子在逆境中的表達(dá)方式和調(diào)控機(jī)制有了一定程度的了解, 但依然存在許多問題有待進(jìn)一步研究。目前有關(guān)DREB 類抗逆境轉(zhuǎn)錄因子的功能及轉(zhuǎn)錄調(diào)控的研究大部分來自擬南芥,但有很多的問題有待人們?nèi)ラ_發(fā),去研究,去解決。比如說, 對(duì)于上游調(diào)控基因的研究
16、還有待加強(qiáng)。再比如: DREB 類轉(zhuǎn)錄因子基因家族的成員是否和相同的順式元件結(jié)合或控制相同基因的表達(dá)等。我們中國是世界上人口最多的國家,從長期的和戰(zhàn)略的角度看,確保我國的糧食產(chǎn)量,保證我國糧食安全的根本出路在于不斷推進(jìn)農(nóng)業(yè)的科技進(jìn)步。站在全人類的角度,世界人口也在的迅速增長。還有,由于氣候、土壤等多種條件的限制,很多地區(qū)都無法大規(guī)模種植糧食作物;同時(shí),自然災(zāi)害如突發(fā)性低溫天氣等也使糧食產(chǎn)量遭到巨大損失。比如說現(xiàn)在我國的云南省昆明市,全市受旱作物面積達(dá)84.7千公頃,已造成49萬余人、24萬余頭大牲畜飲水困難,庫塘蓄水與去年同期相比少蓄3.6億立方米。未來旱情發(fā)展范圍和程度將進(jìn)一步加深,將對(duì)農(nóng)業(yè)
17、生產(chǎn)小春作物生產(chǎn)和春耕春播用水產(chǎn)生嚴(yán)重影響,抗旱形勢(shì)十分嚴(yán)峻。 因此,提高植物的抗逆性對(duì)于培育抗逆作物新品種,提高作物產(chǎn)量具有重要的意義17。 參考文獻(xiàn) 1 Bray E A. Plant responses to water deficit J. Trends Plant Sci,1997,2:48-54.2 Holmberg N, Bulow L. Improving stresses tolerance in plants by gene transfer J.Trends Plant science,1998, (3):61-66.3Liu Q, Zhao N M, Yamaguchi
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21、 drought-and low-temperature-responsive gene expression, respectively,in ArabidopsisJ . Plant Cell , 1998 , 10 : 1391-14069Liu Q, Kasuga M,Sakuma Y,et al.Two transcription factors,DREB1 and DREB2,with an EREBP/AP2 DNA-binding domain separate two cellular signal transduction pathways in drought - and
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